Protein–RNA interactions for Protein: Q03530

RCE1, CAAX prenyl protease 2, yeastyeast

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCE1Q03530 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.88■□□□□ 0.45
RCE1Q03530 NSR1YGR159C 1245 nt17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q03530 NOP1YDL014W 984 nt17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q03530 YKL036CYKL036C 393 nt16.12■□□□□ 0.17
RCE1Q03530 MDJ1YFL016C 1536 nt15.67■□□□□ 0.1
RCE1Q03530 Q0297Q0297 156 nt15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q03530 SRX1YKL086W 384 nt15.22■□□□□ 0.03
RCE1Q03530 YJL027CYJL027C 417 nt15.05■□□□□ -0
RCE1Q03530 SCS3YGL126W 1143 nt14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q03530 YCR051WYCR051W 669 nt14.44□□□□□ -0.1
RCE1Q03530 YOL085CYOL085C 342 nt13.94□□□□□ -0.18
RCE1Q03530 DBP2YNL112W 1641 nt13.87□□□□□ -0.19
RCE1Q03530 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.72□□□□□ -0.21
RCE1Q03530 RPP1BYDL130W 321 nt13.7□□□□□ -0.22
RCE1Q03530 PKP1YIL042C 1185 nt13.69□□□□□ -0.22
RCE1Q03530 CCC1YLR220W 969 nt13.57□□□□□ -0.24
RCE1Q03530 YBR190WYBR190W 312 nt13.39□□□□□ -0.27
RCE1Q03530 ATS1YAL020C 1002 nt13.14□□□□□ -0.31
RCE1Q03530 RVS167YDR388W 1449 nt13.13□□□□□ -0.31
RCE1Q03530 SCJ1YMR214W 1134 nt13.11□□□□□ -0.31
RCE1Q03530 RTC3YHR087W 336 nt13.09□□□□□ -0.31
RCE1Q03530 PET122YER153C 765 nt13.05□□□□□ -0.32
RCE1Q03530 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13□□□□□ -0.33
RCE1Q03530 SCR1SCR1 522 nt12.98□□□□□ -0.33
RCE1Q03530 SSA3YBL075C 1950 nt12.76□□□□□ -0.37
RCE1Q03530 RRN5YLR141W 1092 nt12.69□□□□□ -0.38
RCE1Q03530 SHR5YOL110W 714 nt12.66□□□□□ -0.38
RCE1Q03530 YDJ1YNL064C 1230 nt12.6□□□□□ -0.39
RCE1Q03530 RSB1YOR049C 1065 nt12.45□□□□□ -0.42
RCE1Q03530 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.44□□□□□ -0.42
RCE1Q03530 GAR1YHR089C 618 nt12.28□□□□□ -0.44
RCE1Q03530 URN1YPR152C 1398 nt12.26□□□□□ -0.45
RCE1Q03530 DEP1YAL013W 1218 nt12.24□□□□□ -0.45
RCE1Q03530 PST2YDR032C 597 nt12.16□□□□□ -0.46
RCE1Q03530 RPN10YHR200W 807 nt12.15□□□□□ -0.46
RCE1Q03530 YNL208WYNL208W 600 nt12.11□□□□□ -0.47
RCE1Q03530 OPI9YLR338W 858 nt12.09□□□□□ -0.47
RCE1Q03530 PUT4YOR348C 1884 nt12.08□□□□□ -0.48
RCE1Q03530 SAH1YER043C 1350 nt11.97□□□□□ -0.49
RCE1Q03530 TIR1YER011W 765 nt11.88□□□□□ -0.51
RCE1Q03530 ARE1YCR048W 1833 nt11.88□□□□□ -0.51
RCE1Q03530 PUN1YLR414C 792 nt11.76□□□□□ -0.53
RCE1Q03530 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.73□□□□□ -0.53
RCE1Q03530 YKL097CYKL097C 411 nt11.72□□□□□ -0.53
RCE1Q03530 YJR018WYJR018W 363 nt11.71□□□□□ -0.53
RCE1Q03530 POA1YBR022W 534 nt11.71□□□□□ -0.53
RCE1Q03530 SSA1YAL005C 1929 nt11.7□□□□□ -0.54
RCE1Q03530 SHU1YHL006C 453 nt11.64□□□□□ -0.55
RCE1Q03530 PTC2YER089C 1395 nt11.56□□□□□ -0.56
RCE1Q03530 RPP2BYDR382W 333 nt11.52□□□□□ -0.57
RCE1Q03530 YJR120WYJR120W 351 nt11.49□□□□□ -0.57
RCE1Q03530 BUD23YCR047C 828 nt11.47□□□□□ -0.57
RCE1Q03530 SRB2YHR041C 633 nt11.46□□□□□ -0.57
RCE1Q03530 BSC6YOL137W 1494 nt11.44□□□□□ -0.58
RCE1Q03530 NAB2YGL122C 1578 nt11.44□□□□□ -0.58
RCE1Q03530 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.42□□□□□ -0.58
RCE1Q03530 WWM1YFL010C 636 nt11.34□□□□□ -0.59
RCE1Q03530 YGR021WYGR021W 873 nt11.34□□□□□ -0.59
RCE1Q03530 INM2YDR287W 879 nt11.32□□□□□ -0.6
RCE1Q03530 SPT5YML010W 3192 nt11.32□□□□□ -0.6
RCE1Q03530 DAL1YIR027C 1383 nt11.29□□□□□ -0.6
RCE1Q03530 BDH2YAL061W 1254 nt11.28□□□□□ -0.6
RCE1Q03530 HOM6YJR139C 1080 nt11.26□□□□□ -0.61
RCE1Q03530 FPR4YLR449W 1179 nt11.25□□□□□ -0.61
RCE1Q03530 FIS1YIL065C 468 nt11.24□□□□□ -0.61
RCE1Q03530 SSA4YER103W 1929 nt11.21□□□□□ -0.61
RCE1Q03530 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.2□□□□□ -0.62
RCE1Q03530 MNP1YGL068W 585 nt11.19□□□□□ -0.62
RCE1Q03530 YBL100CYBL100C 315 nt11.19□□□□□ -0.62
RCE1Q03530 YOR139CYOR139C 393 nt11.19□□□□□ -0.62
RCE1Q03530 PHO4YFR034C 939 nt11.16□□□□□ -0.62
RCE1Q03530 LSM3YLR438C-A 270 nt11.16□□□□□ -0.62
RCE1Q03530 NPL3YDR432W 1245 nt11.14□□□□□ -0.63
RCE1Q03530 RKM5YLR137W 1104 nt11.11□□□□□ -0.63
RCE1Q03530 YOL037CYOL037C 354 nt11.09□□□□□ -0.63
RCE1Q03530 TRM9YML014W 840 nt11.07□□□□□ -0.64
RCE1Q03530 FUN26YAL022C 1554 nt11.06□□□□□ -0.64
RCE1Q03530 CCT6YDR188W 1641 nt10.95□□□□□ -0.66
RCE1Q03530 YPS1YLR120C 1710 nt10.93□□□□□ -0.66
RCE1Q03530 ALF1YNL148C 765 nt10.91□□□□□ -0.66
RCE1Q03530 BDF1YLR399C 2061 nt10.89□□□□□ -0.67
RCE1Q03530 YDR095CYDR095C 411 nt10.88□□□□□ -0.67
RCE1Q03530 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.87□□□□□ -0.67
RCE1Q03530 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.87□□□□□ -0.67
RCE1Q03530 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.82□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 YLR281CYLR281C 468 nt10.8□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.78□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.78□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.78□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.78□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.78□□□□□ -0.68
RCE1Q03530 PAC11YDR488C 1602 nt10.76□□□□□ -0.69
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