RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Qser1A2BIE1 1698 aa21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sptbn5F6UCX4 1208 aa21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef28P97433 1693 aa21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cluap1Q8R3P7 413 aa21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AU019823E9PUQ3 292 aa21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CastP51125 788 aa21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprmP28828 1452 aa21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca14E9Q8F8 1683 aa21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Yeats2Q3TUF7 1407 aa21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atl3Q91YH5 541 aa21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp32F8VPZ3 1604 aa21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shq1Q7TMX5 569 aa21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd50F7BE84 1390 aa21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NinlQ6ZQ12 1394 aa21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plcd4Q8K3R3 807 aa21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rabep1O35551 862 aa21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp1b4Q99ME6 356 aa21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif13aQ9EQW7 1749 aa21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cavin4A2AMM0 362 aa21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf541Q0GGX2 1363 aa21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf330Q922H9 316 aa21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NktrP30415 1453 aa21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc60Q8C4J0 545 aa21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif2cQ922S8 721 aa21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gsto1O09131 240 aa21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PplQ9R269 1755 aa21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Htatsf1Q8BGC0 757 aa21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc12a5Q91V14 1138 aa21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q4VA45 678 aa21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ecm2Q5FW85 670 aa21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk19Q8BWD8 501 aa21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PaskQ8CEE6 1383 aa21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pik3r4Q8VD65 1358 aa21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hs1bp3Q3TC93 395 aa21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Antxr1Q9CZ52 562 aa21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ciz1Q8VEH2 845 aa21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp7bQ64446 1462 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9D9H8 365 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nutm1Q8BHP2 1126 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PalmQ9Z0P4 383 aa21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif18aQ91WD7 886 aa21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naip7Q9JIB3 1402 aa21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim28Q62318 834 aa21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FanciQ8K368 1330 aa21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Catsper2A2ARP9 588 aa21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsd3Q6P2L6 1439 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nwd1A6H603 1563 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nectin2P32507 530 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Swt1Q9DBQ9 907 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aplp1Q03157 653 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cog6Q8R3I3 657 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SkilQ60665 675 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map7O88735 730 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fchsd2Q3USJ8 740 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm156Q58A37 223 aa21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhg1F6S200 1446 aa21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map3k19E9Q3S4 1311 aa21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Terf2O35144 541 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q3UPC7 1272 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmco5bQ80X59 307 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spef2Q8C9J3 1734 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spryd3E9Q9B3 442 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vamp4O70480 141 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif1aP33173 1695 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MvpQ9EQK5 861 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Birc3O08863 600 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ipo4Q8VI75 1082 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asxl2Q8BZ32 1370 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r15aP17564 657 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Afap1Q80YS6 731 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd44B2RXR6 993 aa21.43■■□□□ 1.02
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