RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 ARAP1Q96P48 1450 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP1A2P50993 1020 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 COPS2P61201 443 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 MSS51Q4VC12 460 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM50Q86XT4 487 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 OGFOD1Q8N543 542 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 ADAM32Q8TC27 787 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 NOD1Q9Y239 953 aa6.74□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP2B4P23634 1241 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 SSFA2P28290 1259 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 DPYDQ12882 1025 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 AGERQ15109 404 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.73□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.72□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.72□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.72□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.72□□□□□ -1.33
CYCSP28-201ENST00000534284 PSME1Q06323 249 aa6.71□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.71□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.71□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.71□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.71□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 MMP16P51512 607 aa6.7□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.7□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.7□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.69□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.69□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SERPINB4P48594 390 aa6.69□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CLDN10P78369 228 aa6.69□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.69□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.69□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 PRMT3O60678 531 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 ABL1P00519 1130 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 GTF2IP78347 998 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF20Q5VTR2 975 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 TIAM1Q13009 1591 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 IGF1RP08069 1367 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CUL7Q14999 1698 aa6.68□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 POTECB2RU33 542 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 TLL1O43897 1013 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 ADH1BP00325 375 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 ERCC3P19447 782 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SEC13P55735 322 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 MYT1Q01538 1121 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SIRT1Q96EB6 747 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SLAIN2Q9P270 581 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 ZPR1O75312 459 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC102BQ68D86 513 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 HINFPQ9BQA5 517 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SCNN1AP37088 669 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 USP4Q13107 963 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 NEUROD1Q13562 356 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 LINC01559Q495D7 138 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SIX5Q8N196 739 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 BAP1Q92560 729 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP28-201ENST00000534284 SFI1A8K8P3 1242 aa6.64□□□□□ -1.35
CYCSP28-201ENST00000534284 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.64□□□□□ -1.35
CYCSP28-201ENST00000534284 ERFEQ4G0M1 354 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms