Protein–RNA interactions for Protein: P53147

TOS8, Homeobox protein TOS8, yeastyeast

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOS8P53147 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.11■□□□□ 0.17
TOS8P53147 NSR1YGR159C 1245 nt16.07■□□□□ 0.16
TOS8P53147 NOP1YDL014W 984 nt15.74■□□□□ 0.11
TOS8P53147 YKL036CYKL036C 393 nt14.49□□□□□ -0.09
TOS8P53147 MDJ1YFL016C 1536 nt14.19□□□□□ -0.14
TOS8P53147 Q0297Q0297 156 nt13.77□□□□□ -0.21
TOS8P53147 SRX1YKL086W 384 nt13.73□□□□□ -0.21
TOS8P53147 YJL027CYJL027C 417 nt13.5□□□□□ -0.25
TOS8P53147 SCS3YGL126W 1143 nt13.16□□□□□ -0.3
TOS8P53147 YCR051WYCR051W 669 nt12.97□□□□□ -0.33
TOS8P53147 DBP2YNL112W 1641 nt12.56□□□□□ -0.4
TOS8P53147 YOL085CYOL085C 342 nt12.53□□□□□ -0.4
TOS8P53147 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.41□□□□□ -0.42
TOS8P53147 RPP1BYDL130W 321 nt12.34□□□□□ -0.43
TOS8P53147 PKP1YIL042C 1185 nt12.27□□□□□ -0.45
TOS8P53147 CCC1YLR220W 969 nt12.2□□□□□ -0.46
TOS8P53147 YBR190WYBR190W 312 nt12.17□□□□□ -0.46
TOS8P53147 RVS167YDR388W 1449 nt11.89□□□□□ -0.51
TOS8P53147 RTC3YHR087W 336 nt11.85□□□□□ -0.51
TOS8P53147 ATS1YAL020C 1002 nt11.77□□□□□ -0.53
TOS8P53147 SCJ1YMR214W 1134 nt11.76□□□□□ -0.53
TOS8P53147 PET122YER153C 765 nt11.75□□□□□ -0.53
TOS8P53147 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.72□□□□□ -0.53
TOS8P53147 SCR1SCR1 522 nt11.68□□□□□ -0.54
TOS8P53147 SHR5YOL110W 714 nt11.47□□□□□ -0.57
TOS8P53147 RRN5YLR141W 1092 nt11.39□□□□□ -0.59
TOS8P53147 YDJ1YNL064C 1230 nt11.38□□□□□ -0.59
TOS8P53147 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.19□□□□□ -0.62
TOS8P53147 RSB1YOR049C 1065 nt11.17□□□□□ -0.62
TOS8P53147 URN1YPR152C 1398 nt11.1□□□□□ -0.63
TOS8P53147 GAR1YHR089C 618 nt11.05□□□□□ -0.64
TOS8P53147 DEP1YAL013W 1218 nt11.04□□□□□ -0.64
TOS8P53147 RPN10YHR200W 807 nt11.01□□□□□ -0.65
TOS8P53147 PUT4YOR348C 1884 nt11.01□□□□□ -0.65
TOS8P53147 OPI9YLR338W 858 nt10.97□□□□□ -0.65
TOS8P53147 YNL208WYNL208W 600 nt10.96□□□□□ -0.65
TOS8P53147 PST2YDR032C 597 nt10.9□□□□□ -0.66
TOS8P53147 SAH1YER043C 1350 nt10.85□□□□□ -0.67
TOS8P53147 ARE1YCR048W 1833 nt10.8□□□□□ -0.68
TOS8P53147 TIR1YER011W 765 nt10.71□□□□□ -0.69
TOS8P53147 PUN1YLR414C 792 nt10.68□□□□□ -0.7
TOS8P53147 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.67□□□□□ -0.7
TOS8P53147 POA1YBR022W 534 nt10.63□□□□□ -0.71
TOS8P53147 YJR018WYJR018W 363 nt10.6□□□□□ -0.71
TOS8P53147 SSA1YAL005C 1929 nt10.55□□□□□ -0.72
TOS8P53147 PTC2YER089C 1395 nt10.49□□□□□ -0.73
TOS8P53147 YKL097CYKL097C 411 nt10.48□□□□□ -0.73
TOS8P53147 RPP2BYDR382W 333 nt10.43□□□□□ -0.74
TOS8P53147 SHU1YHL006C 453 nt10.43□□□□□ -0.74
TOS8P53147 BSC6YOL137W 1494 nt10.42□□□□□ -0.74
TOS8P53147 YJR120WYJR120W 351 nt10.41□□□□□ -0.74
TOS8P53147 BUD23YCR047C 828 nt10.4□□□□□ -0.74
TOS8P53147 NAB2YGL122C 1578 nt10.39□□□□□ -0.75
TOS8P53147 SSA3YBL075C 1950 nt10.38□□□□□ -0.75
TOS8P53147 SRB2YHR041C 633 nt10.33□□□□□ -0.76
TOS8P53147 INM2YDR287W 879 nt10.26□□□□□ -0.77
TOS8P53147 DAL1YIR027C 1383 nt10.26□□□□□ -0.77
TOS8P53147 YGR021WYGR021W 873 nt10.24□□□□□ -0.77
TOS8P53147 FIS1YIL065C 468 nt10.24□□□□□ -0.77
TOS8P53147 BDH2YAL061W 1254 nt10.21□□□□□ -0.77
TOS8P53147 WWM1YFL010C 636 nt10.2□□□□□ -0.78
TOS8P53147 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.2□□□□□ -0.78
TOS8P53147 HOM6YJR139C 1080 nt10.16□□□□□ -0.78
TOS8P53147 FPR4YLR449W 1179 nt10.16□□□□□ -0.78
TOS8P53147 PHO4YFR034C 939 nt10.14□□□□□ -0.79
TOS8P53147 YBL100CYBL100C 315 nt10.14□□□□□ -0.79
TOS8P53147 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.12□□□□□ -0.79
TOS8P53147 LSM3YLR438C-A 270 nt10.11□□□□□ -0.79
TOS8P53147 MNP1YGL068W 585 nt10.05□□□□□ -0.8
TOS8P53147 YOR139CYOR139C 393 nt10.02□□□□□ -0.81
TOS8P53147 RKM5YLR137W 1104 nt10.01□□□□□ -0.81
TOS8P53147 FUN26YAL022C 1554 nt10.01□□□□□ -0.81
TOS8P53147 Q0182Q0182 405 nt10□□□□□ -0.81
TOS8P53147 YOL037CYOL037C 354 nt10□□□□□ -0.81
TOS8P53147 TRM9YML014W 840 nt9.99□□□□□ -0.81
TOS8P53147 NPL3YDR432W 1245 nt9.98□□□□□ -0.81
TOS8P53147 YPS1YLR120C 1710 nt9.94□□□□□ -0.82
TOS8P53147 SPT5YML010W 3192 nt9.93□□□□□ -0.82
TOS8P53147 CCT6YDR188W 1641 nt9.93□□□□□ -0.82
TOS8P53147 YDR095CYDR095C 411 nt9.9□□□□□ -0.82
TOS8P53147 ALF1YNL148C 765 nt9.88□□□□□ -0.83
TOS8P53147 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.86□□□□□ -0.83
TOS8P53147 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.86□□□□□ -0.83
TOS8P53147 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.82□□□□□ -0.84
TOS8P53147 MEP2YNL142W 1500 nt9.81□□□□□ -0.84
TOS8P53147 SIS1YNL007C 1059 nt9.73□□□□□ -0.85
TOS8P53147 YLR281CYLR281C 468 nt9.71□□□□□ -0.86
TOS8P53147 RPP2AYOL039W 321 nt9.71□□□□□ -0.86
TOS8P53147 WHI5YOR083W 888 nt9.66□□□□□ -0.86
TOS8P53147 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.64□□□□□ -0.87
TOS8P53147 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.64□□□□□ -0.87
TOS8P53147 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.64□□□□□ -0.87
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