RNA–Protein interactions for RNA: YLR467W

YRF1-5, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-5, Length 5,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5YLR467W UBP12P39538 1254 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W COG6P53959 839 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W ALO1P54783 526 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W MRE11P32829 692 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W ADA2Q02336 434 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W HMI1Q12039 706 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W MEC3Q02574 474 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W FAR8Q05040 523 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W LPD1P09624 499 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W PWP1P21304 576 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W STR2P47164 639 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W DSL1P53847 754 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W ERG5P54781 538 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W CCT2P39076 527 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W ATG17Q06410 417 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W TAF10Q12030 206 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W TOA1P32773 286 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W NDL1Q06568 189 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W CPR6P53691 371 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-5YLR467W TDA11P38854 504 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RTC4P53850 401 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W ESF2P53743 316 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W TRS120Q04183 1289 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W EST2Q06163 884 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W PDB1P32473 366 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W CBF2P32504 956 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W ASI1P54074 624 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SEY1Q99287 776 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RPC82P32349 654 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data8.33□□□□□ -1.08 RIP-Chip
YRF1-5YLR467W AIM20P40451 204 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RPC17P47076 161 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W GLE1Q12315 538 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W MPH3P0CE00 602 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W VAN1P23642 535 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W VPS53P47061 822 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W TFB2Q02939 513 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W STE13P33894 931 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W DCS2Q12123 353 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W TOM70P07213 617 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YET1P35723 206 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RPN10P38886 268 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W OPI1P21957 404 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SEC66P33754 206 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W IAH1P41734 238 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SLP1Q12232 587 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W OM45P16547 393 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W ALE1Q08548 619 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W UBP6P43593 499 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W TYR1P20049 452 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W VTI1Q04338 217 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W POL3P15436 1097 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SMY1P32364 656 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W MET4P32389 672 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W GCN20P43535 752 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W UME1Q03010 460 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W BUG1Q12191 341 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W OAF3P36023 863 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W FES1P38260 290 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W VHS3Q08438 674 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SLA1P32790 1244 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W LHS1P36016 881 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W ECM4P36156 370 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W ZDS2P54786 942 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W GNT1Q12096 491 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SUI3P09064 285 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W REC107P21651 314 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W MCM4P30665 933 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W JNM1P36224 373 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W PTC4P38089 393 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YML119WQ03208 357 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W GTB1Q04924 702 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W BMH1P29311 267 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W DSF2P38213 736 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W BOP3P53958 396 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SMC1P32908 1225 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W MET1P36150 593 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W VID27P40157 782 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YPL109CQ02981 657 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YDR306CQ06640 478 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YLR001CQ07895 862 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W SPO12P17123 173 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W NIP100P33420 868 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W NOP9P47077 666 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W PRP43P53131 767 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W DPL1Q05567 589 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W YLL054CQ12244 843 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-5YLR467W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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