Protein–RNA interactions for Protein: Q04231

RAD33, DNA repair protein RAD33, yeastyeast

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAD33Q04231 NSR1YGR159C 1245 nt19.47■□□□□ 0.71
RAD33Q04231 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.3■□□□□ 0.68
RAD33Q04231 NOP1YDL014W 984 nt18.61■□□□□ 0.57
RAD33Q04231 MDJ1YFL016C 1536 nt17.62■□□□□ 0.41
RAD33Q04231 YKL036CYKL036C 393 nt16.86■□□□□ 0.29
RAD33Q04231 SRX1YKL086W 384 nt16.27■□□□□ 0.2
RAD33Q04231 YJL027CYJL027C 417 nt16.22■□□□□ 0.19
RAD33Q04231 Q0297Q0297 156 nt16.2■□□□□ 0.18
RAD33Q04231 DBP2YNL112W 1641 nt15.46■□□□□ 0.06
RAD33Q04231 YCR051WYCR051W 669 nt15.4■□□□□ 0.06
RAD33Q04231 SCS3YGL126W 1143 nt15.17■□□□□ 0.02
RAD33Q04231 YBR190WYBR190W 312 nt15.11■□□□□ 0.01
RAD33Q04231 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.92□□□□□ -0.02
RAD33Q04231 CCC1YLR220W 969 nt14.75□□□□□ -0.05
RAD33Q04231 RTC3YHR087W 336 nt14.74□□□□□ -0.05
RAD33Q04231 YOL085CYOL085C 342 nt14.62□□□□□ -0.07
RAD33Q04231 RPP1BYDL130W 321 nt14.53□□□□□ -0.08
RAD33Q04231 PKP1YIL042C 1185 nt14.44□□□□□ -0.1
RAD33Q04231 RVS167YDR388W 1449 nt14.43□□□□□ -0.1
RAD33Q04231 SCJ1YMR214W 1134 nt14.31□□□□□ -0.12
RAD33Q04231 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14□□□□□ -0.17
RAD33Q04231 PUT4YOR348C 1884 nt13.98□□□□□ -0.17
RAD33Q04231 PET122YER153C 765 nt13.93□□□□□ -0.18
RAD33Q04231 SHR5YOL110W 714 nt13.86□□□□□ -0.19
RAD33Q04231 SSA3YBL075C 1950 nt13.85□□□□□ -0.19
RAD33Q04231 URN1YPR152C 1398 nt13.69□□□□□ -0.22
RAD33Q04231 SCR1SCR1 522 nt13.66□□□□□ -0.22
RAD33Q04231 ARE1YCR048W 1833 nt13.62□□□□□ -0.23
RAD33Q04231 DEP1YAL013W 1218 nt13.58□□□□□ -0.24
RAD33Q04231 OPI9YLR338W 858 nt13.57□□□□□ -0.24
RAD33Q04231 SAH1YER043C 1350 nt13.56□□□□□ -0.24
RAD33Q04231 YDJ1YNL064C 1230 nt13.55□□□□□ -0.24
RAD33Q04231 POA1YBR022W 534 nt13.51□□□□□ -0.25
RAD33Q04231 RRN5YLR141W 1092 nt13.49□□□□□ -0.25
RAD33Q04231 ATS1YAL020C 1002 nt13.48□□□□□ -0.25
RAD33Q04231 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.46□□□□□ -0.25
RAD33Q04231 RPN10YHR200W 807 nt13.4□□□□□ -0.26
RAD33Q04231 YNL208WYNL208W 600 nt13.33□□□□□ -0.28
RAD33Q04231 BSC6YOL137W 1494 nt13.29□□□□□ -0.28
RAD33Q04231 GAR1YHR089C 618 nt13.29□□□□□ -0.28
RAD33Q04231 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.22□□□□□ -0.29
RAD33Q04231 PUN1YLR414C 792 nt13.17□□□□□ -0.3
RAD33Q04231 BUD23YCR047C 828 nt13.11□□□□□ -0.31
RAD33Q04231 RSB1YOR049C 1065 nt13.1□□□□□ -0.31
RAD33Q04231 PTC2YER089C 1395 nt13.06□□□□□ -0.32
RAD33Q04231 YJR018WYJR018W 363 nt13.04□□□□□ -0.32
RAD33Q04231 NAB2YGL122C 1578 nt12.93□□□□□ -0.34
RAD33Q04231 SPT5YML010W 3192 nt12.91□□□□□ -0.34
RAD33Q04231 TIR1YER011W 765 nt12.86□□□□□ -0.35
RAD33Q04231 YJR120WYJR120W 351 nt12.79□□□□□ -0.36
RAD33Q04231 SSA1YAL005C 1929 nt12.78□□□□□ -0.36
RAD33Q04231 FIS1YIL065C 468 nt12.73□□□□□ -0.37
RAD33Q04231 DAL1YIR027C 1383 nt12.7□□□□□ -0.38
RAD33Q04231 RPP2BYDR382W 333 nt12.67□□□□□ -0.38
RAD33Q04231 FPR4YLR449W 1179 nt12.65□□□□□ -0.38
RAD33Q04231 SSA4YER103W 1929 nt12.61□□□□□ -0.39
RAD33Q04231 INM2YDR287W 879 nt12.61□□□□□ -0.39
RAD33Q04231 PHO4YFR034C 939 nt12.59□□□□□ -0.39
RAD33Q04231 PST2YDR032C 597 nt12.54□□□□□ -0.4
RAD33Q04231 SRB2YHR041C 633 nt12.52□□□□□ -0.41
RAD33Q04231 MEP2YNL142W 1500 nt12.51□□□□□ -0.41
RAD33Q04231 YPS1YLR120C 1710 nt12.46□□□□□ -0.41
RAD33Q04231 Q0182Q0182 405 nt12.46□□□□□ -0.41
RAD33Q04231 YBL100CYBL100C 315 nt12.44□□□□□ -0.42
RAD33Q04231 BDH2YAL061W 1254 nt12.37□□□□□ -0.43
RAD33Q04231 YDR095CYDR095C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
RAD33Q04231 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.34□□□□□ -0.43
RAD33Q04231 DCW1YKL046C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
RAD33Q04231 FUN26YAL022C 1554 nt12.28□□□□□ -0.44
RAD33Q04231 FPS1YLL043W 2010 nt12.28□□□□□ -0.44
RAD33Q04231 WWM1YFL010C 636 nt12.24□□□□□ -0.45
RAD33Q04231 TRM9YML014W 840 nt12.18□□□□□ -0.46
RAD33Q04231 ALF1YNL148C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
RAD33Q04231 LSM3YLR438C-A 270 nt12.15□□□□□ -0.46
RAD33Q04231 EMI2YDR516C 1503 nt12.15□□□□□ -0.46
RAD33Q04231 BDF1YLR399C 2061 nt12.14□□□□□ -0.47
RAD33Q04231 SHU1YHL006C 453 nt12.11□□□□□ -0.47
RAD33Q04231 PTP1YDL230W 1008 nt12.1□□□□□ -0.47
RAD33Q04231 RPP2AYOL039W 321 nt12.1□□□□□ -0.47
RAD33Q04231 CCT6YDR188W 1641 nt12.09□□□□□ -0.47
RAD33Q04231 YMR090WYMR090W 684 nt12.07□□□□□ -0.48
RAD33Q04231 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.06□□□□□ -0.48
RAD33Q04231 YGR021WYGR021W 873 nt12.06□□□□□ -0.48
RAD33Q04231 CAC2YML102W 1407 nt12.05□□□□□ -0.48
RAD33Q04231 YDL221WYDL221W 552 nt12.04□□□□□ -0.48
RAD33Q04231 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
RAD33Q04231 HOM6YJR139C 1080 nt12.02□□□□□ -0.49
RAD33Q04231 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.02□□□□□ -0.49
RAD33Q04231 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.01□□□□□ -0.49
RAD33Q04231 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.01□□□□□ -0.49
RAD33Q04231 SIS1YNL007C 1059 nt12.01□□□□□ -0.49
RAD33Q04231 TAT1YBR069C 1860 nt11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms