Protein–RNA interactions for Protein: Q12051

BTS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, yeastyeast

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BTS1Q12051 NSR1YGR159C 1245 nt18.37■□□□□ 0.53
BTS1Q12051 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.37■□□□□ 0.53
BTS1Q12051 NOP1YDL014W 984 nt17.82■□□□□ 0.44
BTS1Q12051 YKL036CYKL036C 393 nt16.38■□□□□ 0.21
BTS1Q12051 MDJ1YFL016C 1536 nt16.38■□□□□ 0.21
BTS1Q12051 Q0297Q0297 156 nt15.62■□□□□ 0.09
BTS1Q12051 SRX1YKL086W 384 nt15.6■□□□□ 0.09
BTS1Q12051 YJL027CYJL027C 417 nt15.26■□□□□ 0.03
BTS1Q12051 SCS3YGL126W 1143 nt14.88□□□□□ -0.03
BTS1Q12051 YCR051WYCR051W 669 nt14.76□□□□□ -0.05
BTS1Q12051 DBP2YNL112W 1641 nt14.51□□□□□ -0.09
BTS1Q12051 YOL085CYOL085C 342 nt14.21□□□□□ -0.13
BTS1Q12051 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
BTS1Q12051 RPP1BYDL130W 321 nt14□□□□□ -0.17
BTS1Q12051 YBR190WYBR190W 312 nt14□□□□□ -0.17
BTS1Q12051 PKP1YIL042C 1185 nt13.98□□□□□ -0.17
BTS1Q12051 CCC1YLR220W 969 nt13.98□□□□□ -0.17
BTS1Q12051 RTC3YHR087W 336 nt13.64□□□□□ -0.23
BTS1Q12051 RVS167YDR388W 1449 nt13.54□□□□□ -0.24
BTS1Q12051 SCJ1YMR214W 1134 nt13.52□□□□□ -0.25
BTS1Q12051 PET122YER153C 765 nt13.39□□□□□ -0.27
BTS1Q12051 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.36□□□□□ -0.27
BTS1Q12051 ATS1YAL020C 1002 nt13.28□□□□□ -0.28
BTS1Q12051 SSA3YBL075C 1950 nt13.2□□□□□ -0.3
BTS1Q12051 SCR1SCR1 522 nt13.18□□□□□ -0.3
BTS1Q12051 SHR5YOL110W 714 nt13.09□□□□□ -0.31
BTS1Q12051 RRN5YLR141W 1092 nt12.99□□□□□ -0.33
BTS1Q12051 YDJ1YNL064C 1230 nt12.94□□□□□ -0.34
BTS1Q12051 PUT4YOR348C 1884 nt12.86□□□□□ -0.35
BTS1Q12051 URN1YPR152C 1398 nt12.76□□□□□ -0.37
BTS1Q12051 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.74□□□□□ -0.37
BTS1Q12051 DEP1YAL013W 1218 nt12.72□□□□□ -0.37
BTS1Q12051 RSB1YOR049C 1065 nt12.66□□□□□ -0.38
BTS1Q12051 GAR1YHR089C 618 nt12.64□□□□□ -0.39
BTS1Q12051 OPI9YLR338W 858 nt12.62□□□□□ -0.39
BTS1Q12051 ARE1YCR048W 1833 nt12.55□□□□□ -0.4
BTS1Q12051 SAH1YER043C 1350 nt12.55□□□□□ -0.4
BTS1Q12051 RPN10YHR200W 807 nt12.53□□□□□ -0.4
BTS1Q12051 YNL208WYNL208W 600 nt12.52□□□□□ -0.41
BTS1Q12051 POA1YBR022W 534 nt12.44□□□□□ -0.42
BTS1Q12051 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.35□□□□□ -0.43
BTS1Q12051 PST2YDR032C 597 nt12.34□□□□□ -0.43
BTS1Q12051 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.45
BTS1Q12051 TIR1YER011W 765 nt12.23□□□□□ -0.45
BTS1Q12051 PUN1YLR414C 792 nt12.23□□□□□ -0.45
BTS1Q12051 YJR018WYJR018W 363 nt12.18□□□□□ -0.46
BTS1Q12051 SSA1YAL005C 1929 nt12.12□□□□□ -0.47
BTS1Q12051 PTC2YER089C 1395 nt12.1□□□□□ -0.47
BTS1Q12051 BUD23YCR047C 828 nt12.05□□□□□ -0.48
BTS1Q12051 YJR120WYJR120W 351 nt12.03□□□□□ -0.48
BTS1Q12051 SPT5YML010W 3192 nt11.97□□□□□ -0.49
BTS1Q12051 NAB2YGL122C 1578 nt11.96□□□□□ -0.5
BTS1Q12051 SRB2YHR041C 633 nt11.94□□□□□ -0.5
BTS1Q12051 RPP2BYDR382W 333 nt11.87□□□□□ -0.51
BTS1Q12051 SSA4YER103W 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
BTS1Q12051 SHU1YHL006C 453 nt11.84□□□□□ -0.51
BTS1Q12051 FIS1YIL065C 468 nt11.81□□□□□ -0.52
BTS1Q12051 DAL1YIR027C 1383 nt11.79□□□□□ -0.52
BTS1Q12051 YKL097CYKL097C 411 nt11.76□□□□□ -0.53
BTS1Q12051 INM2YDR287W 879 nt11.75□□□□□ -0.53
BTS1Q12051 FPR4YLR449W 1179 nt11.7□□□□□ -0.54
BTS1Q12051 WWM1YFL010C 636 nt11.68□□□□□ -0.54
BTS1Q12051 PHO4YFR034C 939 nt11.68□□□□□ -0.54
BTS1Q12051 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.67□□□□□ -0.54
BTS1Q12051 BDH2YAL061W 1254 nt11.66□□□□□ -0.54
BTS1Q12051 YBL100CYBL100C 315 nt11.62□□□□□ -0.55
BTS1Q12051 MEP2YNL142W 1500 nt11.57□□□□□ -0.56
BTS1Q12051 YGR021WYGR021W 873 nt11.57□□□□□ -0.56
BTS1Q12051 HOM6YJR139C 1080 nt11.56□□□□□ -0.56
BTS1Q12051 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.5□□□□□ -0.57
BTS1Q12051 LSM3YLR438C-A 270 nt11.5□□□□□ -0.57
BTS1Q12051 FUN26YAL022C 1554 nt11.5□□□□□ -0.57
BTS1Q12051 YPS1YLR120C 1710 nt11.49□□□□□ -0.57
BTS1Q12051 MNP1YGL068W 585 nt11.47□□□□□ -0.57
BTS1Q12051 TRM9YML014W 840 nt11.43□□□□□ -0.58
BTS1Q12051 YDR095CYDR095C 411 nt11.41□□□□□ -0.58
BTS1Q12051 BDF1YLR399C 2061 nt11.4□□□□□ -0.58
BTS1Q12051 RKM5YLR137W 1104 nt11.38□□□□□ -0.59
BTS1Q12051 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.36□□□□□ -0.59
BTS1Q12051 CCT6YDR188W 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
BTS1Q12051 Q0182Q0182 405 nt11.35□□□□□ -0.59
BTS1Q12051 YOR139CYOR139C 393 nt11.35□□□□□ -0.59
BTS1Q12051 DCW1YKL046C 1350 nt11.34□□□□□ -0.59
BTS1Q12051 ALF1YNL148C 765 nt11.3□□□□□ -0.6
BTS1Q12051 YMR090WYMR090W 684 nt11.26□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 TAT1YBR069C 1860 nt11.25□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 YOL037CYOL037C 354 nt11.24□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 EMI2YDR516C 1503 nt11.22□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.22□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.22□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 NPL3YDR432W 1245 nt11.21□□□□□ -0.61
BTS1Q12051 SIS1YNL007C 1059 nt11.2□□□□□ -0.62
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