RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C ADK1P07170 222 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C MRP1P10662 321 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YPK2P18961 677 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C GPI12P23797 304 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PBN1P25580 416 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RPB9P27999 122 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.37□□□□□ -1.87not detected
PFA4YOL003C KRE6P32486 720 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C MRPL3P36516 390 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C FET3P38993 636 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C ICE2P40499 491 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C CAT5P41735 233 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RPE1P46969 238 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YGL235WP53071 178 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C FMP48P53233 369 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YPR127WQ06494 345 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YPR172WQ06608 200 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C ASR1Q06834 288 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YNG1Q08465 219 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RTR2Q12378 196 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PSF1Q12488 208 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C FMP16Q12497 93 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C BLM10P43583 2143 aa3.37□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SEN2P16658 377 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PET18P25362 215 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PAU2P32612 120 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SFK1P35735 353 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YKL162CP36052 402 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RPS27BP38711 82 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SSO2P39926 295 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C APS3P47064 194 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C AIM25P47140 327 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YPR195CQ06594 109 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C HRT1Q08273 121 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C ATG31Q12421 196 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RDI1Q12434 202 aa3.36□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C QCR7P00128 127 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C COX9P07255 59 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C ERG24P32462 438 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C RRF1P38771 230 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PET8P38921 284 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SNX4P47057 423 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C TRM9P49957 279 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C OKP1P53298 406 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C DID2P69771 204 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C NCE101Q02820 53 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C CAB5Q03941 241 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C VBA1Q04301 562 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C COX20Q04935 205 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YLR283WQ05867 314 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C DCR2Q05924 578 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C BTS1Q12051 335 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa3.35□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C CUP2P15315 225 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C CPT1P17898 393 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C CWP1P28319 239 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C GPX1P36014 167 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YMR262WP38430 313 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C NSG1P38837 291 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YHR180WP38868 163 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SLM1P40485 686 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C TIR3P40552 269 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C BRR6P53062 197 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C JAC1P53193 184 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YGR042WP53227 271 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C ASI3P53983 676 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PEX30Q06169 523 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C KEI1Q06346 221 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YLR031WQ07978 186 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C FEX1Q08913 375 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C REX3Q12090 404 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C YPS3Q12303 508 aa3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PFA4YOL003C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C HFA1P32874 2273 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C DSF1P0CX08 502 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YNR073CP0CX09 502 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C STE18P18852 110 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C CKS1P20486 150 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C MAG1P22134 296 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YFR054CP43622 192 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C CCC1P47818 322 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YGL204CP53089 101 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YNR066CP53752 436 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C YLR460CP54007 376 aa3.33□□□□□ -1.88
PFA4YOL003C BUD25P85052 153 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms