RNA–Protein interactions for RNA: YOR075W

UFE1, Transcript of t-SNARE protein required for retrograde vesicular traffic, yeast

Gene UFE1, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFE1	YOR075W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	DYN2	Q02647	92 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	LCL1	Q02786	101 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	NCE101	Q02820	53 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	MIX14	Q04341	121 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	YOL131W	Q08270	108 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	ECM29	P38737	1868 aa		0.28	□□□□□ -2.36
UFE1	YOR075W	MYO1	P08964	1928 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	CCW14	O13547	238 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	MRP49	P32388	137 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	ACP1	P32463	125 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	TIM12	P32830	109 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SNF11	P38956	169 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	CYB5	P40312	120 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YIR020C	P40575	100 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	ICS3	P47034	131 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SIP18	P50263	79 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SPC24	Q04477	213 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	RTR2	Q12378	196 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	RPL39	P04650	51 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	AUA1	P32450	94 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YHR130C	P38834	111 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	PAU12	P53343	120 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SPC2	Q04969	178 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.26	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	MOT1	P32333	1867 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	COX9	P07255	59 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YCR101C	P25607	182 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	POP7	P38291	140 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YEA6	P39953	335 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	TDA2	P40045	126 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	PAM16	P42949	149 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	VPS55	P47111	140 aa		0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	ROX3	P25046	220 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	PAU2	P32612	120 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	PAU24	P38155	120 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	COX23	P38824	151 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	MPC2	P38857	129 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	HOR7	Q05827	59 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SLO1	Q3E784	85 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	OST5	Q92316	86 aa		0.24	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	FPR2	P32472	135 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YBL071C	P38185	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	RPB11	P38902	120 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	VMA7	P39111	118 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	AIM11	P87275	137 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	COX12	Q01519	83 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SGF11	Q03067	99 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SCP1	Q08873	200 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YLR118C	Q12354	227 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	BPH1	P25356	2167 aa		0.23	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	QCR9	P22289	66 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	MRP17	P28778	131 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	YHR173C	P38864	112 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SPI1	P40092	148 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SWM2	P40342	146 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	IMP2	P46972	177 aa		0.22	□□□□□ -2.37
UFE1	YOR075W	SNN1	P48232	102 aa		0.22	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.3 ms