RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeastyeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2YML013W MTC2P34246 357 aa6.36□□□□□ -1.39
UBX2YML013W ATG3P40344 310 aa6.36□□□□□ -1.39
UBX2YML013W YNL011CP53980 444 aa6.36□□□□□ -1.39
UBX2YML013W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TRM3Q07527 1436 aa6.36□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-ER2Q03619 1755 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-MR1Q04214 1755 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-NL1Q12112 1755 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-GR1Q12141 1755 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TY1B-BLQ12490 1755 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W PRI2P20457 528 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W VID27P40157 782 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W YGR122WP53272 402 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TMA17Q12513 150 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W TRS33Q99394 268 aa6.35□□□□□ -1.39
UBX2YML013W DAL5P15365 543 aa6.34□□□□□ -1.39
UBX2YML013W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.34□□□□□ -1.39not detected
UBX2YML013W TSC13Q99190 310 aa6.34□□□□□ -1.39
UBX2YML013W VTH1P40438 1549 aa6.34□□□□□ -1.39
UBX2YML013W VTH2P40890 1549 aa6.34□□□□□ -1.39
UBX2YML013W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W ATP4P05626 244 aa6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W MSH3P25336 1018 aa6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W HOS4P40480 1083 aa6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W MDM1Q01846 1127 aa6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PIB1Q06651 286 aa6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PLP2Q12017 286 aa6.34□□□□□ -1.4
UBX2YML013W ERR1P0CX10 437 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W ERR2P0CX11 437 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W HIR1P32479 840 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W VPS35P34110 944 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SOH1P38633 127 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W IES5P40060 125 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NIT1P40447 199 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SAM37P50110 327 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TYW3P53177 273 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PIL1P53252 339 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SND1Q04007 877 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W FLC1Q08967 793 aa6.33□□□□□ -1.4
UBX2YML013W RPP0P05317 312 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SFP1P32432 683 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W FAA4P47912 694 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W VPS4P52917 437 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PUS6P53294 404 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YNL115CP53925 644 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NST1P53935 1240 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PSK2Q08217 1101 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W OXR1Q08952 273 aa6.32□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SIC1P38634 284 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YAP1801P38856 637 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W RSP5P39940 809 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YJR120WP47157 116 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PDS5Q04264 1277 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W ESC2Q06340 456 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W VPS15P22219 1454 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TAF13P11747 167 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TFC3P34111 1160 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W OPI10Q08202 246 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TFB4Q12004 338 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NHA1Q99271 985 aa6.31□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TY3B-GQ99315 1547 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W CIT1P00890 479 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W PIF1P07271 859 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W MPH2P0CD99 609 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W MPH3P0CE00 602 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W CLB1P24868 471 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SUV3P32580 737 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W MED8P38304 223 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W ECM1P39715 212 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YGR237CP50089 785 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YRR1Q12172 810 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NTE1Q04958 1679 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W ULS1Q08562 1619 aa6.3□□□□□ -1.4
UBX2YML013W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YKL222CP35995 705 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W YHL008CP38750 627 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W TCD1P38756 429 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NNF2P53253 936 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W UFD2P54860 961 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W VPS60Q03390 229 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W FRA1Q07825 749 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NTG2Q08214 380 aa6.29□□□□□ -1.4
UBX2YML013W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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