Protein–RNA interactions for Protein: P41057

RPS29A, 40S ribosomal protein S29-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS29AP41057 NOP1YDL014W 984 nt9.18□□□□□ -0.94
RPS29AP41057 YML009W-BYML009W-B 477 nt9.17□□□□□ -0.94
RPS29AP41057 NSR1YGR159C 1245 nt8.97□□□□□ -0.97
RPS29AP41057 YKL036CYKL036C 393 nt8.61□□□□□ -1.03
RPS29AP41057 YJL027CYJL027C 417 nt8.07□□□□□ -1.12
RPS29AP41057 Q0297Q0297 156 nt8.01□□□□□ -1.13
RPS29AP41057 SRX1YKL086W 384 nt7.91□□□□□ -1.14
RPS29AP41057 SCS3YGL126W 1143 nt7.86□□□□□ -1.15
RPS29AP41057 MDJ1YFL016C 1536 nt7.55□□□□□ -1.2
RPS29AP41057 YCR051WYCR051W 669 nt7.51□□□□□ -1.21
RPS29AP41057 SCJ1YMR214W 1134 nt7.46□□□□□ -1.22
RPS29AP41057 YOL085CYOL085C 342 nt7.36□□□□□ -1.23
RPS29AP41057 RPP1BYDL130W 321 nt7.18□□□□□ -1.26
RPS29AP41057 PKP1YIL042C 1185 nt7.13□□□□□ -1.27
RPS29AP41057 ATS1YAL020C 1002 nt7.12□□□□□ -1.27
RPS29AP41057 TRN1tP(UGG)A 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 SUF9tP(UGG)F 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 SUF8tP(UGG)H 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 SUF7tP(UGG)M 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 SUF11tP(UGG)O2 72 nt6.96□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 SCR1SCR1 522 nt6.94□□□□□ -1.3
RPS29AP41057 CCC1YLR220W 969 nt6.85□□□□□ -1.31
RPS29AP41057 PET122YER153C 765 nt6.74□□□□□ -1.33
RPS29AP41057 DBP2YNL112W 1641 nt6.72□□□□□ -1.33
RPS29AP41057 RVS167YDR388W 1449 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS29AP41057 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt6.66□□□□□ -1.34
RPS29AP41057 RTC3YHR087W 336 nt6.64□□□□□ -1.35
RPS29AP41057 RSB1YOR049C 1065 nt6.59□□□□□ -1.35
RPS29AP41057 RRN5YLR141W 1092 nt6.58□□□□□ -1.36
RPS29AP41057 PST2YDR032C 597 nt6.52□□□□□ -1.37
RPS29AP41057 YDJ1YNL064C 1230 nt6.52□□□□□ -1.37
RPS29AP41057 YBR190WYBR190W 312 nt6.52□□□□□ -1.37
RPS29AP41057 YKL097CYKL097C 411 nt6.49□□□□□ -1.37
RPS29AP41057 YER088W-BYER088W-B 147 nt6.45□□□□□ -1.38
RPS29AP41057 SHR5YOL110W 714 nt6.42□□□□□ -1.38
RPS29AP41057 GAR1YHR089C 618 nt6.24□□□□□ -1.41
RPS29AP41057 RPN10YHR200W 807 nt6.19□□□□□ -1.42
RPS29AP41057 SHU1YHL006C 453 nt6.15□□□□□ -1.42
RPS29AP41057 RDN37-1RDN37-1 5354 nt6.12□□□□□ -1.43
RPS29AP41057 RDN37-2RDN37-2 5354 nt6.12□□□□□ -1.43
RPS29AP41057 NPL3YDR432W 1245 nt6.11□□□□□ -1.43
RPS29AP41057 YNL208WYNL208W 600 nt6.1□□□□□ -1.43
RPS29AP41057 TIR1YER011W 765 nt6.05□□□□□ -1.44
RPS29AP41057 YOR139CYOR139C 393 nt6.02□□□□□ -1.45
RPS29AP41057 URN1YPR152C 1398 nt6.02□□□□□ -1.45
RPS29AP41057 YGR021WYGR021W 873 nt6□□□□□ -1.45
RPS29AP41057 DEP1YAL013W 1218 nt6□□□□□ -1.45
RPS29AP41057 YOL037CYOL037C 354 nt5.99□□□□□ -1.45
RPS29AP41057 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt5.91□□□□□ -1.46
RPS29AP41057 OPI9YLR338W 858 nt5.91□□□□□ -1.46
RPS29AP41057 YJL225CYJL225C 5277 nt5.88□□□□□ -1.47
RPS29AP41057 RPP2BYDR382W 333 nt5.87□□□□□ -1.47
RPS29AP41057 BSC6YOL137W 1494 nt5.85□□□□□ -1.47
RPS29AP41057 HOM6YJR139C 1080 nt5.84□□□□□ -1.47
RPS29AP41057 PUN1YLR414C 792 nt5.83□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 SSA1YAL005C 1929 nt5.82□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt5.8□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt5.8□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 IMT4tM(CAU)E 72 nt5.8□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 IMT3tM(CAU)J3 72 nt5.8□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 IMT1tM(CAU)O1 72 nt5.8□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 IMT2tM(CAU)P 72 nt5.8□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 YJR018WYJR018W 363 nt5.78□□□□□ -1.48
RPS29AP41057 RKM5YLR137W 1104 nt5.77□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 MNP1YGL068W 585 nt5.76□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 WWM1YFL010C 636 nt5.74□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 IMP2'YIL154C 1041 nt5.73□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 MRPL8YJL063C 717 nt5.73□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 PUS2YGL063W 1113 nt5.72□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 LSM3YLR438C-A 270 nt5.72□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 MOT3YMR070W 1473 nt5.71□□□□□ -1.49
RPS29AP41057 SAH1YER043C 1350 nt5.71□□□□□ -1.5
RPS29AP41057 YLR281CYLR281C 468 nt5.7□□□□□ -1.5
RPS29AP41057 BDH2YAL061W 1254 nt5.69□□□□□ -1.5
RPS29AP41057 SSA3YBL075C 1950 nt5.68□□□□□ -1.5
RPS29AP41057 ADO1YJR105W 1023 nt5.66□□□□□ -1.5
RPS29AP41057 WHI5YOR083W 888 nt5.64□□□□□ -1.51
RPS29AP41057 INM2YDR287W 879 nt5.63□□□□□ -1.51
RPS29AP41057 SRB2YHR041C 633 nt5.6□□□□□ -1.51
RPS29AP41057 DSK2YMR276W 1122 nt5.6□□□□□ -1.51
RPS29AP41057 YCH1YGR203W 447 nt5.59□□□□□ -1.51
RPS29AP41057 PUT4YOR348C 1884 nt5.58□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 PTC2YER089C 1395 nt5.58□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 FMP45YDL222C 930 nt5.57□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 TRM9YML014W 840 nt5.57□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 NAB2YGL122C 1578 nt5.55□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 YJR120WYJR120W 351 nt5.55□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 YBL100CYBL100C 315 nt5.55□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 ARE1YCR048W 1833 nt5.55□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 SUF2tP(AGG)C 72 nt5.54□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 SUF10tP(AGG)N 72 nt5.54□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt5.54□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 DAL1YIR027C 1383 nt5.53□□□□□ -1.52
RPS29AP41057 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt5.49□□□□□ -1.53
RPS29AP41057 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt5.48□□□□□ -1.53
RPS29AP41057 YEL076CYEL076C 651 nt5.48□□□□□ -1.53
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