RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	SNF6	P18888	332 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	SCO1	P23833	295 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
MRPS35	YGR165W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	COX15	P40086	486 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YFR054C	P43622	192 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	ALG13	P53178	202 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RAF1	Q06891	181 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	UIP4	Q08926	304 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	GRE1	Q08969	168 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	MSW1	P04803	379 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YPK2	P18961	677 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	MDH2	P22133	377 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	ERG28	P40030	148 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YGL235W	P53071	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	TOS8	P53147	276 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	PRM8	P53174	237 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	CAB4	P53332	305 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YNR062C	P53748	327 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	MEC1	P38111	2368 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	SNF4	P12904	322 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YCL042W	P25572	119 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	UBC8	P28263	218 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YNL194C	P40169	301 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	OST2	P46964	130 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	COG5	P53951	403 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	PET191	Q02772	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RIB3	Q99258	208 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	NUM1	Q00402	2748 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
MRPS35	YGR165W	COS8	P38723	381 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	CAT5	P41735	233 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	MCM22	P47167	239 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YJR146W	P47174	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	BRR6	P53062	197 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RCE1	Q03530	315 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	SPC3	Q12133	184 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	IRA1	P18963	3092 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	STE18	P18852	110 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	SIP18	P50263	79 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YMD8	Q03697	442 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	HEM25	Q07534	307 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YPL257W	Q08974	193 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS35	YGR165W	DSF1	P0CX08	502 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YNR073C	P0CX09	502 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	OAC1	P32332	324 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YBR220C	P38318	560 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YHL037C	P38733	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YJL016W	P47072	561 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	MIC26	P50087	233 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YDR102C	Q03864	110 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	BNA7	Q04066	261 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	ELP6	Q04868	273 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	URA6	P15700	204 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	CLB6	P32943	380 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	SRY1	P36007	326 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YHR125W	P38831	101 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	PEX17	P40155	199 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YRB2	P40517	327 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	DSK2	P48510	373 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	ERV29	P53337	310 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	PGA1	P53896	198 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	FYV6	P53913	173 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	DIA1	P54005	336 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	CSF1	Q12150	2958 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS35	YGR165W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98

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