Protein–RNA interactions for Protein: P39008

POP2, Poly(A) ribonuclease POP2, yeastyeast

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP2P39008 NSR1YGR159C 1245 nt17.09■□□□□ 0.33
POP2P39008 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.92■□□□□ 0.3
POP2P39008 NOP1YDL014W 984 nt16.32■□□□□ 0.2
POP2P39008 MDJ1YFL016C 1536 nt15.48■□□□□ 0.07
POP2P39008 YKL036CYKL036C 393 nt14.74□□□□□ -0.05
POP2P39008 YJL027CYJL027C 417 nt14.28□□□□□ -0.12
POP2P39008 SRX1YKL086W 384 nt14.23□□□□□ -0.13
POP2P39008 Q0297Q0297 156 nt14.14□□□□□ -0.15
POP2P39008 DBP2YNL112W 1641 nt13.53□□□□□ -0.24
POP2P39008 YCR051WYCR051W 669 nt13.52□□□□□ -0.25
POP2P39008 YBR190WYBR190W 312 nt13.28□□□□□ -0.28
POP2P39008 SCS3YGL126W 1143 nt13.22□□□□□ -0.29
POP2P39008 Q0182Q0182 405 nt13.06□□□□□ -0.32
POP2P39008 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.04□□□□□ -0.32
POP2P39008 RTC3YHR087W 336 nt13.02□□□□□ -0.33
POP2P39008 CCC1YLR220W 969 nt12.99□□□□□ -0.33
POP2P39008 YOL085CYOL085C 342 nt12.78□□□□□ -0.36
POP2P39008 RPP1BYDL130W 321 nt12.7□□□□□ -0.38
POP2P39008 RVS167YDR388W 1449 nt12.7□□□□□ -0.38
POP2P39008 PKP1YIL042C 1185 nt12.65□□□□□ -0.38
POP2P39008 SSA3YBL075C 1950 nt12.61□□□□□ -0.39
POP2P39008 SCJ1YMR214W 1134 nt12.51□□□□□ -0.41
POP2P39008 SSA1YAL005C 1929 nt12.48□□□□□ -0.41
POP2P39008 PUT4YOR348C 1884 nt12.29□□□□□ -0.44
POP2P39008 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.26□□□□□ -0.45
POP2P39008 PET122YER153C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
POP2P39008 SHR5YOL110W 714 nt12.15□□□□□ -0.46
POP2P39008 MOT3YMR070W 1473 nt12.12□□□□□ -0.47
POP2P39008 URN1YPR152C 1398 nt12.04□□□□□ -0.48
POP2P39008 SCR1SCR1 522 nt11.98□□□□□ -0.49
POP2P39008 ARE1YCR048W 1833 nt11.97□□□□□ -0.49
POP2P39008 DEP1YAL013W 1218 nt11.96□□□□□ -0.49
POP2P39008 SAH1YER043C 1350 nt11.94□□□□□ -0.5
POP2P39008 POA1YBR022W 534 nt11.94□□□□□ -0.5
POP2P39008 FPS1YLL043W 2010 nt11.94□□□□□ -0.5
POP2P39008 OPI9YLR338W 858 nt11.91□□□□□ -0.5
POP2P39008 YDJ1YNL064C 1230 nt11.85□□□□□ -0.51
POP2P39008 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.84□□□□□ -0.51
POP2P39008 RRN5YLR141W 1092 nt11.82□□□□□ -0.52
POP2P39008 RPN10YHR200W 807 nt11.78□□□□□ -0.52
POP2P39008 ATS1YAL020C 1002 nt11.75□□□□□ -0.53
POP2P39008 YNL208WYNL208W 600 nt11.72□□□□□ -0.53
POP2P39008 BSC6YOL137W 1494 nt11.7□□□□□ -0.54
POP2P39008 GAR1YHR089C 618 nt11.68□□□□□ -0.54
POP2P39008 BUD23YCR047C 828 nt11.58□□□□□ -0.56
POP2P39008 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.57□□□□□ -0.56
POP2P39008 PUN1YLR414C 792 nt11.57□□□□□ -0.56
POP2P39008 PTC2YER089C 1395 nt11.51□□□□□ -0.57
POP2P39008 RSB1YOR049C 1065 nt11.48□□□□□ -0.57
POP2P39008 YJR018WYJR018W 363 nt11.47□□□□□ -0.57
POP2P39008 NVJ2YPR091C 2313 nt11.43□□□□□ -0.58
POP2P39008 NAB2YGL122C 1578 nt11.38□□□□□ -0.59
POP2P39008 SPT5YML010W 3192 nt11.32□□□□□ -0.6
POP2P39008 TIR1YER011W 765 nt11.28□□□□□ -0.6
POP2P39008 PAC11YDR488C 1602 nt11.2□□□□□ -0.62
POP2P39008 FPR4YLR449W 1179 nt11.2□□□□□ -0.62
POP2P39008 RPM1RPM1 483 nt11.2□□□□□ -0.62
POP2P39008 DAL1YIR027C 1383 nt11.16□□□□□ -0.62
POP2P39008 RPP2BYDR382W 333 nt11.16□□□□□ -0.62
POP2P39008 YJR120WYJR120W 351 nt11.16□□□□□ -0.62
POP2P39008 FIS1YIL065C 468 nt11.14□□□□□ -0.63
POP2P39008 SSA4YER103W 1929 nt11.11□□□□□ -0.63
POP2P39008 INM2YDR287W 879 nt11.11□□□□□ -0.63
POP2P39008 PHO4YFR034C 939 nt11.05□□□□□ -0.64
POP2P39008 MEP2YNL142W 1500 nt11.01□□□□□ -0.65
POP2P39008 YPS1YLR120C 1710 nt10.95□□□□□ -0.66
POP2P39008 SRB2YHR041C 633 nt10.94□□□□□ -0.66
POP2P39008 PST2YDR032C 597 nt10.93□□□□□ -0.66
POP2P39008 YBL100CYBL100C 315 nt10.93□□□□□ -0.66
POP2P39008 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.89□□□□□ -0.67
POP2P39008 BDH2YAL061W 1254 nt10.85□□□□□ -0.67
POP2P39008 DCW1YKL046C 1350 nt10.84□□□□□ -0.67
POP2P39008 YDR095CYDR095C 411 nt10.82□□□□□ -0.68
POP2P39008 FUN26YAL022C 1554 nt10.79□□□□□ -0.68
POP2P39008 WWM1YFL010C 636 nt10.74□□□□□ -0.69
POP2P39008 TRM9YML014W 840 nt10.74□□□□□ -0.69
POP2P39008 ALF1YNL148C 765 nt10.74□□□□□ -0.69
POP2P39008 EMI2YDR516C 1503 nt10.7□□□□□ -0.7
POP2P39008 FRE6YLL051C 2139 nt10.69□□□□□ -0.7
POP2P39008 BDF1YLR399C 2061 nt10.69□□□□□ -0.7
POP2P39008 YMR090WYMR090W 684 nt10.68□□□□□ -0.7
POP2P39008 LSM3YLR438C-A 270 nt10.65□□□□□ -0.7
POP2P39008 RPP2AYOL039W 321 nt10.64□□□□□ -0.71
POP2P39008 PTP1YDL230W 1008 nt10.61□□□□□ -0.71
POP2P39008 CAC2YML102W 1407 nt10.6□□□□□ -0.71
POP2P39008 CCT6YDR188W 1641 nt10.59□□□□□ -0.71
POP2P39008 YBR220CYBR220C 1683 nt10.59□□□□□ -0.71
POP2P39008 YDL221WYDL221W 552 nt10.58□□□□□ -0.72
POP2P39008 SHU1YHL006C 453 nt10.57□□□□□ -0.72
POP2P39008 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.56□□□□□ -0.72
POP2P39008 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.56□□□□□ -0.72
POP2P39008 YGR021WYGR021W 873 nt10.55□□□□□ -0.72
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