Protein–RNA interactions for Protein: P41948

MEP2, Ammonium transporter MEP2, yeastyeast

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MEP2P41948 NSR1YGR159C 1245 nt19.69■□□□□ 0.74
MEP2P41948 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.63■□□□□ 0.73
MEP2P41948 NOP1YDL014W 984 nt19■□□□□ 0.63
MEP2P41948 MDJ1YFL016C 1536 nt17.65■□□□□ 0.42
MEP2P41948 YKL036CYKL036C 393 nt17.39■□□□□ 0.37
MEP2P41948 SRX1YKL086W 384 nt16.64■□□□□ 0.25
MEP2P41948 Q0297Q0297 156 nt16.62■□□□□ 0.25
MEP2P41948 YJL027CYJL027C 417 nt16.25■□□□□ 0.19
MEP2P41948 SCS3YGL126W 1143 nt15.75■□□□□ 0.11
MEP2P41948 YCR051WYCR051W 669 nt15.72■□□□□ 0.11
MEP2P41948 DBP2YNL112W 1641 nt15.59■□□□□ 0.09
MEP2P41948 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.17■□□□□ 0.02
MEP2P41948 YBR190WYBR190W 312 nt15.1■□□□□ 0.01
MEP2P41948 YOL085CYOL085C 342 nt15.08■□□□□ 0
MEP2P41948 CCC1YLR220W 969 nt14.94□□□□□ -0.02
MEP2P41948 RPP1BYDL130W 321 nt14.9□□□□□ -0.02
MEP2P41948 PKP1YIL042C 1185 nt14.84□□□□□ -0.03
MEP2P41948 RTC3YHR087W 336 nt14.69□□□□□ -0.06
MEP2P41948 RVS167YDR388W 1449 nt14.54□□□□□ -0.08
MEP2P41948 SCJ1YMR214W 1134 nt14.51□□□□□ -0.09
MEP2P41948 PET122YER153C 765 nt14.27□□□□□ -0.13
MEP2P41948 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MEP2P41948 SHR5YOL110W 714 nt14.03□□□□□ -0.16
MEP2P41948 ATS1YAL020C 1002 nt14.02□□□□□ -0.17
MEP2P41948 SCR1SCR1 522 nt14.01□□□□□ -0.17
MEP2P41948 PUT4YOR348C 1884 nt13.89□□□□□ -0.19
MEP2P41948 YDJ1YNL064C 1230 nt13.82□□□□□ -0.2
MEP2P41948 RRN5YLR141W 1092 nt13.81□□□□□ -0.2
MEP2P41948 URN1YPR152C 1398 nt13.74□□□□□ -0.21
MEP2P41948 DEP1YAL013W 1218 nt13.66□□□□□ -0.22
MEP2P41948 OPI9YLR338W 858 nt13.59□□□□□ -0.23
MEP2P41948 ARE1YCR048W 1833 nt13.57□□□□□ -0.24
MEP2P41948 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.55□□□□□ -0.24
MEP2P41948 SAH1YER043C 1350 nt13.54□□□□□ -0.24
MEP2P41948 GAR1YHR089C 618 nt13.5□□□□□ -0.25
MEP2P41948 RPN10YHR200W 807 nt13.47□□□□□ -0.25
MEP2P41948 RSB1YOR049C 1065 nt13.46□□□□□ -0.25
MEP2P41948 YNL208WYNL208W 600 nt13.44□□□□□ -0.26
MEP2P41948 POA1YBR022W 534 nt13.39□□□□□ -0.27
MEP2P41948 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.37□□□□□ -0.27
MEP2P41948 SSA3YBL075C 1950 nt13.36□□□□□ -0.27
MEP2P41948 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
MEP2P41948 BSC6YOL137W 1494 nt13.15□□□□□ -0.3
MEP2P41948 YJR018WYJR018W 363 nt13.09□□□□□ -0.31
MEP2P41948 TIR1YER011W 765 nt13.08□□□□□ -0.32
MEP2P41948 PST2YDR032C 597 nt13.04□□□□□ -0.32
MEP2P41948 PTC2YER089C 1395 nt13.04□□□□□ -0.32
MEP2P41948 BUD23YCR047C 828 nt13.01□□□□□ -0.33
MEP2P41948 SSA1YAL005C 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
MEP2P41948 YJR120WYJR120W 351 nt12.92□□□□□ -0.34
MEP2P41948 NAB2YGL122C 1578 nt12.9□□□□□ -0.34
MEP2P41948 SRB2YHR041C 633 nt12.76□□□□□ -0.37
MEP2P41948 FIS1YIL065C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
MEP2P41948 RPP2BYDR382W 333 nt12.75□□□□□ -0.37
MEP2P41948 SPT5YML010W 3192 nt12.74□□□□□ -0.37
MEP2P41948 DAL1YIR027C 1383 nt12.7□□□□□ -0.38
MEP2P41948 INM2YDR287W 879 nt12.64□□□□□ -0.39
MEP2P41948 FPR4YLR449W 1179 nt12.61□□□□□ -0.39
MEP2P41948 PHO4YFR034C 939 nt12.6□□□□□ -0.39
MEP2P41948 SHU1YHL006C 453 nt12.55□□□□□ -0.4
MEP2P41948 BDH2YAL061W 1254 nt12.51□□□□□ -0.41
MEP2P41948 YBL100CYBL100C 315 nt12.5□□□□□ -0.41
MEP2P41948 WWM1YFL010C 636 nt12.47□□□□□ -0.41
MEP2P41948 YPS1YLR120C 1710 nt12.42□□□□□ -0.42
MEP2P41948 YKL097CYKL097C 411 nt12.39□□□□□ -0.43
MEP2P41948 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.38□□□□□ -0.43
MEP2P41948 MEP2YNL142W 1500 nt12.37□□□□□ -0.43
MEP2P41948 FUN26YAL022C 1554 nt12.35□□□□□ -0.43
MEP2P41948 YGR021WYGR021W 873 nt12.34□□□□□ -0.43
MEP2P41948 YDR095CYDR095C 411 nt12.33□□□□□ -0.44
MEP2P41948 HOM6YJR139C 1080 nt12.32□□□□□ -0.44
MEP2P41948 SSA4YER103W 1929 nt12.31□□□□□ -0.44
MEP2P41948 LSM3YLR438C-A 270 nt12.3□□□□□ -0.44
MEP2P41948 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.28□□□□□ -0.44
MEP2P41948 TRM9YML014W 840 nt12.26□□□□□ -0.45
MEP2P41948 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.25□□□□□ -0.45
MEP2P41948 MNP1YGL068W 585 nt12.23□□□□□ -0.45
MEP2P41948 CCT6YDR188W 1641 nt12.2□□□□□ -0.46
MEP2P41948 DCW1YKL046C 1350 nt12.18□□□□□ -0.46
MEP2P41948 ALF1YNL148C 765 nt12.17□□□□□ -0.46
MEP2P41948 RKM5YLR137W 1104 nt12.13□□□□□ -0.47
MEP2P41948 PTP1YDL230W 1008 nt12.09□□□□□ -0.47
MEP2P41948 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
MEP2P41948 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.07□□□□□ -0.48
MEP2P41948 RPP2AYOL039W 321 nt12.07□□□□□ -0.48
MEP2P41948 SIS1YNL007C 1059 nt12.06□□□□□ -0.48
MEP2P41948 EMI2YDR516C 1503 nt12.01□□□□□ -0.49
MEP2P41948 CAC2YML102W 1407 nt12□□□□□ -0.49
MEP2P41948 YOR139CYOR139C 393 nt11.97□□□□□ -0.49
MEP2P41948 YOL037CYOL037C 354 nt11.95□□□□□ -0.5
MEP2P41948 YDL221WYDL221W 552 nt11.92□□□□□ -0.5
MEP2P41948 YMR090WYMR090W 684 nt11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms