Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
Atl3Q91YH5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Atl3Q91YH5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Atl3Q91YH5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Atl3Q91YH5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Atl3Q91YH5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Atl3Q91YH5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Atl3Q91YH5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Atl3Q91YH5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Atl3Q91YH5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Atl3Q91YH5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Atl3Q91YH5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Atl3Q91YH5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Atl3Q91YH5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Atl3Q91YH5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Atl3Q91YH5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Atl3Q91YH5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Atl3Q91YH5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Atl3Q91YH5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Atl3Q91YH5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Atl3Q91YH5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Atl3Q91YH5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Atl3Q91YH5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Atl3Q91YH5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Atl3Q91YH5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Atl3Q91YH5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Atl3Q91YH5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Atl3Q91YH5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atl3Q91YH5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atl3Q91YH5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Atl3Q91YH5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Atl3Q91YH5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Atl3Q91YH5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Atl3Q91YH5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Atl3Q91YH5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Atl3Q91YH5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Atl3Q91YH5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Atl3Q91YH5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atl3Q91YH5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Atl3Q91YH5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Atl3Q91YH5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Atl3Q91YH5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Atl3Q91YH5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Atl3Q91YH5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Atl3Q91YH5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Atl3Q91YH5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Atl3Q91YH5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Atl3Q91YH5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Atl3Q91YH5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Atl3Q91YH5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Atl3Q91YH5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atl3Q91YH5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Atl3Q91YH5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Atl3Q91YH5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Atl3Q91YH5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atl3Q91YH5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Atl3Q91YH5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Atl3Q91YH5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Atl3Q91YH5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atl3Q91YH5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atl3Q91YH5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atl3Q91YH5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atl3Q91YH5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atl3Q91YH5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atl3Q91YH5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atl3Q91YH5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atl3Q91YH5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Atl3Q91YH5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Atl3Q91YH5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Atl3Q91YH5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Atl3Q91YH5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Atl3Q91YH5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Atl3Q91YH5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Atl3Q91YH5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Atl3Q91YH5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Atl3Q91YH5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Atl3Q91YH5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atl3Q91YH5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Atl3Q91YH5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Atl3Q91YH5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Atl3Q91YH5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Atl3Q91YH5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Atl3Q91YH5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Atl3Q91YH5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Atl3Q91YH5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Atl3Q91YH5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Atl3Q91YH5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Atl3Q91YH5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Atl3Q91YH5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Atl3Q91YH5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Atl3Q91YH5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atl3Q91YH5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atl3Q91YH5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atl3Q91YH5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atl3Q91YH5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atl3Q91YH5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atl3Q91YH5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms