Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.94■■■■■ 6.39
Sema6bO54951 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
Sema6bO54951 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
Sema6bO54951 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
Sema6bO54951 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
Sema6bO54951 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Sema6bO54951 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Sema6bO54951 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Sema6bO54951 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Sema6bO54951 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
Sema6bO54951 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Sema6bO54951 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
Sema6bO54951 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Sema6bO54951 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Sema6bO54951 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Sema6bO54951 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Sema6bO54951 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Sema6bO54951 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Sema6bO54951 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
Sema6bO54951 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
Sema6bO54951 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Sema6bO54951 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Sema6bO54951 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Sema6bO54951 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Sema6bO54951 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Sema6bO54951 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Sema6bO54951 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Sema6bO54951 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Sema6bO54951 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Sema6bO54951 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Sema6bO54951 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Sema6bO54951 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Sema6bO54951 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Sema6bO54951 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Sema6bO54951 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Sema6bO54951 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Sema6bO54951 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Sema6bO54951 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Sema6bO54951 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Sema6bO54951 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Sema6bO54951 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Sema6bO54951 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Sema6bO54951 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Sema6bO54951 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Sema6bO54951 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sema6bO54951 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Sema6bO54951 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
Sema6bO54951 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Sema6bO54951 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Sema6bO54951 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Sema6bO54951 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Sema6bO54951 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Sema6bO54951 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Sema6bO54951 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Sema6bO54951 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Sema6bO54951 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Sema6bO54951 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Sema6bO54951 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Sema6bO54951 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sema6bO54951 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Sema6bO54951 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Sema6bO54951 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.04■■■■■ 4
Sema6bO54951 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Sema6bO54951 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Sema6bO54951 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Sema6bO54951 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Sema6bO54951 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Sema6bO54951 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Sema6bO54951 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sema6bO54951 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sema6bO54951 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Sema6bO54951 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sema6bO54951 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Sema6bO54951 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Sema6bO54951 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Sema6bO54951 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Sema6bO54951 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Sema6bO54951 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Sema6bO54951 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Sema6bO54951 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Sema6bO54951 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Sema6bO54951 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Sema6bO54951 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Sema6bO54951 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Sema6bO54951 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Sema6bO54951 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sema6bO54951 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sema6bO54951 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Sema6bO54951 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sema6bO54951 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sema6bO54951 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Sema6bO54951 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Sema6bO54951 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sema6bO54951 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sema6bO54951 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Sema6bO54951 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sema6bO54951 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sema6bO54951 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Sema6bO54951 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Sema6bO54951 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms