RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598913.5

SAMD4B-208, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4B, Length 2,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-208ENST00000598913 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.95■■■□□ 2.23
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SAMD4B-208ENST00000598913 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SAMD4B-208ENST00000598913 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.93■■■□□ 2.22
SAMD4B-208ENST00000598913 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.93■■■□□ 2.22
SAMD4B-208ENST00000598913 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.92■■■□□ 2.22
SAMD4B-208ENST00000598913 CCDC27Q2M243 656 aa28.91■■■□□ 2.22
SAMD4B-208ENST00000598913 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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SAMD4B-208ENST00000598913 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
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SAMD4B-208ENST00000598913 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.89■■■□□ 2.22
SAMD4B-208ENST00000598913 ABCC11Q96J66 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 NUTM2FA1L443 756 aa28.87■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.87■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.87■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.86■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 LNPKQ9C0E8 428 aa28.86■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 TSPYL6Q8N831 410 aa28.85■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 NLRP1Q9C000 1473 aa28.84■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.84■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 PIK3C2BO00750 1634 aa28.84■■■□□ 2.21
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SAMD4B-208ENST00000598913 NME9Q86XW9 330 aa28.83■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.83■■■□□ 2.21
SAMD4B-208ENST00000598913 DCTN1Q14203 1278 aa28.82■■■□□ 2.2
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SAMD4B-208ENST00000598913 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
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SAMD4B-208ENST00000598913 SOX12O15370 315 aa28.8■■■□□ 2.2
SAMD4B-208ENST00000598913 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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SAMD4B-208ENST00000598913 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.8■■■□□ 2.2
SAMD4B-208ENST00000598913 PTPRMP28827 1452 aa28.79■■■□□ 2.2
SAMD4B-208ENST00000598913 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.78■■■□□ 2.2
SAMD4B-208ENST00000598913 BECN1Q14457 450 aa28.78■■■□□ 2.2
SAMD4B-208ENST00000598913 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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SAMD4B-208ENST00000598913 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.74■■■□□ 2.19
SAMD4B-208ENST00000598913 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.74■■■□□ 2.19
SAMD4B-208ENST00000598913 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SAMD4B-208ENST00000598913 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.73■■■□□ 2.19
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SAMD4B-208ENST00000598913 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.73■■■□□ 2.19
SAMD4B-208ENST00000598913 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.72■■■□□ 2.19
SAMD4B-208ENST00000598913 KRT24Q2M2I5 525 aa28.71■■■□□ 2.19
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SAMD4B-208ENST00000598913 FCHSD2O94868 740 aa28.64■■■□□ 2.18
SAMD4B-208ENST00000598913 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
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SAMD4B-208ENST00000598913 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.63■■■□□ 2.17
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SAMD4B-208ENST00000598913 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.59■■■□□ 2.17
SAMD4B-208ENST00000598913 METP08581 1390 aa28.58■■■□□ 2.17
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SAMD4B-208ENST00000598913 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.58■■■□□ 2.17
SAMD4B-208ENST00000598913 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.58■■■□□ 2.17
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SAMD4B-208ENST00000598913 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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SAMD4B-208ENST00000598913 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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SAMD4B-208ENST00000598913 TSPOAP1O95153 1857 aa28.56■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 ZFYVE9O95405 1425 aa28.55■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 IL16Q14005 1332 aa28.55■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 MCM10Q7L590 875 aa28.54■■■□□ 2.16
SAMD4B-208ENST00000598913 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.53■■■□□ 2.16
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