RNA–Protein interactions for RNA: YLR368W

MDM30, Transcript of F-box component of an SCF ubiquitin protein ligase complex, yeastyeast

Gene MDM30, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM30YLR368W YKL222CP35995 705 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W ERP5P38819 212 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W CCT3P39077 534 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W NDE1P40215 560 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W CLA4P48562 842 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W RGA2Q06407 1009 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W MDM38Q08179 573 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W YPL191CQ08930 360 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W TUF1P02992 437 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W PET123P17558 318 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W RRN3P36070 627 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W BYE1P36106 594 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W OTU2P38747 307 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W ETP1P38748 585 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W CRP1P38845 465 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W YER034WP40022 185 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W ARB1P40024 610 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W AIR1P40507 360 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W TUB4P53378 473 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W SWA2Q06677 668 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W NYV1Q12255 253 aa4.91□□□□□ -1.62
MDM30YLR368W MRPL25P23369 157 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PGS1P25578 521 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SWC3P31376 625 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W TBS1P38114 1094 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PAF1P38351 445 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YHL050CP38721 697 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YHR219WP38900 624 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W IRR1P40541 1150 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data4.9□□□□□ -1.63not detected
MDM30YLR368W HUL5P53119 910 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PNG1Q02890 363 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RAD33Q04231 177 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W AGE1Q04412 482 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YDR286CQ05530 114 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W HMI1Q12039 706 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W GLE1Q12315 538 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YOR131CQ12486 218 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RKM4Q12504 494 aa4.9□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ENO2P00925 437 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SEC23P15303 768 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PHO84P25297 587 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W GFD2P25370 566 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SMY1P32364 656 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data4.89□□□□□ -1.63not detected
MDM30YLR368W POP2P39008 433 aa4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ZDS2P54786 942 aa4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YOR389WQ08912 624 aa4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W WHI5Q12416 295 aa4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W DPH6Q12429 685 aa4.89□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PIF1P07271 859 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SRM1P21827 482 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SAP185P40856 1058 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W THI12P42883 340 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W THI5P43534 340 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W THI11P47183 340 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W BDF2Q07442 638 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W THI13Q07748 340 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ALR1Q08269 859 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YVC1Q12324 675 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W HMG1P12683 1054 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MSH3P25336 1018 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W HIR1P32479 840 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SIC1P38634 284 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PAC1P39946 494 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YTA6P40328 754 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W VTC2P43585 828 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SET2P46995 733 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YJL049WP47048 450 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W KXD1P53158 218 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YNL050CP53952 270 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SPC19Q03954 165 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SND1Q04007 877 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W COG8Q04632 607 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MRX10Q05648 414 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YLH47Q06493 454 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W PMT7Q06644 662 aa4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W ENO1P00924 437 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MSH2P25847 964 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W MRE11P32829 692 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W YKL100CP34248 587 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RTT105P40063 208 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W SDS3P40505 327 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W GCD10P41814 478 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W EMP47P43555 445 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RIM21P48565 533 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W RPA14P50106 137 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data4.87□□□□□ -1.63not detected
MDM30YLR368W SNZ1Q03148 297 aa4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MDM30YLR368W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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