RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W TAD2P47058 250 aa9.31□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YJR012CP47087 207 aa9.31□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W DMA2P53924 522 aa9.31□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W DID2P69771 204 aa9.31□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W GAR1P28007 205 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W IES6P32617 166 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YIR020CP40575 100 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W PKP2P53170 491 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W PNC1P53184 216 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W GPI15P53961 229 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W ACT1P60010 375 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W LPP1Q04396 274 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W ANT1Q06497 328 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W PAM18Q07914 168 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W ISN1Q99312 450 aa9.3□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W TCA17P32613 152 aa9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W SOR1P35497 357 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W GPI18P38211 433 aa9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W LSM12P38828 187 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YHC3P47040 408 aa9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W SOR2Q07786 357 aa9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W HRD1Q08109 551 aa9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W MET32Q12041 191 aa9.29□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W ROX3P25046 220 aa9.28□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W CSI2Q08054 341 aa9.28□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YOS1Q3E834 85 aa9.28□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W Q0297Q9ZZV8 51 aa9.28□□□□□ -0.92
RNQ1YCL028W YFL015CP43578 164 aa9.27□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W SNX4P47057 423 aa9.27□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ORM1P53224 222 aa9.27□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YPD1Q07688 167 aa9.27□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W GEP5Q12393 293 aa9.27□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YEA6P39953 335 aa9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W MSO1P53604 210 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YIF1P53845 314 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ATG5Q12380 294 aa9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W FMP16Q12497 93 aa9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W BOL1Q3E793 110 aa9.26□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YMR31P19955 123 aa9.25□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W MRS4P23500 304 aa9.25□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W VMA7P39111 118 aa9.25□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W AGX1P43567 385 aa9.25□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YGL114WP53134 725 aa9.25□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ARR2Q06597 130 aa9.25□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ALG14P38242 237 aa9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W RFC2P40348 353 aa9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W SYG1P40528 902 aa9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YGL117WP53133 265 aa9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W BER1Q06688 274 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ATG31Q12421 196 aa9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YBR255C-AQ3E776 120 aa9.24□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ERV1P27882 189 aa9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W SRY1P36007 326 aa9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YKL162CP36052 402 aa9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ADH5P38113 351 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W SRB7P47822 140 aa9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W HOF1Q05080 669 aa9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W AEP3Q12089 606 aa9.23□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W SIT1P39980 628 aa9.22□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W YJL118WP47022 219 aa9.22□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W ABM1P47146 123 aa9.22□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W EST3Q03096 181 aa9.22□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W FSH2Q05015 223 aa9.22□□□□□ -0.93
RNQ1YCL028W VPS63O13549 108 aa9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W RPD3P32561 433 aa9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W EMP24P32803 203 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W ARP3P47117 449 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W TIM44Q01852 431 aa9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W COA2Q3E823 68 aa9.21□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W YBR085C-AO43137 85 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W SPS18P32572 300 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W PMU1P36069 295 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W SLM6P38343 150 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W GZF3P42944 551 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W BUL1P48524 976 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W YGR045CP53229 120 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W YPR071WQ12346 211 aa9.2□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W VMA11P32842 164 aa9.19□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W ECM31P38122 312 aa9.19□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W SUT1P53032 299 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W HBN1Q96VH4 193 aa9.19□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W DBP2P24783 546 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W YCL042WP25572 119 aa9.18□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W YEA4P40004 342 aa9.18□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W YJR056CP47115 236 aa9.18□□□□□ -0.94
RNQ1YCL028W PUS4P48567 403 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86.3 ms