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Protein–RNA interactions for Protein: P38844
DSE2, Protein DSE2, yeast
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325 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE2
P38844
NSR1
YGR159C
1245 nt
13.28
□□□□□ -0.28
DSE2
P38844
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
12.62
□□□□□ -0.39
DSE2
P38844
MDJ1
YFL016C
1536 nt
12.4
□□□□□ -0.42
DSE2
P38844
NOP1
YDL014W
984 nt
12.04
□□□□□ -0.48
DSE2
P38844
SSA3
YBL075C
1950 nt
11.58
□□□□□ -0.56
DSE2
P38844
YJL027C
YJL027C
417 nt
11.38
□□□□□ -0.59
DSE2
P38844
YBR190W
YBR190W
312 nt
10.84
□□□□□ -0.67
DSE2
P38844
DBP2
YNL112W
1641 nt
10.75
□□□□□ -0.69
DSE2
P38844
YKL036C
YKL036C
393 nt
10.68
□□□□□ -0.7
DSE2
P38844
SRX1
YKL086W
384 nt
10.53
□□□□□ -0.72
DSE2
P38844
RTC3
YHR087W
336 nt
10.45
□□□□□ -0.74
DSE2
P38844
PUT4
YOR348C
1884 nt
10.42
□□□□□ -0.74
DSE2
P38844
Q0297
Q0297
156 nt
10.38
□□□□□ -0.75
DSE2
P38844
SPT5
YML010W
3192 nt
10.15
□□□□□ -0.78
DSE2
P38844
SSA4
YER103W
1929 nt
10.08
□□□□□ -0.8
DSE2
P38844
ARE1
YCR048W
1833 nt
9.98
□□□□□ -0.81
DSE2
P38844
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
POA1
YBR022W
534 nt
9.96
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
YCR051W
YCR051W
669 nt
9.94
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
BSC6
YOL137W
1494 nt
9.91
□□□□□ -0.82
DSE2
P38844
RVS167
YDR388W
1449 nt
9.89
□□□□□ -0.83
DSE2
P38844
BDF1
YLR399C
2061 nt
9.82
□□□□□ -0.84
DSE2
P38844
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
9.81
□□□□□ -0.84
DSE2
P38844
CCC1
YLR220W
969 nt
9.73
□□□□□ -0.85
DSE2
P38844
SCJ1
YMR214W
1134 nt
9.7
□□□□□ -0.86
DSE2
P38844
SAH1
YER043C
1350 nt
9.69
□□□□□ -0.86
DSE2
P38844
TAT1
YBR069C
1860 nt
9.68
□□□□□ -0.86
DSE2
P38844
PAC11
YDR488C
1602 nt
9.65
□□□□□ -0.86
DSE2
P38844
URN1
YPR152C
1398 nt
9.63
□□□□□ -0.87
DSE2
P38844
OPI9
YLR338W
858 nt
9.63
□□□□□ -0.87
DSE2
P38844
NVJ2
YPR091C
2313 nt
9.51
□□□□□ -0.89
DSE2
P38844
BUD23
YCR047C
828 nt
9.48
□□□□□ -0.89
DSE2
P38844
SCS3
YGL126W
1143 nt
9.48
□□□□□ -0.89
DSE2
P38844
MEP2
YNL142W
1500 nt
9.41
□□□□□ -0.9
DSE2
P38844
SHR5
YOL110W
714 nt
9.41
□□□□□ -0.9
DSE2
P38844
YJL225C
YJL225C
5277 nt
9.37
□□□□□ -0.91
DSE2
P38844
PUN1
YLR414C
792 nt
9.33
□□□□□ -0.92
DSE2
P38844
NAB2
YGL122C
1578 nt
9.32
□□□□□ -0.92
DSE2
P38844
RPP1B
YDL130W
321 nt
9.31
□□□□□ -0.92
DSE2
P38844
PTC2
YER089C
1395 nt
9.3
□□□□□ -0.92
DSE2
P38844
DEP1
YAL013W
1218 nt
9.28
□□□□□ -0.92
DSE2
P38844
RPN10
YHR200W
807 nt
9.26
□□□□□ -0.93
DSE2
P38844
YOL085C
YOL085C
342 nt
9.26
□□□□□ -0.93
DSE2
P38844
YBR220C
YBR220C
1683 nt
9.21
□□□□□ -0.93
DSE2
P38844
DCW1
YKL046C
1350 nt
9.21
□□□□□ -0.94
DSE2
P38844
PKP1
YIL042C
1185 nt
9.18
□□□□□ -0.94
DSE2
P38844
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
9.16
□□□□□ -0.94
DSE2
P38844
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
9.15
□□□□□ -0.94
DSE2
P38844
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
9.15
□□□□□ -0.94
DSE2
P38844
YNL208W
YNL208W
600 nt
9.14
□□□□□ -0.95
DSE2
P38844
FIS1
YIL065C
468 nt
9.13
□□□□□ -0.95
DSE2
P38844
YJR018W
YJR018W
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9.08
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
EMI2
YDR516C
1503 nt
9.08
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
YMR090W
YMR090W
684 nt
9.07
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
YPS1
YLR120C
1710 nt
9.07
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
PCH2
YBR186W
1695 nt
9.07
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
GUT2
YIL155C
1950 nt
9.06
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
DAL1
YIR027C
1383 nt
9.05
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
FPS1
YLL043W
2010 nt
9.03
□□□□□ -0.96
DSE2
P38844
SDH1
YKL148C
1923 nt
9.01
□□□□□ -0.97
DSE2
P38844
SEC11
YIR022W
504 nt
8.99
□□□□□ -0.97
DSE2
P38844
YDL221W
YDL221W
552 nt
8.98
□□□□□ -0.97
DSE2
P38844
PHO4
YFR034C
939 nt
8.96
□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
PET122
YER153C
765 nt
8.95
□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
8.95
□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
PIB2
YGL023C
1908 nt
8.93
□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
YDJ1
YNL064C
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8.91
□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
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YDR095C
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8.9
□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
FPR4
YLR449W
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□□□□□ -0.98
DSE2
P38844
INM2
YDR287W
879 nt
8.88
□□□□□ -0.99
DSE2
P38844
UME6
YDR207C
2511 nt
8.85
□□□□□ -0.99
DSE2
P38844
YJR120W
YJR120W
351 nt
8.84
□□□□□ -0.99
DSE2
P38844
CAC2
YML102W
1407 nt
8.82
□□□□□ -1
DSE2
P38844
SCC4
YER147C
1875 nt
8.82
□□□□□ -1
DSE2
P38844
PTP1
YDL230W
1008 nt
8.79
□□□□□ -1
DSE2
P38844
RTF1
YGL244W
1677 nt
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□□□□□ -1.01
DSE2
P38844
SCR1
SCR1
522 nt
8.75
□□□□□ -1.01
DSE2
P38844
GAR1
YHR089C
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8.73
□□□□□ -1.01
DSE2
P38844
IRC15
YPL017C
1500 nt
8.71
□□□□□ -1.01
DSE2
P38844
RPP2A
YOL039W
321 nt
8.71
□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
RPP2B
YDR382W
333 nt
8.69
□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
YSC84
YHR016C
1407 nt
8.68
□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
PTK1
YKL198C
1989 nt
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□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
GIS3
YLR094C
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8.66
□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
YHL050C
YHL050C
2094 nt
8.66
□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
RRN5
YLR141W
1092 nt
8.65
□□□□□ -1.02
DSE2
P38844
BOR1
YNL275W
1731 nt
8.65
□□□□□ -1.03
DSE2
P38844
YBL100C
YBL100C
315 nt
8.64
□□□□□ -1.03
DSE2
P38844
BOP3
YNL042W
1191 nt
8.63
□□□□□ -1.03
DSE2
P38844
SSA1
YAL005C
1929 nt
8.57
□□□□□ -1.04
DSE2
P38844
FUN26
YAL022C
1554 nt
8.52
□□□□□ -1.04
DSE2
P38844
TIR1
YER011W
765 nt
8.51
□□□□□ -1.05
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