RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435348.5

TTC28-AS1-214, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.43■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PREX2Q70Z35 1606 aa16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KLHL34Q8N239 644 aa16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GSE1Q14687 1217 aa16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CPS1P31327 1500 aa16.4■□□□□ 0.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SNPHO15079 494 aa16.38■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.37■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MMRN1Q13201 1228 aa16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PTPRKQ15262 1439 aa16.36■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PSEN1P49768 467 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GGT6Q6P531 493 aa16.35■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-214ENST00000435348 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 A2MP01023 1474 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATP7AQ04656 1500 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GOLGA2Q08379 1002 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POTEB3A0JP26 581 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POTEBQ6S5H4 581 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PLXNC1O60486 1568 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.25■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TNRQ92752 1358 aa16.24■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 EMP3P54852 163 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ALKQ9UM73 1620 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SYNMO15061 1565 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IQGAP1P46940 1657 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DEPDC5O75140 1603 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CABP2Q9NPB3 220 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PZPP20742 1482 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MED14O60244 1454 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NLRP1Q9C000 1473 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM205CA6NFA0 338 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIF3BO15066 747 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPOCK2Q92563 424 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MIA2Q96PC5 1412 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.08■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POTEAQ6S8J7 498 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MBD5Q9P267 1494 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TIAM1Q13009 1591 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms