Protein–RNA interactions for Protein: Q08969

GRE1, Protein GRE1, yeastyeast

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GRE1Q08969 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.32■□□□□ 0.52
GRE1Q08969 NSR1YGR159C 1245 nt18.1■□□□□ 0.49
GRE1Q08969 NOP1YDL014W 984 nt17.78■□□□□ 0.44
GRE1Q08969 YKL036CYKL036C 393 nt16.4■□□□□ 0.22
GRE1Q08969 MDJ1YFL016C 1536 nt16.11■□□□□ 0.17
GRE1Q08969 Q0297Q0297 156 nt15.48■□□□□ 0.07
GRE1Q08969 SRX1YKL086W 384 nt15.48■□□□□ 0.07
GRE1Q08969 YJL027CYJL027C 417 nt15.37■□□□□ 0.05
GRE1Q08969 SCS3YGL126W 1143 nt14.9□□□□□ -0.02
GRE1Q08969 YCR051WYCR051W 669 nt14.81□□□□□ -0.04
GRE1Q08969 YOL085CYOL085C 342 nt14.19□□□□□ -0.14
GRE1Q08969 DBP2YNL112W 1641 nt14.16□□□□□ -0.14
GRE1Q08969 PKP1YIL042C 1185 nt14.05□□□□□ -0.16
GRE1Q08969 CCC1YLR220W 969 nt13.99□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.97□□□□□ -0.17
GRE1Q08969 RPP1BYDL130W 321 nt13.94□□□□□ -0.18
GRE1Q08969 YBR190WYBR190W 312 nt13.69□□□□□ -0.22
GRE1Q08969 RTC3YHR087W 336 nt13.52□□□□□ -0.25
GRE1Q08969 RVS167YDR388W 1449 nt13.45□□□□□ -0.26
GRE1Q08969 ATS1YAL020C 1002 nt13.34□□□□□ -0.27
GRE1Q08969 PET122YER153C 765 nt13.32□□□□□ -0.28
GRE1Q08969 SCJ1YMR214W 1134 nt13.29□□□□□ -0.28
GRE1Q08969 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.27□□□□□ -0.29
GRE1Q08969 SCR1SCR1 522 nt13.25□□□□□ -0.29
GRE1Q08969 RRN5YLR141W 1092 nt12.96□□□□□ -0.33
GRE1Q08969 SHR5YOL110W 714 nt12.92□□□□□ -0.34
GRE1Q08969 YDJ1YNL064C 1230 nt12.78□□□□□ -0.36
GRE1Q08969 RSB1YOR049C 1065 nt12.75□□□□□ -0.37
GRE1Q08969 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.68□□□□□ -0.38
GRE1Q08969 DEP1YAL013W 1218 nt12.65□□□□□ -0.38
GRE1Q08969 GAR1YHR089C 618 nt12.61□□□□□ -0.39
GRE1Q08969 URN1YPR152C 1398 nt12.59□□□□□ -0.39
GRE1Q08969 RPN10YHR200W 807 nt12.42□□□□□ -0.42
GRE1Q08969 YNL208WYNL208W 600 nt12.38□□□□□ -0.43
GRE1Q08969 PUT4YOR348C 1884 nt12.37□□□□□ -0.43
GRE1Q08969 OPI9YLR338W 858 nt12.34□□□□□ -0.43
GRE1Q08969 SAH1YER043C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
GRE1Q08969 PST2YDR032C 597 nt12.31□□□□□ -0.44
GRE1Q08969 ARE1YCR048W 1833 nt12.16□□□□□ -0.46
GRE1Q08969 TIR1YER011W 765 nt12.14□□□□□ -0.47
GRE1Q08969 POA1YBR022W 534 nt12.09□□□□□ -0.47
GRE1Q08969 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.08□□□□□ -0.48
GRE1Q08969 PUN1YLR414C 792 nt12.01□□□□□ -0.49
GRE1Q08969 YJR018WYJR018W 363 nt12□□□□□ -0.49
GRE1Q08969 SSA1YAL005C 1929 nt11.96□□□□□ -0.5
GRE1Q08969 SSA3YBL075C 1950 nt11.94□□□□□ -0.5
