Protein–RNA interactions for Protein: Q04835

YMR253C, Uncharacterized membrane protein YMR253C, yeastyeast

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR253CQ04835 NSR1YGR159C 1245 nt16.1■□□□□ 0.17
YMR253CQ04835 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.62■□□□□ 0.09
YMR253CQ04835 MDJ1YFL016C 1536 nt15□□□□□ -0.01
YMR253CQ04835 NOP1YDL014W 984 nt14.86□□□□□ -0.03
YMR253CQ04835 YJL027CYJL027C 417 nt13.73□□□□□ -0.21
YMR253CQ04835 YKL036CYKL036C 393 nt13.29□□□□□ -0.28
YMR253CQ04835 SSA3YBL075C 1950 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR253CQ04835 SRX1YKL086W 384 nt13.01□□□□□ -0.33
YMR253CQ04835 DBP2YNL112W 1641 nt13.01□□□□□ -0.33
YMR253CQ04835 YBR190WYBR190W 312 nt12.94□□□□□ -0.34
YMR253CQ04835 Q0297Q0297 156 nt12.81□□□□□ -0.36
YMR253CQ04835 RTC3YHR087W 336 nt12.61□□□□□ -0.39
YMR253CQ04835 PUT4YOR348C 1884 nt12.31□□□□□ -0.44
YMR253CQ04835 YCR051WYCR051W 669 nt12.29□□□□□ -0.44
YMR253CQ04835 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.18□□□□□ -0.46
YMR253CQ04835 CCC1YLR220W 969 nt12.06□□□□□ -0.48
YMR253CQ04835 RVS167YDR388W 1449 nt12□□□□□ -0.49
YMR253CQ04835 SCS3YGL126W 1143 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR253CQ04835 ARE1YCR048W 1833 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR253CQ04835 SCJ1YMR214W 1134 nt11.86□□□□□ -0.51
YMR253CQ04835 POA1YBR022W 534 nt11.86□□□□□ -0.51
YMR253CQ04835 SPT5YML010W 3192 nt11.75□□□□□ -0.53
YMR253CQ04835 BSC6YOL137W 1494 nt11.74□□□□□ -0.53
YMR253CQ04835 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.72□□□□□ -0.53
YMR253CQ04835 SSA4YER103W 1929 nt11.66□□□□□ -0.54
YMR253CQ04835 SAH1YER043C 1350 nt11.66□□□□□ -0.54
YMR253CQ04835 URN1YPR152C 1398 nt11.56□□□□□ -0.56
YMR253CQ04835 OPI9YLR338W 858 nt11.53□□□□□ -0.56
YMR253CQ04835 RPP1BYDL130W 321 nt11.5□□□□□ -0.57
YMR253CQ04835 YOL085CYOL085C 342 nt11.49□□□□□ -0.57
YMR253CQ04835 SHR5YOL110W 714 nt11.44□□□□□ -0.58
YMR253CQ04835 BUD23YCR047C 828 nt11.38□□□□□ -0.59
YMR253CQ04835 DEP1YAL013W 1218 nt11.38□□□□□ -0.59
YMR253CQ04835 PKP1YIL042C 1185 nt11.34□□□□□ -0.59
YMR253CQ04835 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.3□□□□□ -0.6
YMR253CQ04835 BDF1YLR399C 2061 nt11.3□□□□□ -0.6
YMR253CQ04835 RPN10YHR200W 807 nt11.19□□□□□ -0.62
YMR253CQ04835 PTC2YER089C 1395 nt11.17□□□□□ -0.62
YMR253CQ04835 PUN1YLR414C 792 nt11.16□□□□□ -0.62
YMR253CQ04835 TAT1YBR069C 1860 nt11.12□□□□□ -0.63
YMR253CQ04835 NAB2YGL122C 1578 nt11.12□□□□□ -0.63
YMR253CQ04835 MEP2YNL142W 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
YMR253CQ04835 PET122YER153C 765 nt11.09□□□□□ -0.63
YMR253CQ04835 YNL208WYNL208W 600 nt11.09□□□□□ -0.63
YMR253CQ04835 YJR018WYJR018W 363 nt10.97□□□□□ -0.65
YMR253CQ04835 PAC11YDR488C 1602 nt10.97□□□□□ -0.65
YMR253CQ04835 DCW1YKL046C 1350 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR253CQ04835 FIS1YIL065C 468 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR253CQ04835 YDJ1YNL064C 1230 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR253CQ04835 DAL1YIR027C 1383 nt10.84□□□□□ -0.67
YMR253CQ04835 GAR1YHR089C 618 nt10.8□□□□□ -0.68
YMR253CQ04835 FPR4YLR449W 1179 nt10.8□□□□□ -0.68
YMR253CQ04835 YPS1YLR120C 1710 nt10.8□□□□□ -0.68
YMR253CQ04835 SCR1SCR1 522 nt10.79□□□□□ -0.68
YMR253CQ04835 YBR220CYBR220C 1683 nt10.79□□□□□ -0.68
YMR253CQ04835 PHO4YFR034C 939 nt10.75□□□□□ -0.69
YMR253CQ04835 NVJ2YPR091C 2313 nt10.75□□□□□ -0.69
YMR253CQ04835 EMI2YDR516C 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
YMR253CQ04835 YJR120WYJR120W 351 nt10.71□□□□□ -0.69
YMR253CQ04835 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.7□□□□□ -0.7
YMR253CQ04835 FPS1YLL043W 2010 nt10.7□□□□□ -0.7
YMR253CQ04835 RRN5YLR141W 1092 nt10.68□□□□□ -0.7
YMR253CQ04835 YMR090WYMR090W 684 nt10.68□□□□□ -0.7
YMR253CQ04835 INM2YDR287W 879 nt10.65□□□□□ -0.7
YMR253CQ04835 ATS1YAL020C 1002 nt10.65□□□□□ -0.7
YMR253CQ04835 YDR095CYDR095C 411 nt10.61□□□□□ -0.71
YMR253CQ04835 SDH1YKL148C 1923 nt10.6□□□□□ -0.71
YMR253CQ04835 SSA1YAL005C 1929 nt10.6□□□□□ -0.71
YMR253CQ04835 YDL221WYDL221W 552 nt10.59□□□□□ -0.71
YMR253CQ04835 PCH2YBR186W 1695 nt10.55□□□□□ -0.72
YMR253CQ04835 RPP2BYDR382W 333 nt10.54□□□□□ -0.72
YMR253CQ04835 GUT2YIL155C 1950 nt10.52□□□□□ -0.72
YMR253CQ04835 CAC2YML102W 1407 nt10.52□□□□□ -0.73
YMR253CQ04835 PTP1YDL230W 1008 nt10.47□□□□□ -0.73
YMR253CQ04835 TIR1YER011W 765 nt10.47□□□□□ -0.73
YMR253CQ04835 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.47□□□□□ -0.73
YMR253CQ04835 YBL100CYBL100C 315 nt10.47□□□□□ -0.73
YMR253CQ04835 SEC11YIR022W 504 nt10.46□□□□□ -0.73
YMR253CQ04835 SCC4YER147C 1875 nt10.43□□□□□ -0.74
YMR253CQ04835 RPP2AYOL039W 321 nt10.41□□□□□ -0.74
YMR253CQ04835 PIB2YGL023C 1908 nt10.37□□□□□ -0.75
YMR253CQ04835 IRC15YPL017C 1500 nt10.36□□□□□ -0.75
YMR253CQ04835 FUN26YAL022C 1554 nt10.32□□□□□ -0.76
YMR253CQ04835 RSB1YOR049C 1065 nt10.32□□□□□ -0.76
YMR253CQ04835 GIS3YLR094C 1509 nt10.3□□□□□ -0.76
YMR253CQ04835 YSC84YHR016C 1407 nt10.28□□□□□ -0.76
YMR253CQ04835 ALF1YNL148C 765 nt10.28□□□□□ -0.76
YMR253CQ04835 SRB2YHR041C 633 nt10.24□□□□□ -0.77
YMR253CQ04835 BDH2YAL061W 1254 nt10.24□□□□□ -0.77
YMR253CQ04835 RTF1YGL244W 1677 nt10.22□□□□□ -0.77
YMR253CQ04835 YHL050CYHL050C 2094 nt10.22□□□□□ -0.77
YMR253CQ04835 SIS1YNL007C 1059 nt10.18□□□□□ -0.78
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