Protein–RNA interactions for Protein: P36138

YKR045C, Uncharacterized protein YKR045C, yeastyeast

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR045CP36138 NSR1YGR159C 1245 nt16.45■□□□□ 0.22
YKR045CP36138 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.44■□□□□ 0.22
YKR045CP36138 NOP1YDL014W 984 nt15.89■□□□□ 0.13
YKR045CP36138 MDJ1YFL016C 1536 nt14.76□□□□□ -0.05
YKR045CP36138 YKL036CYKL036C 393 nt14.57□□□□□ -0.08
YKR045CP36138 SRX1YKL086W 384 nt13.92□□□□□ -0.18
YKR045CP36138 Q0297Q0297 156 nt13.9□□□□□ -0.18
YKR045CP36138 YJL027CYJL027C 417 nt13.59□□□□□ -0.23
YKR045CP36138 YCR051WYCR051W 669 nt13.21□□□□□ -0.29
YKR045CP36138 SCS3YGL126W 1143 nt13.21□□□□□ -0.29
YKR045CP36138 DBP2YNL112W 1641 nt13.03□□□□□ -0.32
YKR045CP36138 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 YOL085CYOL085C 342 nt12.66□□□□□ -0.38
YKR045CP36138 YBR190WYBR190W 312 nt12.59□□□□□ -0.39
YKR045CP36138 CCC1YLR220W 969 nt12.58□□□□□ -0.4
YKR045CP36138 PKP1YIL042C 1185 nt12.51□□□□□ -0.41
YKR045CP36138 RPP1BYDL130W 321 nt12.48□□□□□ -0.41
YKR045CP36138 RTC3YHR087W 336 nt12.31□□□□□ -0.44
YKR045CP36138 RVS167YDR388W 1449 nt12.13□□□□□ -0.47
YKR045CP36138 SCJ1YMR214W 1134 nt12.11□□□□□ -0.47
YKR045CP36138 PET122YER153C 765 nt11.97□□□□□ -0.49
YKR045CP36138 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.95□□□□□ -0.5
YKR045CP36138 ATS1YAL020C 1002 nt11.79□□□□□ -0.52
YKR045CP36138 SCR1SCR1 522 nt11.74□□□□□ -0.53
YKR045CP36138 SHR5YOL110W 714 nt11.7□□□□□ -0.54
YKR045CP36138 RRN5YLR141W 1092 nt11.62□□□□□ -0.55
YKR045CP36138 PUT4YOR348C 1884 nt11.56□□□□□ -0.56
YKR045CP36138 YDJ1YNL064C 1230 nt11.54□□□□□ -0.56
YKR045CP36138 URN1YPR152C 1398 nt11.49□□□□□ -0.57
YKR045CP36138 DEP1YAL013W 1218 nt11.48□□□□□ -0.57
YKR045CP36138 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.38□□□□□ -0.59
YKR045CP36138 GAR1YHR089C 618 nt11.34□□□□□ -0.59
YKR045CP36138 SAH1YER043C 1350 nt11.33□□□□□ -0.6
YKR045CP36138 OPI9YLR338W 858 nt11.33□□□□□ -0.6
YKR045CP36138 ARE1YCR048W 1833 nt11.32□□□□□ -0.6
YKR045CP36138 RSB1YOR049C 1065 nt11.3□□□□□ -0.6
YKR045CP36138 YNL208WYNL208W 600 nt11.23□□□□□ -0.61
YKR045CP36138 RPN10YHR200W 807 nt11.22□□□□□ -0.61
YKR045CP36138 POA1YBR022W 534 nt11.21□□□□□ -0.61
YKR045CP36138 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.15□□□□□ -0.62
YKR045CP36138 SSA3YBL075C 1950 nt11.08□□□□□ -0.64
YKR045CP36138 PUN1YLR414C 792 nt10.97□□□□□ -0.65
YKR045CP36138 BSC6YOL137W 1494 nt10.97□□□□□ -0.65
YKR045CP36138 PST2YDR032C 597 nt10.96□□□□□ -0.65
YKR045CP36138 TIR1YER011W 765 nt10.95□□□□□ -0.66
YKR045CP36138 YJR018WYJR018W 363 nt10.94□□□□□ -0.66
YKR045CP36138 PTC2YER089C 1395 nt10.91□□□□□ -0.66
YKR045CP36138 BUD23YCR047C 828 nt10.89□□□□□ -0.67
YKR045CP36138 SSA1YAL005C 1929 nt10.88□□□□□ -0.67
YKR045CP36138 YJR120WYJR120W 351 nt10.79□□□□□ -0.68
YKR045CP36138 NAB2YGL122C 1578 nt10.76□□□□□ -0.69
YKR045CP36138 SRB2YHR041C 633 nt10.72□□□□□ -0.69
YKR045CP36138 RPP2BYDR382W 333 nt10.65□□□□□ -0.7
YKR045CP36138 FIS1YIL065C 468 nt10.6□□□□□ -0.71
YKR045CP36138 FPR4YLR449W 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR045CP36138 SPT5YML010W 3192 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR045CP36138 DAL1YIR027C 1383 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR045CP36138 INM2YDR287W 879 nt10.55□□□□□ -0.72
YKR045CP36138 SHU1YHL006C 453 nt10.55□□□□□ -0.72
YKR045CP36138 PHO4YFR034C 939 nt10.5□□□□□ -0.73
YKR045CP36138 WWM1YFL010C 636 nt10.48□□□□□ -0.73
YKR045CP36138 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.47□□□□□ -0.73
YKR045CP36138 BDH2YAL061W 1254 nt10.44□□□□□ -0.74
YKR045CP36138 YBL100CYBL100C 315 nt10.44□□□□□ -0.74
YKR045CP36138 YKL097CYKL097C 411 nt10.41□□□□□ -0.74
YKR045CP36138 YPS1YLR120C 1710 nt10.35□□□□□ -0.75
YKR045CP36138 FUN26YAL022C 1554 nt10.33□□□□□ -0.76
YKR045CP36138 HOM6YJR139C 1080 nt10.31□□□□□ -0.76
YKR045CP36138 MEP2YNL142W 1500 nt10.3□□□□□ -0.76
YKR045CP36138 YGR021WYGR021W 873 nt10.3□□□□□ -0.76
YKR045CP36138 LSM3YLR438C-A 270 nt10.27□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 TRM9YML014W 840 nt10.27□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 YDR095CYDR095C 411 nt10.25□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.25□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 MNP1YGL068W 585 nt10.25□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.23□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 SSA4YER103W 1929 nt10.22□□□□□ -0.77
YKR045CP36138 DCW1YKL046C 1350 nt10.18□□□□□ -0.78
YKR045CP36138 ALF1YNL148C 765 nt10.17□□□□□ -0.78
YKR045CP36138 CCT6YDR188W 1641 nt10.17□□□□□ -0.78
YKR045CP36138 RKM5YLR137W 1104 nt10.15□□□□□ -0.78
YKR045CP36138 PTP1YDL230W 1008 nt10.08□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 RPP2AYOL039W 321 nt10.07□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 YOR139CYOR139C 393 nt10.07□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.05□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.05□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 SIS1YNL007C 1059 nt10.05□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 CAC2YML102W 1407 nt10.04□□□□□ -0.8
YKR045CP36138 EMI2YDR516C 1503 nt10.01□□□□□ -0.81
YKR045CP36138 NPL3YDR432W 1245 nt9.96□□□□□ -0.82
YKR045CP36138 YOL037CYOL037C 354 nt9.96□□□□□ -0.82
YKR045CP36138 ART5YGR068C 1761 nt9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms