RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	YMC2	P38087	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	GAB1	P41733	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SOL1	P50278	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YGR042W	P53227	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NRK1	P53915	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YDC1	Q02896	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	FIT1	Q04433	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SHH3	Q04487	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	REX4	Q08237	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	POM33	Q12164	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	HAP3	P13434	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MXR2	P25566	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TCA17	P32613	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TVP38	P36164	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YNL194C	P40169	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ICE2	P40499	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	EMC5	P40540	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	POP1	P41812	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	BUL1	P48524	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MUP1	P50276	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	UBC11	P52492	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TRS23	Q03784	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RIM13	Q03792	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RNH202	Q05635	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	COX5B	P00425	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	HAP2	P06774	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	POP5	P28005	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YKL075C	P36083	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	VPS52	P39904	641 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CAT5	P41735	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PAM16	P42949	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MOB2	P43563	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YJL163C	P46996	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	BOL2	P53082	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	DUG3	P53871	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	VPS28	Q02767	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CSM4	Q08955	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AI3	P03877	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	POX1	P13711	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PEX4	P29340	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YBR053C	P38235	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	PAU15	P40585	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	TRM9	P49957	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	MDM34	P53083	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YGR151C	P53287	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	AAH1	P53909	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NUP100	Q02629	959 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RSM10	Q03201	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	HRD3	Q05787	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	LDB18	Q07887	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	RKI1	Q12189	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	ERP3	Q12403	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBX2	YML013W	CHO1	P08456	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YMR31	P19955	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	RBK1	P25332	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YEF1	P32622	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SHE1	P38200	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	POP8	P38208	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YBR096W	P38256	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YBR220C	P38318	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MEP2	P41948	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	OST3	P48439	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	UBP8	P50102	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YNR066C	P53752	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	GOT1	Q03554	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CSI2	Q08054	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	USV1	Q12132	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ATG5	Q12380	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.3 ms