Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
Hs1bp3Q3TC93 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Hs1bp3Q3TC93 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Hs1bp3Q3TC93 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Hs1bp3Q3TC93 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Hs1bp3Q3TC93 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Hs1bp3Q3TC93 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Hs1bp3Q3TC93 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Hs1bp3Q3TC93 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Hs1bp3Q3TC93 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Hs1bp3Q3TC93 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Hs1bp3Q3TC93 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Hs1bp3Q3TC93 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Hs1bp3Q3TC93 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Hs1bp3Q3TC93 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Hs1bp3Q3TC93 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Hs1bp3Q3TC93 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Hs1bp3Q3TC93 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Hs1bp3Q3TC93 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Hs1bp3Q3TC93 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Hs1bp3Q3TC93 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Hs1bp3Q3TC93 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Hs1bp3Q3TC93 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Hs1bp3Q3TC93 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Hs1bp3Q3TC93 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Hs1bp3Q3TC93 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Hs1bp3Q3TC93 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Hs1bp3Q3TC93 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Hs1bp3Q3TC93 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Hs1bp3Q3TC93 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Hs1bp3Q3TC93 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Hs1bp3Q3TC93 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Hs1bp3Q3TC93 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Hs1bp3Q3TC93 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Hs1bp3Q3TC93 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Hs1bp3Q3TC93 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Hs1bp3Q3TC93 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Hs1bp3Q3TC93 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Hs1bp3Q3TC93 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Hs1bp3Q3TC93 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Hs1bp3Q3TC93 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Hs1bp3Q3TC93 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Hs1bp3Q3TC93 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Hs1bp3Q3TC93 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hs1bp3Q3TC93 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Hs1bp3Q3TC93 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hs1bp3Q3TC93 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Hs1bp3Q3TC93 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Hs1bp3Q3TC93 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Hs1bp3Q3TC93 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hs1bp3Q3TC93 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Hs1bp3Q3TC93 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Hs1bp3Q3TC93 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Hs1bp3Q3TC93 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Hs1bp3Q3TC93 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hs1bp3Q3TC93 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Hs1bp3Q3TC93 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Hs1bp3Q3TC93 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Hs1bp3Q3TC93 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hs1bp3Q3TC93 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Hs1bp3Q3TC93 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Hs1bp3Q3TC93 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Hs1bp3Q3TC93 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Hs1bp3Q3TC93 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Hs1bp3Q3TC93 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Hs1bp3Q3TC93 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Hs1bp3Q3TC93 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hs1bp3Q3TC93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Hs1bp3Q3TC93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hs1bp3Q3TC93 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Hs1bp3Q3TC93 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Hs1bp3Q3TC93 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Hs1bp3Q3TC93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hs1bp3Q3TC93 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hs1bp3Q3TC93 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hs1bp3Q3TC93 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Hs1bp3Q3TC93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Hs1bp3Q3TC93 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Hs1bp3Q3TC93 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hs1bp3Q3TC93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Hs1bp3Q3TC93 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Hs1bp3Q3TC93 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hs1bp3Q3TC93 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Hs1bp3Q3TC93 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Hs1bp3Q3TC93 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Hs1bp3Q3TC93 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Hs1bp3Q3TC93 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Hs1bp3Q3TC93 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Hs1bp3Q3TC93 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Hs1bp3Q3TC93 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Hs1bp3Q3TC93 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Hs1bp3Q3TC93 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Hs1bp3Q3TC93 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Hs1bp3Q3TC93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hs1bp3Q3TC93 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hs1bp3Q3TC93 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms