RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SMI1	YGR229C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SMI1	YGR229C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SMI1	YGR229C	TOA1	P32773	286 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SEC8	P32855	1065 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	IXR1	P33417	597 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	TPM2	P40414	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	FIG4	P42837	879 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YNL108C	P53929	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ERP5	P38819	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YPP1	P46951	817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	POL32	P47110	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ALG12	P53730	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	GUT2	P32191	649 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	IOC3	P43596	787 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	HIF1	Q12373	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SEC20	P28791	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	GRX4	P32642	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	VAC8	P39968	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	MCM16	Q12262	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	SVF1	Q05515	481 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	FRA1	Q07825	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	WHI5	Q12416	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	RAD2	P07276	1031 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	TGL4	P36165	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YHL050C	P38721	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YHR219W	P38900	624 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YJR115W	P47152	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ALD3	P54114	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	STB3	Q12427	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ERP2	P39704	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	BOI2	P39969	1040 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	RTT106	P40161	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	ATG3	P40344	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	EMP47	P43555	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMI1	YGR229C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	UGA3	P26370	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	MDJ2	P42834	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	RIM21	P48565	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	DNM1	P54861	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	MRX10	Q05648	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	SRF1	Q12516	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
SMI1	YGR229C	ISF1	P32488	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
SMI1	YGR229C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	BUD6	P41697	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	APP1	P53933	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	MNL2	Q12205	849 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	MET1	P36150	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	THI12	P42883	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	THI5	P43534	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	THI11	P47183	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	THI13	Q07748	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	KAR1	P11927	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	MKS1	P34072	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	YBL086C	P38177	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	APL6	P46682	809 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	ECM23	Q02710	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	NSE3	Q05541	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	ATG20	Q07528	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMI1	YGR229C	SEC6	P32844	805 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms