RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.33■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.71■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXD1Q16676 465 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.26■□□□□ 0.35
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCC9O60706 1549 aa17.15■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.53■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NACADO15069 1562 aa16.52■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.5■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.49■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADRA2BP18089 450 aa16.48■□□□□ 0.23
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.45■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MSH5O43196 834 aa16.37■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCRIBQ14160 1630 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.8■□□□□ 0.12
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.45■□□□□ 0.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POTEDQ86YR6 584 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCAPD3P42695 1498 aa15.27■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMARCA4P51532 1647 aa15.26■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMARCA2P51531 1590 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HMGXB3Q12766 1538 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.1■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.99□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WIZO95785 1651 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NESP48681 1621 aa14.81□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.81□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERCC6Q03468 1493 aa14.81□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.78□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CUX2O14529 1486 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFTRP13569 1480 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR62O43379 1518 aa14.51□□□□□ -0.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRDM2Q13029 1718 aa14.51□□□□□ -0.09
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCC8Q09428 1581 aa14.44□□□□□ -0.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOPBP1Q92547 1522 aa14.36□□□□□ -0.11
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.35□□□□□ -0.11
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNA4P22459 653 aa14.35□□□□□ -0.11
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.33□□□□□ -0.12
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.33□□□□□ -0.12
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFT140Q96RY7 1462 aa14.31□□□□□ -0.12
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SOGA1O94964 1423 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CUX1P39880 1505 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.18□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.15□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OSCARQ8IYS5 282 aa14.14□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR97A6NE52 1622 aa14.13□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOP2BQ02880 1626 aa14.1□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.08□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.07□□□□□ -0.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRIN2BQ13224 1484 aa14.05□□□□□ -0.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYNJ1O43426 1573 aa14.05□□□□□ -0.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.03□□□□□ -0.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBLN2P98095 1184 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYNJ2O15056 1496 aa13.94□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PBRM1Q86U86 1689 aa13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms