RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TET3O43151 1660 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IDI1Q13907 227 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EID1Q9Y6B2 187 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM52Q96A61 297 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MED14O60244 1454 aa12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CERKQ8TCT0 537 aa12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYNMO15061 1565 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLIT1O75093 1534 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 E9PCH4 1651 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIK3C2BO00750 1634 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHRDL2Q6WN34 429 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HRCP23327 699 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LTKP29376 864 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXO41Q8TF61 875 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.1□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADGRB3O60242 1522 aa12.1□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.09□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.08□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.08□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POTEHQ6S545 545 aa12.07□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.07□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IQGAP1P46940 1657 aa12.06□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.06□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZFYVE9O95405 1425 aa12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRPM2O94759 1503 aa12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPS1P31327 1500 aa12.04□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.04□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PITPNM1O00562 1244 aa12.03□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBX22Q9Y458 520 aa12.03□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNA6P17658 529 aa12.02□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BCANQ96GW7 911 aa12.02□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.02□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC26A8Q96RN1 970 aa12□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIK3R4Q99570 1358 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLTCL1P53675 1640 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIF1BO60333 1816 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOM1O60784 492 aa11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.96□□□□□ -0.49
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.96□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DIP2AQ14689 1571 aa11.95□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGL3Q3MIN7 710 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STAC3Q96MF2 364 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NWD1Q149M9 1564 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM94Q12767 1356 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 METP08581 1390 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPLO60437 1756 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTPRUQ92729 1446 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MSH6P52701 1360 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALKQ9UM73 1620 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRR29P0C7W0 189 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms