Protein–RNA interactions for Protein: P53170

PKP2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase 2, mitochondrial, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKP2P53170 NSR1YGR159C 1245 nt16.87■□□□□ 0.29
PKP2P53170 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.47■□□□□ 0.23
PKP2P53170 NOP1YDL014W 984 nt15.88■□□□□ 0.13
PKP2P53170 MDJ1YFL016C 1536 nt15.37■□□□□ 0.05
PKP2P53170 YJL027CYJL027C 417 nt14.18□□□□□ -0.14
PKP2P53170 YKL036CYKL036C 393 nt14.16□□□□□ -0.14
PKP2P53170 SRX1YKL086W 384 nt13.87□□□□□ -0.19
PKP2P53170 Q0297Q0297 156 nt13.74□□□□□ -0.21
PKP2P53170 SSA3YBL075C 1950 nt13.51□□□□□ -0.25
PKP2P53170 DBP2YNL112W 1641 nt13.42□□□□□ -0.26
PKP2P53170 YBR190WYBR190W 312 nt13.32□□□□□ -0.28
PKP2P53170 YCR051WYCR051W 669 nt13.04□□□□□ -0.32
PKP2P53170 RTC3YHR087W 336 nt12.91□□□□□ -0.34
PKP2P53170 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PKP2P53170 SCS3YGL126W 1143 nt12.6□□□□□ -0.39
PKP2P53170 CCC1YLR220W 969 nt12.59□□□□□ -0.39
PKP2P53170 RVS167YDR388W 1449 nt12.56□□□□□ -0.4
PKP2P53170 PUT4YOR348C 1884 nt12.44□□□□□ -0.42
PKP2P53170 SCJ1YMR214W 1134 nt12.34□□□□□ -0.43
PKP2P53170 RPP1BYDL130W 321 nt12.31□□□□□ -0.44
PKP2P53170 YOL085CYOL085C 342 nt12.25□□□□□ -0.45
PKP2P53170 ARE1YCR048W 1833 nt12.05□□□□□ -0.48
PKP2P53170 PKP1YIL042C 1185 nt12.05□□□□□ -0.48
PKP2P53170 SHR5YOL110W 714 nt12.01□□□□□ -0.49
PKP2P53170 POA1YBR022W 534 nt11.96□□□□□ -0.49
PKP2P53170 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PKP2P53170 URN1YPR152C 1398 nt11.93□□□□□ -0.5
PKP2P53170 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.9□□□□□ -0.5
PKP2P53170 OPI9YLR338W 858 nt11.9□□□□□ -0.5
PKP2P53170 SAH1YER043C 1350 nt11.89□□□□□ -0.51
PKP2P53170 BSC6YOL137W 1494 nt11.83□□□□□ -0.52
PKP2P53170 PET122YER153C 765 nt11.78□□□□□ -0.52
PKP2P53170 SSA4YER103W 1929 nt11.73□□□□□ -0.53
PKP2P53170 SPT5YML010W 3192 nt11.72□□□□□ -0.53
PKP2P53170 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
PKP2P53170 DEP1YAL013W 1218 nt11.71□□□□□ -0.53
PKP2P53170 YDJ1YNL064C 1230 nt11.62□□□□□ -0.55
PKP2P53170 YNL208WYNL208W 600 nt11.58□□□□□ -0.56
PKP2P53170 PUN1YLR414C 792 nt11.57□□□□□ -0.56
PKP2P53170 SCR1SCR1 522 nt11.56□□□□□ -0.56
PKP2P53170 BUD23YCR047C 828 nt11.54□□□□□ -0.56
PKP2P53170 PTC2YER089C 1395 nt11.44□□□□□ -0.58
PKP2P53170 NAB2YGL122C 1578 nt11.41□□□□□ -0.58
PKP2P53170 BDF1YLR399C 2061 nt11.39□□□□□ -0.59
PKP2P53170 RRN5YLR141W 1092 nt11.37□□□□□ -0.59
PKP2P53170 YJR018WYJR018W 363 nt11.36□□□□□ -0.59
