Protein–RNA interactions for Protein: Q12189

RKI1, Ribose-5-phosphate isomerase, yeastyeast

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKI1Q12189 NSR1YGR159C 1245 nt16.39■□□□□ 0.21
RKI1Q12189 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.36■□□□□ 0.21
RKI1Q12189 NOP1YDL014W 984 nt15.91■□□□□ 0.14
RKI1Q12189 MDJ1YFL016C 1536 nt14.64□□□□□ -0.07
RKI1Q12189 YKL036CYKL036C 393 nt14.49□□□□□ -0.09
RKI1Q12189 SRX1YKL086W 384 nt13.84□□□□□ -0.19
RKI1Q12189 Q0297Q0297 156 nt13.8□□□□□ -0.2
RKI1Q12189 YJL027CYJL027C 417 nt13.57□□□□□ -0.24
RKI1Q12189 YCR051WYCR051W 669 nt13.14□□□□□ -0.31
RKI1Q12189 SCS3YGL126W 1143 nt13.07□□□□□ -0.32
RKI1Q12189 DBP2YNL112W 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
RKI1Q12189 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.58□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 YBR190WYBR190W 312 nt12.56□□□□□ -0.4
RKI1Q12189 YOL085CYOL085C 342 nt12.52□□□□□ -0.41
RKI1Q12189 CCC1YLR220W 969 nt12.48□□□□□ -0.41
RKI1Q12189 SSA3YBL075C 1950 nt12.44□□□□□ -0.42
RKI1Q12189 RPP1BYDL130W 321 nt12.4□□□□□ -0.42
RKI1Q12189 PKP1YIL042C 1185 nt12.33□□□□□ -0.44
RKI1Q12189 RTC3YHR087W 336 nt12.31□□□□□ -0.44
RKI1Q12189 RVS167YDR388W 1449 nt12.2□□□□□ -0.46
RKI1Q12189 SCJ1YMR214W 1134 nt11.97□□□□□ -0.49
RKI1Q12189 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.85□□□□□ -0.51
RKI1Q12189 PET122YER153C 765 nt11.83□□□□□ -0.52
RKI1Q12189 SCR1SCR1 522 nt11.76□□□□□ -0.53
RKI1Q12189 SHR5YOL110W 714 nt11.68□□□□□ -0.54
RKI1Q12189 ATS1YAL020C 1002 nt11.65□□□□□ -0.54
RKI1Q12189 Q0182Q0182 405 nt11.61□□□□□ -0.55
RKI1Q12189 RRN5YLR141W 1092 nt11.48□□□□□ -0.57
RKI1Q12189 YDJ1YNL064C 1230 nt11.48□□□□□ -0.57
RKI1Q12189 PUT4YOR348C 1884 nt11.45□□□□□ -0.58
RKI1Q12189 URN1YPR152C 1398 nt11.43□□□□□ -0.58
RKI1Q12189 DEP1YAL013W 1218 nt11.37□□□□□ -0.59
RKI1Q12189 RPN10YHR200W 807 nt11.31□□□□□ -0.6
RKI1Q12189 OPI9YLR338W 858 nt11.3□□□□□ -0.6
RKI1Q12189 MOT3YMR070W 1473 nt11.29□□□□□ -0.6
RKI1Q12189 GAR1YHR089C 618 nt11.25□□□□□ -0.61
RKI1Q12189 RSB1YOR049C 1065 nt11.25□□□□□ -0.61
RKI1Q12189 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.24□□□□□ -0.61
RKI1Q12189 SAH1YER043C 1350 nt11.24□□□□□ -0.61
RKI1Q12189 YNL208WYNL208W 600 nt11.22□□□□□ -0.61
RKI1Q12189 ARE1YCR048W 1833 nt11.2□□□□□ -0.62
RKI1Q12189 POA1YBR022W 534 nt11.12□□□□□ -0.63
RKI1Q12189 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.1□□□□□ -0.63
RKI1Q12189 PUN1YLR414C 792 nt11.01□□□□□ -0.65
RKI1Q12189 SPT5YML010W 3192 nt10.95□□□□□ -0.66
