RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeastyeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRX1YBL064C YPQ2Q06328 317 aa5.87□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C MRT4P33201 236 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C SCD5P34758 872 aa5.86□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C YJR115WP47152 169 aa5.86□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C RMD1Q03441 430 aa5.86□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C VPS35P34110 944 aa5.85□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C YBL086CP38177 466 aa5.85□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C YNL011CP53980 444 aa5.85□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C CDC55Q00362 526 aa5.85□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C SMC1P32908 1225 aa5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C BRN1P38170 754 aa5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C MAD1P40957 749 aa5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C SUM1P46676 1062 aa5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C SAM37P50110 327 aa5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C ALD6P54115 500 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRX1YBL064C VMA3P25515 160 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C ACO2P39533 789 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C VAC8P39968 578 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C YGR035CP53222 116 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C ALD3P54114 506 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C VPS16Q03308 798 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C PIN2Q12057 282 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C YOL098CQ12496 1037 aa5.83□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C PEP7P32609 515 aa5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C HXT8P40886 569 aa5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C OXR1Q08952 273 aa5.82□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C CLN2P20438 545 aa5.81□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C CIC1P38779 376 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C YGR122WP53272 402 aa5.81□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C DOS2P54858 310 aa5.81□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C RSC4Q02206 625 aa5.81□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C SPC42P36094 363 aa5.8□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C LDH1P38139 375 aa5.8□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C CYC8P14922 966 aa5.79□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C RTT106P40161 455 aa5.79□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C BSC2Q05611 235 aa5.79□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C Q0182Q9ZZW1 134 aa5.79□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C DYS1P38791 387 aa5.78□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C RAD55P38953 406 aa5.78□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C TOS4Q06266 489 aa5.78□□□□□ -1.48
PRX1YBL064C RAD2P07276 1031 aa5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C PET112P33893 541 aa5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C MNR2P35724 969 aa5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C FAA3P39002 694 aa5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C YNL165WP53891 406 aa5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C YAF9P53930 226 aa5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C MLF3P32047 452 aa5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C NTA1P40354 457 aa5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C QDR2P40474 542 aa5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C ALA1P40825 983 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C RGD2P43556 714 aa5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C HPF1Q05164 967 aa5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C MSN1P22148 382 aa5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C FIR1P40020 876 aa5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C IOC3P43596 787 aa5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C YJL049WP47048 450 aa5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C INP54Q08227 384 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C PSY2P40164 858 aa5.74□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C RNH70P53331 553 aa5.74□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C CWC24P53769 259 aa5.74□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C DAL4Q04895 635 aa5.74□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C OPT2Q06593 877 aa5.74□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C YKL091CP33324 310 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C SSN3P39073 555 aa5.73□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C JJJ2P46997 583 aa5.73□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C NSE3Q05541 303 aa5.73□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C PRP40P33203 583 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C YHL008CP38750 627 aa5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C ICP55P40051 511 aa5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C MRPS18P42847 217 aa5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C YCS4Q06156 1176 aa5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C MCD1Q12158 566 aa5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRX1YBL064C FLP1P03870 423 aa5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C RPS31P05759 152 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C KAP122P32767 1081 aa5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C YBR287WP38355 427 aa5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C YTA6P40328 754 aa5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C MSN5P52918 1224 aa5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.71□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PRX1YBL064C YLR346CQ06139 101 aa5.71□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C CIT2P08679 460 aa5.7□□□□□ -1.5
PRX1YBL064C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data5.7□□□□□ -1.5not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9 ms