RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	DAL4	Q04895	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	RGP1	P16664	663 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	SAP155	P43612	1002 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	MDS3	P53094	1487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	NUP85	P46673	744 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	HST3	P53687	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	TAF2	P23255	1407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	GNP1	P48813	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	NUT1	P53114	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	MSC7	P38694	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	ULP1	Q02724	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	RIM11	P38615	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SEC27	YGL137W	APM2	P38700	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YHL008C	P38750	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	FIR1	P40020	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	AIM46	P38885	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	NNF1	P47149	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YGR053C	P53234	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MRP10	O75012	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	UBP15	P50101	1230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	IDI1	P15496	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MON1	P53129	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	CDC34	P14682	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	PEP7	P32609	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	PET112	P33893	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MNR2	P35724	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YKL069W	P36088	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	RGA1	P39083	1007 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	OXR1	Q08952	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	AIM44	Q99299	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	GCR1	P07261	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	TFA2	P36145	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	BUD6	P41697	788 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	LSC2	P53312	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	ADI1	Q03677	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	OPT2	Q06593	877 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	HXT13	P39924	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YTA6	P40328	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	HXT17	P53631	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	HXT15	P54854	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	EEB1	Q02891	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MRPL16	P38064	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	IOC4	Q04213	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	CCP1	P00431	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	NPR1	P22211	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	OSH7	P38755	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MCD1	Q12158	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	CIT2	P08679	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	SPC42	P36094	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	RDH54	P38086	958 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MAD1	P40957	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MRPS18	P42847	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	YAF9	P53930	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	REC8	Q12188	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	SRF1	Q12516	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	GLO4	Q12320	285 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SEC27	YGL137W	BDF2	Q07442	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	PPM2	Q08282	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	CLN2	P20438	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	PPT1	P53043	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	NSE3	Q05541	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	RPN4	Q03465	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	HDA2	Q06629	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC27	YGL137W	FUS1	P11710	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59 ms