Protein–RNA interactions for Protein: Q03697

YMD8, Putative nucleotide-sugar transporter YMD8, yeastyeast

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMD8Q03697 NSR1YGR159C 1245 nt18.64■□□□□ 0.57
YMD8Q03697 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.36■□□□□ 0.53
YMD8Q03697 NOP1YDL014W 984 nt17.69■□□□□ 0.42
YMD8Q03697 MDJ1YFL016C 1536 nt16.96■□□□□ 0.3
YMD8Q03697 YKL036CYKL036C 393 nt15.91■□□□□ 0.14
YMD8Q03697 YJL027CYJL027C 417 nt15.61■□□□□ 0.09
YMD8Q03697 SRX1YKL086W 384 nt15.45■□□□□ 0.06
YMD8Q03697 Q0297Q0297 156 nt15.35■□□□□ 0.05
YMD8Q03697 DBP2YNL112W 1641 nt14.84□□□□□ -0.03
YMD8Q03697 YCR051WYCR051W 669 nt14.61□□□□□ -0.07
YMD8Q03697 YBR190WYBR190W 312 nt14.58□□□□□ -0.08
YMD8Q03697 SCS3YGL126W 1143 nt14.25□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 RTC3YHR087W 336 nt14.22□□□□□ -0.13
YMD8Q03697 CCC1YLR220W 969 nt14.06□□□□□ -0.16
YMD8Q03697 RVS167YDR388W 1449 nt13.84□□□□□ -0.19
YMD8Q03697 YOL085CYOL085C 342 nt13.8□□□□□ -0.2
YMD8Q03697 RPP1BYDL130W 321 nt13.77□□□□□ -0.21
YMD8Q03697 SSA3YBL075C 1950 nt13.72□□□□□ -0.21
YMD8Q03697 SCJ1YMR214W 1134 nt13.69□□□□□ -0.22
YMD8Q03697 PKP1YIL042C 1185 nt13.62□□□□□ -0.23
YMD8Q03697 PUT4YOR348C 1884 nt13.57□□□□□ -0.24
YMD8Q03697 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.31□□□□□ -0.28
YMD8Q03697 SHR5YOL110W 714 nt13.26□□□□□ -0.29
YMD8Q03697 PET122YER153C 765 nt13.2□□□□□ -0.3
YMD8Q03697 ARE1YCR048W 1833 nt13.19□□□□□ -0.3
YMD8Q03697 URN1YPR152C 1398 nt13.16□□□□□ -0.3
YMD8Q03697 POA1YBR022W 534 nt13.1□□□□□ -0.31
YMD8Q03697 SAH1YER043C 1350 nt13.08□□□□□ -0.31
YMD8Q03697 OPI9YLR338W 858 nt13.07□□□□□ -0.32
YMD8Q03697 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.02□□□□□ -0.33
YMD8Q03697 DEP1YAL013W 1218 nt13.01□□□□□ -0.33
YMD8Q03697 SCR1SCR1 522 nt12.93□□□□□ -0.34
YMD8Q03697 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
YMD8Q03697 YDJ1YNL064C 1230 nt12.9□□□□□ -0.34
YMD8Q03697 RPN10YHR200W 807 nt12.87□□□□□ -0.35
YMD8Q03697 YNL208WYNL208W 600 nt12.78□□□□□ -0.36
YMD8Q03697 RRN5YLR141W 1092 nt12.77□□□□□ -0.37
YMD8Q03697 PUN1YLR414C 792 nt12.68□□□□□ -0.38
YMD8Q03697 BUD23YCR047C 828 nt12.67□□□□□ -0.38
YMD8Q03697 GAR1YHR089C 618 nt12.66□□□□□ -0.38
YMD8Q03697 SPT5YML010W 3192 nt12.65□□□□□ -0.39
YMD8Q03697 ATS1YAL020C 1002 nt12.63□□□□□ -0.39
YMD8Q03697 PTC2YER089C 1395 nt12.59□□□□□ -0.39
YMD8Q03697 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.52□□□□□ -0.41
YMD8Q03697 YJR018WYJR018W 363 nt12.52□□□□□ -0.41
YMD8Q03697 NAB2YGL122C 1578 nt12.49□□□□□ -0.41
YMD8Q03697 SSA4YER103W 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
YMD8Q03697 RSB1YOR049C 1065 nt12.37□□□□□ -0.43
YMD8Q03697 FIS1YIL065C 468 nt12.28□□□□□ -0.44
YMD8Q03697 TIR1YER011W 765 nt12.26□□□□□ -0.45
YMD8Q03697 YJR120WYJR120W 351 nt12.25□□□□□ -0.45
YMD8Q03697 DAL1YIR027C 1383 nt12.25□□□□□ -0.45
YMD8Q03697 SSA1YAL005C 1929 nt12.21□□□□□ -0.46
YMD8Q03697 FPR4YLR449W 1179 nt12.19□□□□□ -0.46
YMD8Q03697 MEP2YNL142W 1500 nt12.17□□□□□ -0.46
YMD8Q03697 RPP2BYDR382W 333 nt12.15□□□□□ -0.46
YMD8Q03697 INM2YDR287W 879 nt12.14□□□□□ -0.47
YMD8Q03697 PHO4YFR034C 939 nt12.13□□□□□ -0.47
YMD8Q03697 YPS1YLR120C 1710 nt12.06□□□□□ -0.48
YMD8Q03697 DCW1YKL046C 1350 nt11.96□□□□□ -0.49
YMD8Q03697 BDF1YLR399C 2061 nt11.96□□□□□ -0.5
YMD8Q03697 YBL100CYBL100C 315 nt11.95□□□□□ -0.5
YMD8Q03697 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.94□□□□□ -0.5
YMD8Q03697 YDR095CYDR095C 411 nt11.92□□□□□ -0.5
YMD8Q03697 SRB2YHR041C 633 nt11.92□□□□□ -0.5
YMD8Q03697 BDH2YAL061W 1254 nt11.84□□□□□ -0.51
YMD8Q03697 TAT1YBR069C 1860 nt11.8□□□□□ -0.52
YMD8Q03697 EMI2YDR516C 1503 nt11.8□□□□□ -0.52
YMD8Q03697 FUN26YAL022C 1554 nt11.79□□□□□ -0.52
YMD8Q03697 PST2YDR032C 597 nt11.77□□□□□ -0.53
YMD8Q03697 YMR090WYMR090W 684 nt11.75□□□□□ -0.53
YMD8Q03697 YBR220CYBR220C 1683 nt11.73□□□□□ -0.53
YMD8Q03697 ALF1YNL148C 765 nt11.71□□□□□ -0.53
YMD8Q03697 PTP1YDL230W 1008 nt11.69□□□□□ -0.54
YMD8Q03697 TRM9YML014W 840 nt11.69□□□□□ -0.54
YMD8Q03697 RPP2AYOL039W 321 nt11.69□□□□□ -0.54
YMD8Q03697 YDL221WYDL221W 552 nt11.68□□□□□ -0.54
YMD8Q03697 CAC2YML102W 1407 nt11.67□□□□□ -0.54
YMD8Q03697 WWM1YFL010C 636 nt11.64□□□□□ -0.55
YMD8Q03697 LSM3YLR438C-A 270 nt11.62□□□□□ -0.55
YMD8Q03697 SDH1YKL148C 1923 nt11.62□□□□□ -0.55
YMD8Q03697 CCT6YDR188W 1641 nt11.6□□□□□ -0.55
YMD8Q03697 SIS1YNL007C 1059 nt11.55□□□□□ -0.56
YMD8Q03697 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YMD8Q03697 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.53□□□□□ -0.56
YMD8Q03697 IRC15YPL017C 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
YMD8Q03697 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
YMD8Q03697 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.48□□□□□ -0.57
YMD8Q03697 YGR021WYGR021W 873 nt11.45□□□□□ -0.58
YMD8Q03697 PAC11YDR488C 1602 nt11.43□□□□□ -0.58
YMD8Q03697 GIS3YLR094C 1509 nt11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms