Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.7■■■■■ 6.35
PtprvP70289 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
PtprvP70289 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
PtprvP70289 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.04■■■■■ 5.28
PtprvP70289 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
PtprvP70289 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
PtprvP70289 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
PtprvP70289 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
PtprvP70289 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
PtprvP70289 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
PtprvP70289 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
PtprvP70289 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
PtprvP70289 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
PtprvP70289 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
PtprvP70289 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
PtprvP70289 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
PtprvP70289 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PtprvP70289 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PtprvP70289 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PtprvP70289 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PtprvP70289 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PtprvP70289 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
PtprvP70289 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PtprvP70289 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PtprvP70289 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
PtprvP70289 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PtprvP70289 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PtprvP70289 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
PtprvP70289 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
PtprvP70289 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PtprvP70289 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PtprvP70289 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
PtprvP70289 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
PtprvP70289 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PtprvP70289 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PtprvP70289 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
PtprvP70289 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
PtprvP70289 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
PtprvP70289 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PtprvP70289 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PtprvP70289 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PtprvP70289 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PtprvP70289 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PtprvP70289 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PtprvP70289 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PtprvP70289 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PtprvP70289 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PtprvP70289 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PtprvP70289 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PtprvP70289 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PtprvP70289 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
PtprvP70289 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
PtprvP70289 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PtprvP70289 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PtprvP70289 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PtprvP70289 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PtprvP70289 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PtprvP70289 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PtprvP70289 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PtprvP70289 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PtprvP70289 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PtprvP70289 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
PtprvP70289 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtprvP70289 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PtprvP70289 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PtprvP70289 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PtprvP70289 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PtprvP70289 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PtprvP70289 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
PtprvP70289 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PtprvP70289 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprvP70289 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
PtprvP70289 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PtprvP70289 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprvP70289 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PtprvP70289 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PtprvP70289 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PtprvP70289 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
PtprvP70289 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
PtprvP70289 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprvP70289 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprvP70289 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PtprvP70289 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PtprvP70289 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
PtprvP70289 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PtprvP70289 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PtprvP70289 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PtprvP70289 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PtprvP70289 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PtprvP70289 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PtprvP70289 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PtprvP70289 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PtprvP70289 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PtprvP70289 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PtprvP70289 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtprvP70289 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PtprvP70289 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
PtprvP70289 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PtprvP70289 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PtprvP70289 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms