RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C UMP1P38293 148 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HTD2P38790 280 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HPA3P39979 161 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SMB1P40018 196 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SYS1P41544 203 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C IRC18P47056 224 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GPI14P47088 403 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YGR042WP53227 271 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FMP48P53233 369 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C VHT1P53241 593 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C BUD25P85052 153 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SED1Q01589 338 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YKR005CQ02203 525 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CTF19Q02732 369 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YDC1Q02896 317 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YMR279CQ03263 540 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YDR248CQ03786 193 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YLR283WQ05867 314 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GAT3Q07928 141 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SRL2Q12020 392 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AYT1Q12226 474 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C INP53Q12271 1107 aa1.86□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CDC28P00546 298 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C REP2P03872 296 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CAP2P13517 287 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C URA6P15700 204 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SAG1P20840 650 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C DAL80P26343 269 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C VMA5P31412 392 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YBL010CP32788 280 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NPL6P32832 435 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YKL063CP35725 167 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ECM14P38836 430 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YER079WP40052 210 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YER121WP40076 114 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GAT2P40209 560 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C CAT5P41735 233 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C EGT2P42835 1041 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C OTU1P43558 301 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SSN8P47821 323 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C BXI1P48558 297 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C UFD1P53044 361 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TIM10P87108 93 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRPL13Q02204 264 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C KEI1Q06346 221 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GRC3Q07845 632 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YPL199CQ08954 240 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C EAF3Q12432 401 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YDL012CQ12489 107 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HUT1Q12520 339 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ODC2Q99297 307 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FSH3Q99369 266 aa1.85□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL25P04456 142 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL39P04650 51 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SPS4P09937 338 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RPL3P14126 387 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RFA3P26755 122 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C IMP1P28627 190 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PEX4P29340 183 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C RNP1P32385 249 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HYM1P32464 399 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AGA2P32781 87 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MNS1P32906 549 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C VAM7P32912 316 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SEC66P33754 206 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C NAT2P37293 288 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FIG1P38224 298 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YHR122WP38829 231 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C AIM20P40451 204 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GLR1P41921 483 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GWT1P47026 490 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C SBH2P52871 88 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C TPN1P53099 579 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GIM3P53900 129 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C LSM7P53905 115 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YNL046WP53956 172 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YPL067CQ02754 198 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C GMC1Q04399 608 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YDR114CQ04597 100 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PEX10Q05568 337 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PHO92Q06390 306 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C PIN3Q06449 215 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YLR031WQ07978 186 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YOR186WQ08560 144 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C FCY22Q12119 530 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C YLR108CQ12259 485 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C ERP4Q12450 207 aa1.84□□□□□ -2.11
GCN4YEL009C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
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