PKP2P53170 GAR1YHR089C 618 nt11.34□□□□□ -0.59
PKP2P53170 PAC11YDR488C 1602 nt11.3□□□□□ -0.6
PKP2P53170 TAT1YBR069C 1860 nt11.22□□□□□ -0.61
PKP2P53170 FIS1YIL065C 468 nt11.21□□□□□ -0.61
PKP2P53170 MEP2YNL142W 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
PKP2P53170 DAL1YIR027C 1383 nt11.16□□□□□ -0.62
PKP2P53170 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.16□□□□□ -0.62
PKP2P53170 ATS1YAL020C 1002 nt11.12□□□□□ -0.63
PKP2P53170 SSA1YAL005C 1929 nt11.07□□□□□ -0.64
PKP2P53170 NVJ2YPR091C 2313 nt11.07□□□□□ -0.64
PKP2P53170 YJR120WYJR120W 351 nt11.07□□□□□ -0.64
PKP2P53170 INM2YDR287W 879 nt11.06□□□□□ -0.64
PKP2P53170 PHO4YFR034C 939 nt11.05□□□□□ -0.64
PKP2P53170 FPR4YLR449W 1179 nt11.04□□□□□ -0.64
PKP2P53170 RPP2BYDR382W 333 nt11.03□□□□□ -0.64
PKP2P53170 YPS1YLR120C 1710 nt11.02□□□□□ -0.65
PKP2P53170 TIR1YER011W 765 nt11.02□□□□□ -0.65
PKP2P53170 RSB1YOR049C 1065 nt10.99□□□□□ -0.65
PKP2P53170 Q0182Q0182 405 nt10.98□□□□□ -0.65
PKP2P53170 FPS1YLL043W 2010 nt10.97□□□□□ -0.65
PKP2P53170 DCW1YKL046C 1350 nt10.94□□□□□ -0.66
PKP2P53170 YDR095CYDR095C 411 nt10.9□□□□□ -0.66
PKP2P53170 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.9□□□□□ -0.66
PKP2P53170 YJL225CYJL225C 5277 nt10.88□□□□□ -0.67
PKP2P53170 YBL100CYBL100C 315 nt10.85□□□□□ -0.67
PKP2P53170 YMR090WYMR090W 684 nt10.84□□□□□ -0.67
PKP2P53170 EMI2YDR516C 1503 nt10.83□□□□□ -0.68
PKP2P53170 YBR220CYBR220C 1683 nt10.8□□□□□ -0.68
PKP2P53170 YDL221WYDL221W 552 nt10.73□□□□□ -0.69
PKP2P53170 BDH2YAL061W 1254 nt10.73□□□□□ -0.69
PKP2P53170 SDH1YKL148C 1923 nt10.69□□□□□ -0.7
PKP2P53170 FUN26YAL022C 1554 nt10.69□□□□□ -0.7
PKP2P53170 RPP2AYOL039W 321 nt10.67□□□□□ -0.7
PKP2P53170 PTP1YDL230W 1008 nt10.66□□□□□ -0.7
PKP2P53170 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.66□□□□□ -0.7
PKP2P53170 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.66□□□□□ -0.7
PKP2P53170 ALF1YNL148C 765 nt10.65□□□□□ -0.7
PKP2P53170 MOT3YMR070W 1473 nt10.65□□□□□ -0.7
PKP2P53170 SRB2YHR041C 633 nt10.64□□□□□ -0.71
PKP2P53170 CAC2YML102W 1407 nt10.62□□□□□ -0.71
PKP2P53170 TRM9YML014W 840 nt10.58□□□□□ -0.72
PKP2P53170 SEC11YIR022W 504 nt10.56□□□□□ -0.72
PKP2P53170 CCT6YDR188W 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
PKP2P53170 SCC4YER147C 1875 nt10.54□□□□□ -0.72
PKP2P53170 PCH2YBR186W 1695 nt10.53□□□□□ -0.72
PKP2P53170 SIS1YNL007C 1059 nt10.52□□□□□ -0.73
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