RNA–Protein interactions for RNA: YGL006W

PMC1, Transcript of Vacuolar Ca2+ ATPase involved in depleting cytosol of Ca2+ ions, yeast

Gene PMC1, Length 3,522 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMC1	YGL006W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	DCS2	Q12123	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	RAD57	P25301	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	CNS1	P33313	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	EFM2	P38347	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MRX1	P40050	688 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	IES1	P43579	692 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	ALF1	P53904	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	ADA2	Q02336	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	ATG13	Q06628	738 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SLP1	Q12232	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	RER2	P35196	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MET1	P36150	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MAL13	P53338	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PMR1	P13586	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	OM45	P16547	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	GAL11	P19659	1081 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	NUF2	P33895	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	UBX4	P54730	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	CTF4	Q01454	927 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	RMT2	Q03305	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YKU80	Q04437	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	HMI1	Q12039	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	NIP100	P33420	868 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	EPS1	P40557	701 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	VTC2	P43585	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	GYP5	Q12344	894 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	POL3	P15436	1097 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MRPS28	P21771	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	NPL6	P32832	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	VPS4	P52917	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	HDA1	P53973	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	UFD2	P54860	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	VPS72	Q03388	795 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MMR1	Q06324	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	OAF3	P36023	863 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YBP1	P38315	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SPR3	P41901	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PLP2	Q12017	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	NUR1	Q12066	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	CDC11	P32458	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	EFM4	P40516	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YIR042C	P40586	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	BTN2	P53286	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	DMA2	P53924	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	MFM1	Q02783	413 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	TFB2	Q02939	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	ATP25	Q03153	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	ALR1	Q08269	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	APL1	P27351	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SIT1	P39980	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	BUD16	P39988	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	BRO1	P48582	844 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	YLH47	Q06493	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	OPY2	Q06810	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	IOC2	Q12072	812 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	SLM3	Q12093	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PMC1	YGL006W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	SEC66	P33754	206 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	STE13	P33894	931 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	YBR062C	P38239	180 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	YSW1	P38280	609 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	MAD1	P40957	749 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	MAK10	Q02197	733 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PMC1	YGL006W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.4 ms