GRE1Q08969 YKL097CYKL097C 411 nt11.91□□□□□ -0.5
GRE1Q08969 PTC2YER089C 1395 nt11.9□□□□□ -0.5
GRE1Q08969 BUD23YCR047C 828 nt11.88□□□□□ -0.51
GRE1Q08969 SHU1YHL006C 453 nt11.84□□□□□ -0.51
GRE1Q08969 RPP2BYDR382W 333 nt11.81□□□□□ -0.52
GRE1Q08969 BSC6YOL137W 1494 nt11.77□□□□□ -0.52
GRE1Q08969 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.74□□□□□ -0.53
GRE1Q08969 SRB2YHR041C 633 nt11.72□□□□□ -0.53
GRE1Q08969 NAB2YGL122C 1578 nt11.71□□□□□ -0.53
GRE1Q08969 YJR120WYJR120W 351 nt11.7□□□□□ -0.54
GRE1Q08969 FPR4YLR449W 1179 nt11.67□□□□□ -0.54
GRE1Q08969 WWM1YFL010C 636 nt11.61□□□□□ -0.55
GRE1Q08969 INM2YDR287W 879 nt11.56□□□□□ -0.56
GRE1Q08969 DAL1YIR027C 1383 nt11.55□□□□□ -0.56
GRE1Q08969 YGR021WYGR021W 873 nt11.53□□□□□ -0.56
GRE1Q08969 BDH2YAL061W 1254 nt11.51□□□□□ -0.57
GRE1Q08969 FIS1YIL065C 468 nt11.48□□□□□ -0.57
GRE1Q08969 YBL100CYBL100C 315 nt11.47□□□□□ -0.57
GRE1Q08969 MNP1YGL068W 585 nt11.45□□□□□ -0.58
GRE1Q08969 HOM6YJR139C 1080 nt11.45□□□□□ -0.58
GRE1Q08969 PHO4YFR034C 939 nt11.44□□□□□ -0.58
GRE1Q08969 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.38□□□□□ -0.59
GRE1Q08969 NPL3YDR432W 1245 nt11.36□□□□□ -0.59
GRE1Q08969 TRM9YML014W 840 nt11.35□□□□□ -0.59
GRE1Q08969 YOR139CYOR139C 393 nt11.35□□□□□ -0.59
GRE1Q08969 LSM3YLR438C-A 270 nt11.34□□□□□ -0.59
GRE1Q08969 FUN26YAL022C 1554 nt11.33□□□□□ -0.6
GRE1Q08969 RKM5YLR137W 1104 nt11.31□□□□□ -0.6
GRE1Q08969 ALF1YNL148C 765 nt11.24□□□□□ -0.61
GRE1Q08969 YOL037CYOL037C 354 nt11.23□□□□□ -0.61
GRE1Q08969 YPS1YLR120C 1710 nt11.18□□□□□ -0.62
GRE1Q08969 SPT5YML010W 3192 nt11.16□□□□□ -0.62
GRE1Q08969 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.16□□□□□ -0.62
GRE1Q08969 CCT6YDR188W 1641 nt11.14□□□□□ -0.63
GRE1Q08969 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.12□□□□□ -0.63
GRE1Q08969 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.12□□□□□ -0.63
GRE1Q08969 YDR095CYDR095C 411 nt11.1□□□□□ -0.63
GRE1Q08969 MEP2YNL142W 1500 nt11.02□□□□□ -0.65
GRE1Q08969 WHI5YOR083W 888 nt10.97□□□□□ -0.65
GRE1Q08969 YJL152WYJL152W 360 nt10.96□□□□□ -0.65
GRE1Q08969 YLR281CYLR281C 468 nt10.96□□□□□ -0.65
GRE1Q08969 RPP2AYOL039W 321 nt10.95□□□□□ -0.66
GRE1Q08969 FPS1YLL043W 2010 nt10.95□□□□□ -0.66
GRE1Q08969 PUS2YGL063W 1113 nt10.94□□□□□ -0.66
GRE1Q08969 SIS1YNL007C 1059 nt10.94□□□□□ -0.66
GRE1Q08969 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.93□□□□□ -0.66
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