Protein–RNA interactions for Protein: P38864

YHR173C, Uncharacterized protein YHR173C, yeastyeast

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR173CP38864 NSR1YGR159C 1245 nt15.94■□□□□ 0.14
YHR173CP38864 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.65■□□□□ 0.1
YHR173CP38864 NOP1YDL014W 984 nt15.08■□□□□ 0
YHR173CP38864 MDJ1YFL016C 1536 nt14.5□□□□□ -0.09
YHR173CP38864 YKL036CYKL036C 393 nt13.5□□□□□ -0.25
YHR173CP38864 YJL027CYJL027C 417 nt13.39□□□□□ -0.27
YHR173CP38864 SRX1YKL086W 384 nt13.15□□□□□ -0.3
YHR173CP38864 Q0297Q0297 156 nt13.03□□□□□ -0.32
YHR173CP38864 DBP2YNL112W 1641 nt12.64□□□□□ -0.39
YHR173CP38864 YBR190WYBR190W 312 nt12.51□□□□□ -0.41
YHR173CP38864 YCR051WYCR051W 669 nt12.45□□□□□ -0.42
YHR173CP38864 RTC3YHR087W 336 nt12.21□□□□□ -0.45
YHR173CP38864 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR173CP38864 SCS3YGL126W 1143 nt12.04□□□□□ -0.48
YHR173CP38864 CCC1YLR220W 969 nt11.99□□□□□ -0.49
YHR173CP38864 RVS167YDR388W 1449 nt11.87□□□□□ -0.51
YHR173CP38864 SSA3YBL075C 1950 nt11.87□□□□□ -0.51
YHR173CP38864 RPP1BYDL130W 321 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR173CP38864 YOL085CYOL085C 342 nt11.68□□□□□ -0.54
YHR173CP38864 PUT4YOR348C 1884 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR173CP38864 SCJ1YMR214W 1134 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR173CP38864 PKP1YIL042C 1185 nt11.55□□□□□ -0.56
YHR173CP38864 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.34□□□□□ -0.59
YHR173CP38864 SHR5YOL110W 714 nt11.33□□□□□ -0.6
YHR173CP38864 ARE1YCR048W 1833 nt11.3□□□□□ -0.6
YHR173CP38864 URN1YPR152C 1398 nt11.27□□□□□ -0.61
YHR173CP38864 POA1YBR022W 534 nt11.26□□□□□ -0.61
YHR173CP38864 SAH1YER043C 1350 nt11.21□□□□□ -0.61
YHR173CP38864 PET122YER153C 765 nt11.2□□□□□ -0.62
YHR173CP38864 OPI9YLR338W 858 nt11.19□□□□□ -0.62
YHR173CP38864 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.18□□□□□ -0.62
YHR173CP38864 DEP1YAL013W 1218 nt11.12□□□□□ -0.63
YHR173CP38864 BSC6YOL137W 1494 nt11.09□□□□□ -0.63
YHR173CP38864 RPN10YHR200W 807 nt11.05□□□□□ -0.64
YHR173CP38864 SCR1SCR1 522 nt11.02□□□□□ -0.65
YHR173CP38864 YDJ1YNL064C 1230 nt10.99□□□□□ -0.65
YHR173CP38864 YNL208WYNL208W 600 nt10.93□□□□□ -0.66
YHR173CP38864 BUD23YCR047C 828 nt10.9□□□□□ -0.66
YHR173CP38864 PUN1YLR414C 792 nt10.89□□□□□ -0.67
YHR173CP38864 RRN5YLR141W 1092 nt10.84□□□□□ -0.67
YHR173CP38864 SPT5YML010W 3192 nt10.82□□□□□ -0.68
YHR173CP38864 PTC2YER089C 1395 nt10.79□□□□□ -0.68
YHR173CP38864 GAR1YHR089C 618 nt10.79□□□□□ -0.68
YHR173CP38864 YJR018WYJR018W 363 nt10.74□□□□□ -0.69
YHR173CP38864 NAB2YGL122C 1578 nt10.73□□□□□ -0.69
YHR173CP38864 SSA4YER103W 1929 nt10.68□□□□□ -0.7
YHR173CP38864 ATS1YAL020C 1002 nt10.65□□□□□ -0.7
YHR173CP38864 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.62□□□□□ -0.71
YHR173CP38864 RSB1YOR049C 1065 nt10.51□□□□□ -0.73
YHR173CP38864 DAL1YIR027C 1383 nt10.51□□□□□ -0.73
YHR173CP38864 FIS1YIL065C 468 nt10.5□□□□□ -0.73
YHR173CP38864 FPR4YLR449W 1179 nt10.47□□□□□ -0.73
YHR173CP38864 MEP2YNL142W 1500 nt10.46□□□□□ -0.74
YHR173CP38864 TIR1YER011W 765 nt10.45□□□□□ -0.74
YHR173CP38864 RPP2BYDR382W 333 nt10.44□□□□□ -0.74
YHR173CP38864 INM2YDR287W 879 nt10.42□□□□□ -0.74
YHR173CP38864 YJR120WYJR120W 351 nt10.42□□□□□ -0.74
YHR173CP38864 PHO4YFR034C 939 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR173CP38864 SSA1YAL005C 1929 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR173CP38864 YPS1YLR120C 1710 nt10.34□□□□□ -0.75
YHR173CP38864 BDF1YLR399C 2061 nt10.29□□□□□ -0.76
YHR173CP38864 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.27□□□□□ -0.77
YHR173CP38864 DCW1YKL046C 1350 nt10.26□□□□□ -0.77
YHR173CP38864 YBL100CYBL100C 315 nt10.23□□□□□ -0.77
YHR173CP38864 YDR095CYDR095C 411 nt10.21□□□□□ -0.77
YHR173CP38864 YMR090WYMR090W 684 nt10.16□□□□□ -0.78
YHR173CP38864 TAT1YBR069C 1860 nt10.15□□□□□ -0.78
YHR173CP38864 EMI2YDR516C 1503 nt10.15□□□□□ -0.78
YHR173CP38864 BDH2YAL061W 1254 nt10.13□□□□□ -0.79
YHR173CP38864 FUN26YAL022C 1554 nt10.09□□□□□ -0.79
YHR173CP38864 SRB2YHR041C 633 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR173CP38864 YBR220CYBR220C 1683 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR173CP38864 ALF1YNL148C 765 nt10.07□□□□□ -0.8
YHR173CP38864 RPP2AYOL039W 321 nt10.04□□□□□ -0.8
YHR173CP38864 YDL221WYDL221W 552 nt10.03□□□□□ -0.8
YHR173CP38864 TRM9YML014W 840 nt10.02□□□□□ -0.81
YHR173CP38864 PTP1YDL230W 1008 nt9.99□□□□□ -0.81
YHR173CP38864 SDH1YKL148C 1923 nt9.99□□□□□ -0.81
YHR173CP38864 CAC2YML102W 1407 nt9.99□□□□□ -0.81
YHR173CP38864 PST2YDR032C 597 nt9.93□□□□□ -0.82
YHR173CP38864 LSM3YLR438C-A 270 nt9.92□□□□□ -0.82
YHR173CP38864 CCT6YDR188W 1641 nt9.92□□□□□ -0.82
YHR173CP38864 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.91□□□□□ -0.82
YHR173CP38864 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.91□□□□□ -0.82
YHR173CP38864 WWM1YFL010C 636 nt9.9□□□□□ -0.82
YHR173CP38864 SIS1YNL007C 1059 nt9.89□□□□□ -0.83
YHR173CP38864 SCC4YER147C 1875 nt9.87□□□□□ -0.83
YHR173CP38864 IRC15YPL017C 1500 nt9.84□□□□□ -0.83
YHR173CP38864 SEC11YIR022W 504 nt9.83□□□□□ -0.84
YHR173CP38864 PCH2YBR186W 1695 nt9.8□□□□□ -0.84
YHR173CP38864 GIS3YLR094C 1509 nt9.78□□□□□ -0.84
YHR173CP38864 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.78□□□□□ -0.84
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