RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C VPS55P47111 140 aa0.19□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C SPC24Q04477 213 aa0.19□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C PCC1Q3E833 88 aa0.19□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C SPO14P36126 1683 aa0.19□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C BPT1P14772 1559 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C FRQ1Q06389 190 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YLR118CQ12354 227 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C TY4B-HP0C2J7 1802 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C TAO3P40468 2376 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C SRB8P25648 1427 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C GDB1Q06625 1536 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C PEP1P32319 1579 aa0.18□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C TDA2P40045 126 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C AIM11P87275 137 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YLR099W-AQ3E798 87 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C ATG2P53855 1592 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YER187WP40102 141 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YIR020CP40575 100 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YLR363W-AQ3E747 85 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C RKR1Q04781 1562 aa0.17□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C STU1P38198 1513 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C VTH1P40438 1549 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C VTH2P40890 1549 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C RPB11P38902 120 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C VMA7P39111 118 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C SNN1P48232 102 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C MMS22Q06164 1454 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YSP2Q06681 1438 aa0.16□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C HMRA2P0CY13 119 aa0.15□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YCR099CP25657 155 aa0.15□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C PAU24P38155 120 aa0.15□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YHR173CP38864 112 aa0.15□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C YBR072C-AQ3E794 53 aa0.15□□□□□ -2.38
HDA3YPR179C TY3B-GQ99315 1547 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C PAU2P32612 120 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-FP0CX63 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-CP25384 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-DR2Q03494 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-OR1Q12113 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-DR1Q12472 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-BQ12491 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-OR2Q12501 1770 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C POL2P21951 2222 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C UFD4P33202 1483 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C BCK1Q01389 1478 aa0.15□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-NL1Q12112 1755 aa0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C DAD1Q12248 94 aa0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C RSF2P46974 1380 aa0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YBT1P32386 1661 aa0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C VMR1P38735 1592 aa0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YLR255CO13574 117 aa0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-BLQ12490 1755 aa0.13□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C NUP170P38181 1502 aa0.13□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YAR029WP39549 74 aa0.13□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C RPS29AP41057 56 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-MR1Q04214 1755 aa0.13□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C VPS15P22219 1454 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C PAM16P42949 149 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C APC1P53886 1748 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C FIG2P25653 1609 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C PAU19P0CE85 124 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C PAU3P25610 124 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C GTT1P40582 234 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YLR042CQ07990 161 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C YLR365WQ7LIF2 110 aa0.12□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C MYO4P32492 1471 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C MLP2P40457 1679 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-JR1P47098 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-ER1Q03612 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-ER2Q03619 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-DR1Q03855 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HDA3YPR179C TY1B-GR1Q12141 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
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