RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.18■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.18■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.18■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IL27Q8NEV9 243 aa22.18■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF3AQ9Y496 699 aa22.16■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLSTN1O94985 981 aa22.16■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.16■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.16■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.15■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RIPK4P57078 832 aa22.15■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARAP1Q96P48 1450 aa22.14■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.14■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAK2O60296 914 aa22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TEFQ10587 303 aa22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RUNDC1Q96C34 613 aa22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TOMM22Q9NS69 142 aa22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AKNAQ7Z591 1439 aa22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MSH5O43196 834 aa22.11■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDE3AQ14432 1141 aa22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.139e-6■□□□□ 11.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCOA2Q15596 1464 aa22.08■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.08■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ROCK1Q13464 1354 aa22.08■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.08■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.07■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WDR97A6NE52 1622 aa22.07■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.07■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HFM1A2PYH4 1435 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 H3BQV1 296 aa22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IFFO2Q5TF58 517 aa22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NECTIN2Q92692 538 aa22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TPM3P06753 285 aa22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LNPKQ9C0E8 428 aa22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PANK1Q8TE04 598 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.02■■□□□ 1.11
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BECN2A8MW95 431 aa22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MCTP1Q6DN14 999 aa22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRXQ9BXM0 1461 aa22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GPS2Q13227 327 aa22■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RUFY2Q8WXA3 655 aa22■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HMOX1P09601 288 aa22■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PKNOX2Q96KN3 472 aa22■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDC45O75419 566 aa21.99■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MBD3O95983 291 aa21.99■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GNAI1P63096 354 aa21.99■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.98■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TIAM1Q13009 1591 aa21.97■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TEX35Q5T0J7 233 aa21.97■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.96■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.96■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MTHFSP49914 203 aa21.96■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CABP2Q9NPB3 220 aa21.95■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYNJ1O43426 1573 aa21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 47.9
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.93■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.93■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.93■■□□□ 1.1
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