Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0P4

Palm, Paralemmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalmQ9Z0P4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
PalmQ9Z0P4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
PalmQ9Z0P4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
PalmQ9Z0P4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
PalmQ9Z0P4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
PalmQ9Z0P4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
PalmQ9Z0P4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
PalmQ9Z0P4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PalmQ9Z0P4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PalmQ9Z0P4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
PalmQ9Z0P4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
PalmQ9Z0P4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PalmQ9Z0P4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
PalmQ9Z0P4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PalmQ9Z0P4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
PalmQ9Z0P4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
PalmQ9Z0P4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PalmQ9Z0P4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PalmQ9Z0P4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PalmQ9Z0P4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
PalmQ9Z0P4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PalmQ9Z0P4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PalmQ9Z0P4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PalmQ9Z0P4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PalmQ9Z0P4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PalmQ9Z0P4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PalmQ9Z0P4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PalmQ9Z0P4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PalmQ9Z0P4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
PalmQ9Z0P4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PalmQ9Z0P4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PalmQ9Z0P4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PalmQ9Z0P4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PalmQ9Z0P4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PalmQ9Z0P4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PalmQ9Z0P4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PalmQ9Z0P4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PalmQ9Z0P4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PalmQ9Z0P4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PalmQ9Z0P4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PalmQ9Z0P4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PalmQ9Z0P4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PalmQ9Z0P4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PalmQ9Z0P4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PalmQ9Z0P4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PalmQ9Z0P4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PalmQ9Z0P4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PalmQ9Z0P4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PalmQ9Z0P4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
PalmQ9Z0P4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PalmQ9Z0P4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PalmQ9Z0P4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PalmQ9Z0P4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PalmQ9Z0P4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PalmQ9Z0P4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PalmQ9Z0P4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PalmQ9Z0P4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PalmQ9Z0P4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PalmQ9Z0P4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PalmQ9Z0P4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PalmQ9Z0P4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PalmQ9Z0P4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PalmQ9Z0P4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PalmQ9Z0P4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PalmQ9Z0P4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PalmQ9Z0P4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PalmQ9Z0P4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PalmQ9Z0P4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PalmQ9Z0P4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PalmQ9Z0P4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PalmQ9Z0P4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PalmQ9Z0P4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PalmQ9Z0P4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PalmQ9Z0P4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PalmQ9Z0P4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PalmQ9Z0P4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PalmQ9Z0P4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PalmQ9Z0P4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PalmQ9Z0P4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PalmQ9Z0P4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PalmQ9Z0P4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PalmQ9Z0P4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PalmQ9Z0P4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PalmQ9Z0P4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PalmQ9Z0P4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PalmQ9Z0P4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PalmQ9Z0P4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PalmQ9Z0P4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PalmQ9Z0P4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PalmQ9Z0P4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PalmQ9Z0P4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PalmQ9Z0P4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PalmQ9Z0P4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PalmQ9Z0P4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PalmQ9Z0P4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PalmQ9Z0P4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PalmQ9Z0P4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PalmQ9Z0P4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PalmQ9Z0P4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PalmQ9Z0P4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms