Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52.24■■■■■ 5.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms