Protein–RNA interactions for Protein: Q12354

YLR118C, Acyl-protein thioesterase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR118CQ12354 NSR1YGR159C 1245 nt15.79■□□□□ 0.12
YLR118CQ12354 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.35■□□□□ 0.05
YLR118CQ12354 MDJ1YFL016C 1536 nt14.76□□□□□ -0.05
YLR118CQ12354 NOP1YDL014W 984 nt14.58□□□□□ -0.08
YLR118CQ12354 YJL027CYJL027C 417 nt13.54□□□□□ -0.24
YLR118CQ12354 SSA3YBL075C 1950 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR118CQ12354 YKL036CYKL036C 393 nt12.79□□□□□ -0.36
YLR118CQ12354 YBR190WYBR190W 312 nt12.73□□□□□ -0.37
YLR118CQ12354 SRX1YKL086W 384 nt12.72□□□□□ -0.37
YLR118CQ12354 DBP2YNL112W 1641 nt12.71□□□□□ -0.37
YLR118CQ12354 Q0297Q0297 156 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR118CQ12354 RTC3YHR087W 336 nt12.47□□□□□ -0.41
YLR118CQ12354 PUT4YOR348C 1884 nt12.1□□□□□ -0.47
YLR118CQ12354 YCR051WYCR051W 669 nt12.07□□□□□ -0.48
YLR118CQ12354 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR118CQ12354 CCC1YLR220W 969 nt11.86□□□□□ -0.51
YLR118CQ12354 RVS167YDR388W 1449 nt11.84□□□□□ -0.51
YLR118CQ12354 POA1YBR022W 534 nt11.7□□□□□ -0.54
YLR118CQ12354 ARE1YCR048W 1833 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR118CQ12354 SCJ1YMR214W 1134 nt11.62□□□□□ -0.55
YLR118CQ12354 BSC6YOL137W 1494 nt11.58□□□□□ -0.56
YLR118CQ12354 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR118CQ12354 SSA4YER103W 1929 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR118CQ12354 SAH1YER043C 1350 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR118CQ12354 SPT5YML010W 3192 nt11.47□□□□□ -0.57
YLR118CQ12354 URN1YPR152C 1398 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR118CQ12354 OPI9YLR338W 858 nt11.34□□□□□ -0.59
YLR118CQ12354 BUD23YCR047C 828 nt11.27□□□□□ -0.61
YLR118CQ12354 SCS3YGL126W 1143 nt11.27□□□□□ -0.61
YLR118CQ12354 RPP1BYDL130W 321 nt11.23□□□□□ -0.61
YLR118CQ12354 SHR5YOL110W 714 nt11.23□□□□□ -0.61
YLR118CQ12354 DEP1YAL013W 1218 nt11.21□□□□□ -0.61
YLR118CQ12354 BDF1YLR399C 2061 nt11.09□□□□□ -0.63
YLR118CQ12354 YOL085CYOL085C 342 nt11.08□□□□□ -0.64
YLR118CQ12354 RPN10YHR200W 807 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR118CQ12354 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.05□□□□□ -0.64
YLR118CQ12354 PKP1YIL042C 1185 nt11.05□□□□□ -0.64
YLR118CQ12354 PTC2YER089C 1395 nt11.02□□□□□ -0.65
YLR118CQ12354 PUN1YLR414C 792 nt11.01□□□□□ -0.65
YLR118CQ12354 NAB2YGL122C 1578 nt10.95□□□□□ -0.66
YLR118CQ12354 TAT1YBR069C 1860 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR118CQ12354 MEP2YNL142W 1500 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR118CQ12354 YNL208WYNL208W 600 nt10.91□□□□□ -0.66
YLR118CQ12354 PAC11YDR488C 1602 nt10.91□□□□□ -0.66
YLR118CQ12354 PET122YER153C 765 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR118CQ12354 YJR018WYJR018W 363 nt10.8□□□□□ -0.68
YLR118CQ12354 DCW1YKL046C 1350 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR118CQ12354 FIS1YIL065C 468 nt10.74□□□□□ -0.69
YLR118CQ12354 FPR4YLR449W 1179 nt10.7□□□□□ -0.7
YLR118CQ12354 DAL1YIR027C 1383 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR118CQ12354 YDJ1YNL064C 1230 nt10.67□□□□□ -0.7
YLR118CQ12354 YPS1YLR120C 1710 nt10.62□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 YBR220CYBR220C 1683 nt10.61□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 GAR1YHR089C 618 nt10.61□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.6□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 EMI2YDR516C 1503 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 PHO4YFR034C 939 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 YMR090WYMR090W 684 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR118CQ12354 SCR1SCR1 522 nt10.53□□□□□ -0.72
YLR118CQ12354 NVJ2YPR091C 2313 nt10.51□□□□□ -0.73
YLR118CQ12354 INM2YDR287W 879 nt10.49□□□□□ -0.73
YLR118CQ12354 YJR120WYJR120W 351 nt10.46□□□□□ -0.73
YLR118CQ12354 SDH1YKL148C 1923 nt10.45□□□□□ -0.74
YLR118CQ12354 YDL221WYDL221W 552 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR118CQ12354 YDR095CYDR095C 411 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR118CQ12354 RRN5YLR141W 1092 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR118CQ12354 PCH2YBR186W 1695 nt10.41□□□□□ -0.74
YLR118CQ12354 RPP2BYDR382W 333 nt10.41□□□□□ -0.74
YLR118CQ12354 GUT2YIL155C 1950 nt10.37□□□□□ -0.75
YLR118CQ12354 SEC11YIR022W 504 nt10.34□□□□□ -0.75
YLR118CQ12354 CAC2YML102W 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
YLR118CQ12354 YBL100CYBL100C 315 nt10.31□□□□□ -0.76
YLR118CQ12354 SCC4YER147C 1875 nt10.29□□□□□ -0.76
YLR118CQ12354 SSA1YAL005C 1929 nt10.27□□□□□ -0.76
YLR118CQ12354 PTP1YDL230W 1008 nt10.26□□□□□ -0.77
YLR118CQ12354 TIR1YER011W 765 nt10.26□□□□□ -0.77
YLR118CQ12354 RPP2AYOL039W 321 nt10.25□□□□□ -0.77
YLR118CQ12354 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR118CQ12354 ALF1YNL148C 765 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR118CQ12354 IRC15YPL017C 1500 nt10.17□□□□□ -0.78
YLR118CQ12354 YSC84YHR016C 1407 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR118CQ12354 FUN26YAL022C 1554 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR118CQ12354 PIB2YGL023C 1908 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR118CQ12354 GIS3YLR094C 1509 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR118CQ12354 RTF1YGL244W 1677 nt10.09□□□□□ -0.79
YLR118CQ12354 FPS1YLL043W 2010 nt10.06□□□□□ -0.8
YLR118CQ12354 BDH2YAL061W 1254 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR118CQ12354 RSB1YOR049C 1065 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR118CQ12354 YHL050CYHL050C 2094 nt10.03□□□□□ -0.8
YLR118CQ12354 TRM9YML014W 840 nt10□□□□□ -0.81
YLR118CQ12354 RTS2YOR077W 699 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR118CQ12354 SIS1YNL007C 1059 nt9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms