Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ03

Fnbp4, Formin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnbp4Q6ZQ03 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.91■■■■■ 6.38
Fnbp4Q6ZQ03 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
Fnbp4Q6ZQ03 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
Fnbp4Q6ZQ03 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
Fnbp4Q6ZQ03 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
Fnbp4Q6ZQ03 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Fnbp4Q6ZQ03 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Fnbp4Q6ZQ03 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Fnbp4Q6ZQ03 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Fnbp4Q6ZQ03 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
Fnbp4Q6ZQ03 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
Fnbp4Q6ZQ03 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
Fnbp4Q6ZQ03 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Fnbp4Q6ZQ03 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Fnbp4Q6ZQ03 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Fnbp4Q6ZQ03 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Fnbp4Q6ZQ03 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Fnbp4Q6ZQ03 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Fnbp4Q6ZQ03 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Fnbp4Q6ZQ03 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
Fnbp4Q6ZQ03 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Fnbp4Q6ZQ03 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Fnbp4Q6ZQ03 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Fnbp4Q6ZQ03 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Fnbp4Q6ZQ03 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Fnbp4Q6ZQ03 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
Fnbp4Q6ZQ03 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Fnbp4Q6ZQ03 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Fnbp4Q6ZQ03 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
Fnbp4Q6ZQ03 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Fnbp4Q6ZQ03 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Fnbp4Q6ZQ03 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Fnbp4Q6ZQ03 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Fnbp4Q6ZQ03 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Fnbp4Q6ZQ03 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Fnbp4Q6ZQ03 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Fnbp4Q6ZQ03 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Fnbp4Q6ZQ03 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Fnbp4Q6ZQ03 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fnbp4Q6ZQ03 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Fnbp4Q6ZQ03 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Fnbp4Q6ZQ03 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Fnbp4Q6ZQ03 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Fnbp4Q6ZQ03 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Fnbp4Q6ZQ03 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Fnbp4Q6ZQ03 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Fnbp4Q6ZQ03 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Fnbp4Q6ZQ03 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Fnbp4Q6ZQ03 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Fnbp4Q6ZQ03 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Fnbp4Q6ZQ03 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Fnbp4Q6ZQ03 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Fnbp4Q6ZQ03 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Fnbp4Q6ZQ03 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Fnbp4Q6ZQ03 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Fnbp4Q6ZQ03 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Fnbp4Q6ZQ03 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Fnbp4Q6ZQ03 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Fnbp4Q6ZQ03 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Fnbp4Q6ZQ03 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Fnbp4Q6ZQ03 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Fnbp4Q6ZQ03 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Fnbp4Q6ZQ03 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Fnbp4Q6ZQ03 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Fnbp4Q6ZQ03 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Fnbp4Q6ZQ03 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Fnbp4Q6ZQ03 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Fnbp4Q6ZQ03 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Fnbp4Q6ZQ03 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Fnbp4Q6ZQ03 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Fnbp4Q6ZQ03 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Fnbp4Q6ZQ03 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Fnbp4Q6ZQ03 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Fnbp4Q6ZQ03 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Fnbp4Q6ZQ03 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Fnbp4Q6ZQ03 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Fnbp4Q6ZQ03 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Fnbp4Q6ZQ03 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Fnbp4Q6ZQ03 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Fnbp4Q6ZQ03 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Fnbp4Q6ZQ03 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Fnbp4Q6ZQ03 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Fnbp4Q6ZQ03 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Fnbp4Q6ZQ03 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Fnbp4Q6ZQ03 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Fnbp4Q6ZQ03 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Fnbp4Q6ZQ03 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Fnbp4Q6ZQ03 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Fnbp4Q6ZQ03 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Fnbp4Q6ZQ03 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Fnbp4Q6ZQ03 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Fnbp4Q6ZQ03 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Fnbp4Q6ZQ03 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Fnbp4Q6ZQ03 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Fnbp4Q6ZQ03 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Fnbp4Q6ZQ03 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Fnbp4Q6ZQ03 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Fnbp4Q6ZQ03 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Fnbp4Q6ZQ03 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Fnbp4Q6ZQ03 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms