Protein–RNA interactions for Protein: Q12432

EAF3, Chromatin modification-related protein EAF3, yeastyeast

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EAF3Q12432 NSR1YGR159C 1245 nt17.4■□□□□ 0.38
EAF3Q12432 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.29■□□□□ 0.36
EAF3Q12432 NOP1YDL014W 984 nt16.79■□□□□ 0.28
EAF3Q12432 MDJ1YFL016C 1536 nt15.53■□□□□ 0.08
EAF3Q12432 YKL036CYKL036C 393 nt15.33■□□□□ 0.04
EAF3Q12432 SRX1YKL086W 384 nt14.68□□□□□ -0.06
EAF3Q12432 Q0297Q0297 156 nt14.67□□□□□ -0.06
EAF3Q12432 YJL027CYJL027C 417 nt14.34□□□□□ -0.11
EAF3Q12432 YCR051WYCR051W 669 nt13.85□□□□□ -0.19
EAF3Q12432 SCS3YGL126W 1143 nt13.85□□□□□ -0.19
EAF3Q12432 DBP2YNL112W 1641 nt13.72□□□□□ -0.21
EAF3Q12432 SSA3YBL075C 1950 nt13.52□□□□□ -0.24
EAF3Q12432 YBR190WYBR190W 312 nt13.4□□□□□ -0.26
EAF3Q12432 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.37□□□□□ -0.27
EAF3Q12432 YOL085CYOL085C 342 nt13.28□□□□□ -0.28
EAF3Q12432 CCC1YLR220W 969 nt13.15□□□□□ -0.3
EAF3Q12432 RPP1BYDL130W 321 nt13.14□□□□□ -0.31
EAF3Q12432 PKP1YIL042C 1185 nt13.03□□□□□ -0.32
EAF3Q12432 RTC3YHR087W 336 nt13.01□□□□□ -0.33
EAF3Q12432 RVS167YDR388W 1449 nt12.86□□□□□ -0.35
EAF3Q12432 SCJ1YMR214W 1134 nt12.74□□□□□ -0.37
EAF3Q12432 PUT4YOR348C 1884 nt12.72□□□□□ -0.37
EAF3Q12432 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.58□□□□□ -0.4
EAF3Q12432 PET122YER153C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
EAF3Q12432 SCR1SCR1 522 nt12.39□□□□□ -0.43
EAF3Q12432 SHR5YOL110W 714 nt12.39□□□□□ -0.43
EAF3Q12432 ATS1YAL020C 1002 nt12.35□□□□□ -0.43
EAF3Q12432 ARE1YCR048W 1833 nt12.29□□□□□ -0.44
EAF3Q12432 POA1YBR022W 534 nt12.22□□□□□ -0.45
EAF3Q12432 YDJ1YNL064C 1230 nt12.21□□□□□ -0.45
EAF3Q12432 RRN5YLR141W 1092 nt12.17□□□□□ -0.46
EAF3Q12432 SPT5YML010W 3192 nt12.17□□□□□ -0.46
EAF3Q12432 URN1YPR152C 1398 nt12.11□□□□□ -0.47
EAF3Q12432 BSC6YOL137W 1494 nt12.09□□□□□ -0.47
EAF3Q12432 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.08□□□□□ -0.48
EAF3Q12432 SAH1YER043C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
EAF3Q12432 DEP1YAL013W 1218 nt12.01□□□□□ -0.49
EAF3Q12432 OPI9YLR338W 858 nt12□□□□□ -0.49
EAF3Q12432 SSA4YER103W 1929 nt11.97□□□□□ -0.49
EAF3Q12432 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.94□□□□□ -0.5
EAF3Q12432 RPN10YHR200W 807 nt11.92□□□□□ -0.5
EAF3Q12432 GAR1YHR089C 618 nt11.89□□□□□ -0.51
EAF3Q12432 YNL208WYNL208W 600 nt11.88□□□□□ -0.51
EAF3Q12432 RSB1YOR049C 1065 nt11.85□□□□□ -0.51
EAF3Q12432 BUD23YCR047C 828 nt11.71□□□□□ -0.53
EAF3Q12432 PUN1YLR414C 792 nt11.65□□□□□ -0.54
EAF3Q12432 BDF1YLR399C 2061 nt11.63□□□□□ -0.55
EAF3Q12432 PTC2YER089C 1395 nt11.56□□□□□ -0.56
EAF3Q12432 YJR018WYJR018W 363 nt11.55□□□□□ -0.56
EAF3Q12432 TIR1YER011W 765 nt11.52□□□□□ -0.57
EAF3Q12432 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
EAF3Q12432 PST2YDR032C 597 nt11.49□□□□□ -0.57
EAF3Q12432 TAT1YBR069C 1860 nt11.44□□□□□ -0.58
EAF3Q12432 MEP2YNL142W 1500 nt11.44□□□□□ -0.58
EAF3Q12432 SSA1YAL005C 1929 nt11.41□□□□□ -0.58
EAF3Q12432 YJR120WYJR120W 351 nt11.35□□□□□ -0.59
EAF3Q12432 FIS1YIL065C 468 nt11.32□□□□□ -0.6
EAF3Q12432 RPP2BYDR382W 333 nt11.28□□□□□ -0.6
EAF3Q12432 DCW1YKL046C 1350 nt11.25□□□□□ -0.61
EAF3Q12432 DAL1YIR027C 1383 nt11.22□□□□□ -0.61
EAF3Q12432 INM2YDR287W 879 nt11.2□□□□□ -0.62
EAF3Q12432 SRB2YHR041C 633 nt11.17□□□□□ -0.62
EAF3Q12432 YPS1YLR120C 1710 nt11.17□□□□□ -0.62
EAF3Q12432 PAC11YDR488C 1602 nt11.17□□□□□ -0.62
EAF3Q12432 PHO4YFR034C 939 nt11.14□□□□□ -0.63
EAF3Q12432 FPR4YLR449W 1179 nt11.13□□□□□ -0.63
EAF3Q12432 YBR220CYBR220C 1683 nt11.12□□□□□ -0.63
EAF3Q12432 EMI2YDR516C 1503 nt11.05□□□□□ -0.64
EAF3Q12432 BDH2YAL061W 1254 nt11.05□□□□□ -0.64
EAF3Q12432 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.03□□□□□ -0.64
EAF3Q12432 YBL100CYBL100C 315 nt11.03□□□□□ -0.64
EAF3Q12432 SHU1YHL006C 453 nt11.02□□□□□ -0.65
EAF3Q12432 YDR095CYDR095C 411 nt10.99□□□□□ -0.65
EAF3Q12432 YMR090WYMR090W 684 nt10.98□□□□□ -0.65
EAF3Q12432 WWM1YFL010C 636 nt10.97□□□□□ -0.65
EAF3Q12432 SDH1YKL148C 1923 nt10.94□□□□□ -0.66
EAF3Q12432 YDL221WYDL221W 552 nt10.94□□□□□ -0.66
EAF3Q12432 YKL097CYKL097C 411 nt10.92□□□□□ -0.66
EAF3Q12432 YGR021WYGR021W 873 nt10.91□□□□□ -0.66
EAF3Q12432 LSM3YLR438C-A 270 nt10.9□□□□□ -0.66
EAF3Q12432 FUN26YAL022C 1554 nt10.9□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 NVJ2YPR091C 2313 nt10.89□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 CAC2YML102W 1407 nt10.87□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.86□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 PCH2YBR186W 1695 nt10.85□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 PTP1YDL230W 1008 nt10.85□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.85□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 HOM6YJR139C 1080 nt10.85□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 TRM9YML014W 840 nt10.85□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 GUT2YIL155C 1950 nt10.84□□□□□ -0.67
EAF3Q12432 CCT6YDR188W 1641 nt10.78□□□□□ -0.68
EAF3Q12432 SEC11YIR022W 504 nt10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms