RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641482.1

MFSD8-233, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 4,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-233	ENST00000641482	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	C3	P01024	1663 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	FKBP8	Q14318	412 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	SLIT1	O75093	1534 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	PLA2R1	Q13018	1463 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	SLC24A1	O60721	1099 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	ARID3C	A6NKF2	412 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	AFAP1	Q8N556	730 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	IQGAP1	P46940	1657 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	DLC1	Q96QB1	1528 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MFSD8-233	ENST00000641482	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	TONSL	Q96HA7	1378 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	MED14	O60244	1454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PIK3R4	Q99570	1358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	KIF3B	O15066	747 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SPDYE6	P0CI01	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PKD2	Q13563	968 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PIK3C2G	O75747	1445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	ADGRB2	O60241	1585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	RAPGEF3	O95398	923 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	NWD1	Q149M9	1564 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	TNR	Q92752	1358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	CPS1	P31327	1500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	ZMYM3	Q14202	1370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	TRIM52	Q96A61	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SIRT1	Q96EB6	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	TECPR2	O15040	1411 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	ADGRB1	O14514	1584 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	USP32	Q8NFA0	1604 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-233	ENST00000641482	ITGAE	P38570	1179 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	PTPRM	P28827	1452 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	PTCH1	Q13635	1447 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ALK	Q9UM73	1620 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	USP54	Q70EL1	1684 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	PROM2	Q8N271	834 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	ABCC11	Q96J66	1382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	AKT1S1	Q96B36	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-233	ENST00000641482	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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