Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.03■■■■■ 6.24
Arhgef1Q61210 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
Arhgef1Q61210 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Arhgef1Q61210 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
Arhgef1Q61210 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Arhgef1Q61210 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Arhgef1Q61210 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Arhgef1Q61210 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Arhgef1Q61210 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
Arhgef1Q61210 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Arhgef1Q61210 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
Arhgef1Q61210 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
Arhgef1Q61210 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Arhgef1Q61210 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Arhgef1Q61210 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Arhgef1Q61210 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Arhgef1Q61210 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Arhgef1Q61210 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Arhgef1Q61210 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Arhgef1Q61210 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Arhgef1Q61210 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
Arhgef1Q61210 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Arhgef1Q61210 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Arhgef1Q61210 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Arhgef1Q61210 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Arhgef1Q61210 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Arhgef1Q61210 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Arhgef1Q61210 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arhgef1Q61210 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Arhgef1Q61210 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Arhgef1Q61210 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Arhgef1Q61210 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Arhgef1Q61210 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Arhgef1Q61210 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Arhgef1Q61210 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Arhgef1Q61210 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Arhgef1Q61210 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Arhgef1Q61210 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Arhgef1Q61210 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Arhgef1Q61210 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Arhgef1Q61210 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Arhgef1Q61210 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arhgef1Q61210 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Arhgef1Q61210 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Arhgef1Q61210 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Arhgef1Q61210 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Arhgef1Q61210 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
Arhgef1Q61210 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Arhgef1Q61210 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Arhgef1Q61210 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Arhgef1Q61210 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Arhgef1Q61210 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Arhgef1Q61210 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Arhgef1Q61210 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Arhgef1Q61210 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Arhgef1Q61210 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Arhgef1Q61210 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Arhgef1Q61210 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Arhgef1Q61210 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Arhgef1Q61210 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Arhgef1Q61210 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Arhgef1Q61210 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Arhgef1Q61210 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Arhgef1Q61210 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Arhgef1Q61210 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Arhgef1Q61210 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Arhgef1Q61210 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Arhgef1Q61210 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Arhgef1Q61210 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Arhgef1Q61210 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Arhgef1Q61210 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Arhgef1Q61210 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Arhgef1Q61210 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Arhgef1Q61210 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Arhgef1Q61210 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Arhgef1Q61210 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Arhgef1Q61210 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Arhgef1Q61210 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Arhgef1Q61210 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Arhgef1Q61210 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Arhgef1Q61210 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Arhgef1Q61210 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Arhgef1Q61210 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Arhgef1Q61210 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Arhgef1Q61210 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Arhgef1Q61210 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Arhgef1Q61210 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Arhgef1Q61210 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Arhgef1Q61210 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Arhgef1Q61210 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Arhgef1Q61210 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Arhgef1Q61210 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Arhgef1Q61210 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Arhgef1Q61210 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Arhgef1Q61210 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Arhgef1Q61210 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Arhgef1Q61210 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Arhgef1Q61210 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Arhgef1Q61210 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Arhgef1Q61210 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
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