RNA–Protein interactions for RNA: YHR093W

AHT1, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene AHT1, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AHT1	YHR093W	BDF2	Q07442	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	HAT1	Q12341	374 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	TFA1	P36100	482 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	YJR008W	P47085	338 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	IRC3	Q06683	689 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	CTT1	P06115	562 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	YKL222C	P35995	705 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	ERT1	P38140	529 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	PFF1	P38244	976 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	ITC1	P53125	1264 aa		13.46	□□□□□ -0.25
AHT1	YHR093W	PSH1	Q12161	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	BOI2	P39969	1040 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	KIN4	Q01919	800 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	UBP12	P39538	1254 aa		13.43	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	ERO1	Q03103	563 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	HXT10	P43581	546 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	UBP16	Q02863	499 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	SAS4	Q04003	481 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AHT1	YHR093W	SIT4	P20604	311 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	PMD1	P32634	1753 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	POL32	P47110	350 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	SPO1	P53541	631 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	TOP1	P04786	769 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	MTC5	Q03897	1148 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
AHT1	YHR093W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	DPH6	Q12429	685 aa		13.33	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	SAC3	P46674	1301 aa		13.32	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	SLA1	P32790	1244 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	YKU70	P32807	602 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	GRX6	Q12438	231 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	ICP55	P40051	511 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	THI3	Q07471	609 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	MGM1	P32266	881 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
AHT1	YHR093W	SRC1	Q03707	834 aa		13.27	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	KRE2	P27809	442 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	SPL2	P38839	148 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	SHC1	P39000	512 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	SET4	P42948	560 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	GYP5	Q12344	894 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	NCB2	Q92317	146 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	BDP1	P46678	594 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	SLI15	P38283	698 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	DPL1	Q05567	589 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	ATG20	Q07528	640 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
AHT1	YHR093W	ADR1	P07248	1323 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	AI2	P03876	854 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	GSM1	P42950	618 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	FPK1	P53739	893 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	IRC4	Q03036	179 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	UBX2	Q04228	584 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	RRI2	Q12348	645 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	YNL193W	P53870	558 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	GAS5	Q08193	484 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	POM152	P39685	1337 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	TOS4	Q06266	489 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	MSM1	P22438	575 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AHT1	YHR093W	AFG2	P32794	780 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	YGL242C	P53066	181 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	PDR18	P53756	1333 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	RMD1	Q03441	430 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	HKR1	P41809	1802 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AHT1	YHR093W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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