RKI1Q12189 YJR018WYJR018W 363 nt10.91□□□□□ -0.66
RKI1Q12189 BSC6YOL137W 1494 nt10.89□□□□□ -0.67
RKI1Q12189 TIR1YER011W 765 nt10.88□□□□□ -0.67
RKI1Q12189 BUD23YCR047C 828 nt10.87□□□□□ -0.67
RKI1Q12189 PTC2YER089C 1395 nt10.86□□□□□ -0.67
RKI1Q12189 SSA4YER103W 1929 nt10.84□□□□□ -0.67
RKI1Q12189 PST2YDR032C 597 nt10.79□□□□□ -0.68
RKI1Q12189 NAB2YGL122C 1578 nt10.76□□□□□ -0.69
RKI1Q12189 SSA1YAL005C 1929 nt10.73□□□□□ -0.69
RKI1Q12189 RPP2BYDR382W 333 nt10.71□□□□□ -0.69
RKI1Q12189 NVJ2YPR091C 2313 nt10.67□□□□□ -0.7
RKI1Q12189 PAC11YDR488C 1602 nt10.66□□□□□ -0.7
RKI1Q12189 FPS1YLL043W 2010 nt10.62□□□□□ -0.71
RKI1Q12189 YJR120WYJR120W 351 nt10.6□□□□□ -0.71
RKI1Q12189 DAL1YIR027C 1383 nt10.58□□□□□ -0.72
RKI1Q12189 FPR4YLR449W 1179 nt10.58□□□□□ -0.72
RKI1Q12189 INM2YDR287W 879 nt10.57□□□□□ -0.72
RKI1Q12189 FIS1YIL065C 468 nt10.53□□□□□ -0.72
RKI1Q12189 BDF1YLR399C 2061 nt10.52□□□□□ -0.73
RKI1Q12189 PHO4YFR034C 939 nt10.47□□□□□ -0.73
RKI1Q12189 SRB2YHR041C 633 nt10.44□□□□□ -0.74
RKI1Q12189 YBL100CYBL100C 315 nt10.42□□□□□ -0.74
RKI1Q12189 BDH2YAL061W 1254 nt10.41□□□□□ -0.74
RKI1Q12189 TAT1YBR069C 1860 nt10.38□□□□□ -0.75
RKI1Q12189 SHU1YHL006C 453 nt10.38□□□□□ -0.75
RKI1Q12189 WWM1YFL010C 636 nt10.35□□□□□ -0.75
RKI1Q12189 YKL097CYKL097C 411 nt10.35□□□□□ -0.75
RKI1Q12189 YGR021WYGR021W 873 nt10.32□□□□□ -0.76
RKI1Q12189 MEP2YNL142W 1500 nt10.31□□□□□ -0.76
RKI1Q12189 YPS1YLR120C 1710 nt10.3□□□□□ -0.76
RKI1Q12189 FUN26YAL022C 1554 nt10.28□□□□□ -0.76
RKI1Q12189 TRM9YML014W 840 nt10.27□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.26□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 LSM3YLR438C-A 270 nt10.26□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.25□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.23□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 ALF1YNL148C 765 nt10.23□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 YDR095CYDR095C 411 nt10.21□□□□□ -0.77
RKI1Q12189 HOM6YJR139C 1080 nt10.2□□□□□ -0.78
RKI1Q12189 CCT6YDR188W 1641 nt10.14□□□□□ -0.79
RKI1Q12189 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.13□□□□□ -0.79
RKI1Q12189 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.13□□□□□ -0.79
RKI1Q12189 MNP1YGL068W 585 nt10.12□□□□□ -0.79
RKI1Q12189 DCW1YKL046C 1350 nt10.09□□□□□ -0.79
RKI1Q12189 RKM5YLR137W 1104 nt10.07□□□□□ -0.8
RKI1Q12189 RPP2AYOL039W 321 nt10.04□□□□□ -0.8
RKI1Q12189 YBR220CYBR220C 1683 nt10.02□□□□□ -0.81
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