RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sema6bO54951 886 aa31.12■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr3aB2RXC6 1390 aa31.12■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa31.1■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc52a2Q9D8F3 450 aa31.1■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PtprvP70289 1705 aa31.1■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10563F6WIE4 79 aa31.09■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm2aP59997 1161 aa31.09■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Os9Q8K2C7 672 aa31.09■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrl1Q80TR1 1466 aa31.08■■■□□ 2.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cntnap1O54991 1385 aa31.08■■■□□ 2.57
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa31.07■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa31.07■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp32F8VPZ3 1604 aa31.06■■■□□ 2.56
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep170bQ80U49 1574 aa31.05■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q3UJC8 639 aa31.04■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fan1Q69ZT1 1020 aa31.04■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa31.03■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc7Q80TE7 1490 aa31.02■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf526Q8BI66 675 aa31.02■■■□□ 2.56
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wnk3Q80XP9 1757 aa31.02■■■□□ 2.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ggt6Q6PDE7 497 aa31.01■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm20521D3Z5F7 333 aa31■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GnpatP98192 678 aa30.98■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DccP70211 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C5P06684 1680 aa30.97■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Siglec1Q62230 1695 aa30.97■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa30.97■■■□□ 2.55
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrp6O88572 1613 aa30.95■■■□□ 2.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa30.95■■■□□ 2.54
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MypopQ8R4U1 393 aa30.94■■■□□ 2.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Als2Q920R0 1651 aa30.91■■■□□ 2.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Farp2Q91VS8 1065 aa30.91■■■□□ 2.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcna6Q61923 529 aa30.9■■■□□ 2.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dmrt2Q8BG36 561 aa30.9■■■□□ 2.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plekhg1F6S200 1446 aa30.87■■■□□ 2.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa30.87■■■□□ 2.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca14E9Q8F8 1683 aa30.85■■■□□ 2.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rundc1Q0VDN7 615 aa30.83■■■□□ 2.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sox12Q04890 314 aa30.82■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif1aP33173 1695 aa30.81■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30.8■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa30.8■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Card11Q8CIS0 1159 aa30.78■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smim5Q8BT42 78 aa30.77■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stard8Q8K031 1019 aa30.77■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem2Q5FWI3 1383 aa30.77■■■□□ 2.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Idi1P58044 227 aa30.76■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp40Q8BWR4 1235 aa30.76■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IqubQ8CDK3 788 aa30.76■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Camta1A2A891 1682 aa30.76■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NinlQ6ZQ12 1394 aa30.76■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcc10Q8R4P9 1501 aa30.75■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa30.74■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nphp4P59240 1425 aa30.73■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mink1Q9JM52 1308 aa30.73■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stag3O70576 1240 aa30.71■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa30.7■■■□□ 2.51
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NgefQ8CHT1 710 aa30.68■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tex14Q7M6U3 1450 aa30.68■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Srcin1Q9QWI6 1250 aa30.67■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam135bQ9DAI6 1403 aa30.66■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp7bQ64446 1462 aa30.66■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Emilin2Q8K482 1074 aa30.66■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acsbg1Q99PU5 721 aa30.64■■■□□ 2.5
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zranb1Q7M760 708 aa30.62■■■□□ 2.49
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rock2P70336 1388 aa30.61■■■□□ 2.49
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap3b2Q9JME5 1082 aa30.6■■■□□ 2.49
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp10bB1AWN4 1474 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr17E9Q271 1322 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf316Q6PGE4 1016 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb4Q5F293 982 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PtpruB1AUH1 1446 aa30.54■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca15E9PWH4 1668 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MpndQ3TV65 487 aa30.53■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eno4Q8C042 619 aa30.52■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pola1P33609 1465 aa30.51■■■□□ 2.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cadps2Q8BYR5 1297 aa30.51■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mon2Q80TL7 1715 aa30.49■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CenpjQ569L8 1344 aa30.48■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk19Q8BWD8 501 aa30.48■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nrxn1Q9CS84 1514 aa30.47■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sirt1Q923E4 737 aa30.46■■■□□ 2.47
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NktrP30415 1453 aa30.44■■■□□ 2.46
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc35g1Q8BY79 368 aa30.44■■■□□ 2.46
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