RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	GTR2	P53290	341 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YGR219W	P53307	113 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	INM2	Q05533	292 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YPL257W	Q08974	193 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YKR045C	P36138	183 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MRX3	P38172	270 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RTT105	P40063	208 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	ATG39	Q06159	398 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.88	□□□□□ -2.27	not detected
YGL239C	YGL239C	MSW1	P04803	379 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MDH2	P22133	377 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	OAC1	P32332	324 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	ERV15	P38312	142 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	DSE2	P38844	325 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RMR1	P53060	241 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	NEJ1	Q06148	342 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YOL107W	Q12239	342 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	DCN1	Q12395	269 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	SIR4	P11978	1358 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YBR219C	P38317	127 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.86	□□□□□ -2.27	not detected
YGL239C	YGL239C	YKE4	P40544	346 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YIL001W	P40560	513 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YNL046W	P53956	172 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YCT1	Q12235	531 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MSF1	P08425	469 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	SNA3	P14359	133 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RIB7	P33312	244 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YHR180W	P38868	163 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YAR068W	P39564	161 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YER135C	P40082	130 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	ARR2	Q06597	130 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	HEM25	Q07534	307 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MSA1	Q08471	629 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YOR029W	Q12243	111 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RSR1	P13856	272 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	FCY2	P17064	533 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	AGE2	P40529	298 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	GPI8	P49018	411 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	CSM4	Q08955	156 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MSH5	Q12175	901 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	GLE2	P40066	365 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	CAT5	P41735	233 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YJR056C	P47115	236 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YJR079W	P47126	109 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YNR062C	P53748	327 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	BUD25	P85052	153 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	NUP49	Q02199	472 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	SML1	Q04964	104 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	SEI1	Q06058	285 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	CSI2	Q08054	341 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YLR126C	Q12288	251 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	FLO9	P39712	1322 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	UBR2	Q07963	1872 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	ERD2	P18414	219 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YGL010W	P25338	174 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YBR063C	P38083	404 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	AVT2	P39981	480 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	BNA6	P43619	295 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RPA43	P46669	326 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	ILM1	P47155	203 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RIB1	P38066	345 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YBR220C	P38318	560 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	TOS8	P53147	276 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	ERV29	P53337	310 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YML096W	Q04489	525 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RRT8	Q08219	342 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	CDC8	P00572	216 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YGL239C	YGL239C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.6 ms